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Criblage virtuel et "docking"

Pour l'alignement j'arrive a le faire sur Pymol donc pas de probleme, mais merci quand meme. Le docking c'est la modelisation des interactions entre de petites molecules et une proteine cible. ca permet par exemple de trouver des drogues pouvant potentiellement bloquer l'activité d'une proteine car cette molecule se fixerait au site actif de la proteine.  [...] Le docking c'est la modelisation des interactions entre de petites molecules et une proteine cible. ca permet par exemple de trouver des drogues pouvant potentiellement bloquer l'activité d'une proteine car cette molecule se fixerait au site actif de la proteine.  [...]

[Biochimie] acide aminé séquence nucléotide

* les mutations faux-sens. Cette mutation ponctuelle se traduit par le changement d'un nucléotide par un autre. Dans certains cas, cette modification de nucléotide entraîne une modification de l'acide aminé codé. Le changement d'un acide aminé peut avoir ou non une répercussion en terme de fonction de la protéine produite par le gène, dans le cas d'un gène codant, ou d'une modification d'affinité pour un facteur de transcription, dans le cas d'une zone promotrice de l'ADN.  [...] Une protéine tronquée perd sa fonction si cette mutation tronque une région importante pour l'activité de la protéine (site actif pour une enzyme).  [...]

[Biochimie] Etude de la reconnaissance enzyme, substrat

- Sachant que certaines liaisons faibles dans une protéine dépendent des charges + ou - portées par les acides aminés, proposez une explication à l'importance du pH dans l'activité d'une enzyme.  [...] Cette structure est importante(site actif) pour la fonction de la protéine. Et donc dans un pH différent cette structure peut être modifiée ce qui peut rendre la protéine non fonctionnelle.  [...]

[synthèse des protéines] : les ARNt suppresseurs

Par exemple tu as un gene X qui devient inactif suite a l'apparition d'un codon stop UGA. ce codon stop provoque un arret precoce du ribosome et donc la protéine complete n'est pas fabriquée.  [...] Si le codon muté en stop, est le site actif de la protéine, il est en effet possible que la protéine re-synthétisée grace a l'ARNt sup ne soit pas active (bien qu'elle soit complete).  [...]

[Biologie Cellulaire] Traduction d'une protéine avec codon stop prématuré

J'étudie une protéine en culture cellulaire dont le gène est muté, aboutissant à un codon stop prématuré avant le site actif de cette enzyme.  [...] Or si je fais une immuno avec cet anticorps n'y a t il pas une risque que je détecte le fragment tronqué de ma protéine muté Sachant que le codon stop prématuré se situe au milieu du gène d'intérêt.  [...]

Les causes du cancer ? - Page 6

Une protéine qui voit un acide aminé remplacé par un autre et sa forme change, rendant son site actif invisible et donc elle est non fonctionnelle. Donc qui nous dit que nous n'avons pas tous un cancer en nous mais qui ne s'exprime pas soit parce que les défenses ont pris le dessus, soit parce qu'il n'a aucune incidence physiologique importante ou se développe très lentement.  [...] Il suffit d'un atome mal placé sur une molécule pour que la fonction initiale soit perturbée. Une protéine qui voit un acide aminé remplacé par un autre et sa forme change, rendant son site actif invisible et donc elle est non fonctionnelle. Donc qui nous dit que nous n'avons pas tous un cancer en nous mais qui ne s'exprime pas soit parce que les défenses ont pris le dessus, soit parce qu'il n'a aucune incidence physiologique importante ou se développe très lentement.  [...]

rapports entre structure et fonction

à l'échelle des protéines là tu peux parler des structures primaires (enchaînement d'acides aminés), secondaires, tertiaires et quaternaires que peut prendre une protéine (activation d'une protéine qui devient fonctionelle).  [...] autre cas. une enzyme est un protéine et elle est soumise à des phénomènes d'allostérie et de coopéritivité (régulation de l'activité enzymatique), site actif, relation enzyme-substrat etc.  [...]

[Génétique] L'ADN et la synthèse des protéines

Selon moi, si la séquence des paires de bases azotées est modifiée dans une molécule d'ADN, on n'obtiendra pas la même séquence d'acides aminés, donc ce ne sera pas la même protéine qui va être fabriquée. Alors, la pompe au Na+/K+ ne fonctionnera pas car la protéine qui joue se rôle ne sera plus la même. Est-ce que mon raisonnement est bon.  [...] Et pour votre deuxième question, il faut s'avoire que la succession d'acide aminés est bien organisé pour que ces derniers occupent des emplacements bien definis à fin d'assurer une conformation tertiaire de la proteine, cette succession détermine ainsi les acide aminés qui seront présent au niveau du site actif de la protéine.  [...]

site catalytique = site actif ???

dans mon cours on a différencié les deux, mais vu la rapidité d'élocution de mon prof j'ai voulu vérifié et sur internet j'ai trouvé site catalytique = site actif.  [...] salut, amis biologistes j'aimerais bien savoir une séquece d'une protéine qui constitue un site actif, je suis trés besoin dans mon pfe et merçi.  [...]

[Divers] aide révision questions diverses

Est-ce qu'une mutation au niveau d'un exon codant d'un gène peut entrainer l'accumulation d'une protéine destinée à la sécrétion au niveau de l'appareil de golgi ca voudrait dire que la mutation a fait que la protéine se produit sans arrêt mais comment.  [...] Pour qu'une protéine soit produite sans arrêt, il faut généralement une mutation sur le promoteur (ou sur le promoteur du facteur de transcription qui active sa transcription, etc...). Une mutation dans la séquence codante peut par contre en effet perturber les signaux d'adressage.  [...]