• Forum - Protéine, Domaines, ARN

RNP et ribosome

Mais la srp se fixe sur le ribosome par liaison GTP sur son site A et le ribosme est un ribonucléoproteine désolée je n'arrive pas à comprendre.  [...] Le SRP possède 6 polypeptides + de l'ARN c'est donc une ribonucléoprotéine (= association de protéines et d'ARN). Le polypeptide de 54 kDa de la SRP possède 2 domaines. un domaine M et un domaine NG. Le domaine M se lie à la séquence signal de la protéine en cours de formation ainsi qu'à l'ARNm.  [...]

[Biologie Moléculaire] Hybridation in situ

Le design de sonde n'est pas évident. Il vaut mieux ne pas prendre trop gros (500-800/1000 pb). Faire attention aux zones d'homologie. Donc bien étudier la protéine pour voir les domaines spécifiques et taper dans la région d'ARN correspondante.  [...] As-tu un schéma de ta construction car je dois savoir comment tu as orienté ton ADNc et ou se trouve tes promoteurs pour les ARN polymérase. Car ta sonde doit être antisens, pour pouvoir par la suite s'hybrider de façon complémentaire avec l'ARNm du gène que tu recherche.  [...]

les gènes candidats

Bonjour, je suis en master de biologie et mon prof de biologie moléculaire a voulu nous expliquer une approche dont je n'ai pas compris le but. Il dit que l'on part d'une protéine possedant des domaines spécifiques et que l'on cherche l'ARNm qui code pour cette protéine pour ensuite regarder si cet ARNm est exprimé dans certaines cellules (même si ce serait plus facile de voir si la protéine s'y trouve.  [...] Mais, ensuite pour retrouver le bon ARN, il dit qu'on l'hybride à haute stringence avec l'ARNm de la protéine Alors a quoi ca sert de chercher l'ARNm si on l'a déjà... C'est peut être celui d'une autre espèce... j'ai pas compris et il n'a rien expliqué de plus.  [...]

[Biologie Moléculaire] protéines

La protéine terminée présente un domaine N-terminal, un nombre impair de domaines transmembranaires et un domaine C-terminal cytosoliques.  [...] La protéine terminée présente un nombre pair de domaines transmembranaires. les domaines N- et C-terminaux sont cytosoliques.  [...]

Est-ce que tous les gènes codent des protéines

Oui tout les gènes ne codent pas des protéines comme c'est le cas pour les RNAt, RNAr, RNAi... mais tout les ARNm codent pour une protéine. Après pour le cas des RNA pol... ce sont bien des protéines (il faut bien qu'elles catalysent l'élongation de la chaine nucléotidique...).  [...] En d'autres termes, cela semble révéler un potentiel de modulation de l'expression des gènes beaucoup plus important chez les eucaryotes que dans les deux autres domaines du vivant, grâce justement à ces fameux brins d'ARN qui ne sont jamais traduits en protéines.  [...]

[Microbiologie] Passage dans le noyau de l'ADN ou ARN viral.

Enfin, des virion d'HIV dont l'integrase n'est plus fonctionnelle sont incapable de se repliquer, ni meme d'exprimer la moindre proteine virale indiquant que l'integration est une etape necessaire a la proliferation du virus. Une recherche de drogue inhibant l'activite de l'integrase est un domaine de recherche actif.  [...] Argument. on connait des virus ARN de bactéries et de pratiquement tout les organismes eucaryotes y compris unicellulaire. L'existence des virus ARN est donc ancienne, sans doute antérieure à la divergence des 3 domaines du vivant.  [...]

[Biochimie] Inhibiteurs d'enzymes

Je cherche à inhiber une protéine par différents moyens. En fait ej cherche à utiliser différents inhibiteurs qui vont cibler différents domaines de cette protéine (ex. un inhibiteur contre le domaine catalytique, un autre contre le domaine de liaison,...).  [...] J'avais pensé à la cristallographie qui eput en effets permettre de connaître les différents domaines d'une protéine. Mais je ne sais pas si c'est possible de faire cela avec une interaction inhibiteur/protéine.  [...]

[Génétique] Polymorphisme du gène codant pour l'IGF2BP2

L'IMP2 fait partie d'une famille de trois protéines liantes l'ARN messager (IMP1, IMP2 et IMP3). La protéine se lie aux régions 5' UTR des ARNs messagers du facteur de transcription IGF2 afin de réguler son expression. L'IMP2 est constituée de 599 acides aminés et a un poids moléculaire (PM) de 66Kda.  [...] Elle comprend 6 régions de liaison à l'ARN, deux domaines vers l'extrémité N-terminale qui sont des motifs de reconnaissance de l'ARN (RRM 1 et 2. RNA Recognition Motifs) et quatre autres domaines au centre et à l'extrémité C-terminale, appelés hnRNP [(particules ribonucléoprotéiques)] k-homology.  [...]

[Biochimie] Vecteur d'expression pour une proteine recombinante

On veut donc fabriquer cette proteine de fusion qui est composé de deux domaines correspondant chacun a l'une des deux proteines d'interet et reliés entre eux par une liaison peptidique. Si elle se replie bien alors la proteine exprimera les deux propriétés (cool ).  [...] Ca dépend. Vu que tu fais une protéine de fusion, tu ne peux exclure que le domaine GFP ne gêne la protéine d'intérêt (par encombrement par exemple). Dans ce cas tu peux essayer les deux types de construction, voire insérer un linker entre les deux domaines afin de les espacer un peu.  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

Pour rappel, cette classification s'intéresse aux domaines, touchant à la structure tridimensionnelle des protéines. Les domaines sont les constituants semi-indépendants de la structure 3D globale d'une protéine. Dans la classifications SCOP, les protéines sont subdivisées 7 grandes classes.  [...] Ensuite, chaque protéine est subdivisée en ces domaines qui sont ensuite eux-mêmes classés en familles, celles-ci en superfamilles, ces dernières en repliements ( folds ).  [...]