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[Biochimie] Poids moléculaire

Lors ce que j'ai fais migrer mes protéines sur un gel dénaturant SDS Page, j'observe une différence entre le poids moléculaire apparent et le poids moléculaire théorique que j'ai calculé. A quoi cela peut être du.  [...] C'est une protéine exprimée sous forme de proteine de fusion dans une bactérie, E.Coli, qu'on a cherché à purifié et à verifier la qualité de la purification par gel SDS Page. Donc est ce qu'on peut parler de modifications post- transcriptionnelles telle que la glycosylation.  [...]

Sds Page

Le SDS permet de justement ne pas tenir compte de la forme d'une protéine. En gros, quelque soit la forme d'une protéine, celle ci se déplace dans un gel de la même façon qu'une sphère de rayon hypothétique Rs, le rayon de Stoke.  [...] Ainsi, tout les protéine adopteront une forme de batonnet...dont la longueur dépendra de la séquence primaire de la protéine, assimilable donc au poids moléculaire.  [...]

[Biochimie] technique PAGE non dénaturante

Bonsoir tout le monde, j'aimerais bien connaitre le principe de la technique de séparation des proteines PAGE en condition non dénaturante et quel est la différence entre PAGE et SDS page et utilités.  [...] PAGE en conditions dénaturantes. les protéines sont traitées de façon à les délier et à séparer d'éventuelles sous-unités. On détruit donc leur structure tridimensionnelle. La forme de la protéine n'intervenant plus dans la migration, celle-ci se fait uniquement sur la base de la masse de la molécule. L'interprétation est généralement plus simple.  [...]

[Génétique] Wanted: séquence complète du génome humain.

J'aurai aimé savoir si une liste complète des gènes existe réellement et si elle est consultable (sur internet ou sur papier). Je suis aussi intéressé de savoir quelles sont les acides aminés ==. protéines codées par chaque gène, voir même, la liste des protéines plus complexes fabriquées par plusieurs gènes.  [...] Pour vous donner une idée, le génome humain est composé grosso modo de 25 000 gènes. 1 gène une page 25 000 pages. Si on ajoute les différentes protéines, leurs rôles et leurs principales interactions, juste listées sans plus de mise en forme... Je n'ose même pas imaginer.  [...]

[Biochimie] Isolement des protéines du périplasme de Bactéries + Test d'activité spé d'une protéine en SDS-PAGE

Pour isoler le périplasme et prouver que cette protéine est dedans ils utilisent deux techniques qu'ils disent complémentaires.  [...] Alors ce que je ne comprend pas c'est comment à partir d'une choc hypo-osmotique on peut isoler uniquement le périplasme dans les sphéroplaste qui sont sensés se former. Car il montrent par la suite que dans leur préparation de périplasme il n'y a aucune contamination du cytoplasme En gros comment ce choc hypo-osmotique ou le traitement au lysozymes peuvent t ils permettre d'isoler ce tout petit espace intermembranaire sans contamination du milieu de culture ou du cytoplasme.  [...]

[Biochimie] purification poids moléculaire

bonjour. Je puriife une protéine, mais c'est étrange, car même purifiée, en gel filtration j'ai 2 pics (l'un à env 300kDa, l'autre à env 185kDa). Pour les 2 pics j'ai aussi 2 bandes en SDS-PAGE. J'ai un peu de mal à l'interprêter je dois dire.  [...] Mais je propose, et j'attends vos commentaires, que les 2 bandes en SDS-PAGE soient en fait la même protéine avec un légère différence (post-traductionnelle), et donc j'aurais un homotétramère.  [...]

Déterminer état de dimérisation d'une protéine

J'ai fini de bosser sur ce projet mais j'en commence un nouveau sur une protéine qui forme des dimères de dimères donc ça reste interessant.  [...] Berzelius. La seule façon que je vois pour créer des liens covalents c'est des mutants de surface type cystéine pour justement former des ponts disulfures. A part ça je ne vois pas trop. Mais au final, même si on a une idée des interactions ça ne permet pas de déterminer l'état d'oligomérisation de la protéine, si.  [...]

[Evolution] Reptiles ou sauropsides ? Quelques éclaircissements !

=. Le Code International de Nomenclature Zoologique est accessible librement en ligne, en anglais, sous forme de page web. [J'en possède également un pdf en anglais et un autre en français, pour qui est intéressé].  [...] L'apparition de la cladistique a profondément modifié la taxonomie depuis les années 60, surtout à partir des années 80. Cette méthodologie proposée par l'entomologiste allemand Willi Hennig a permis de mathématiser l'analyse des parentés des taxons étudiés - autrement dit, une analyse phylogénétique - et de les représenter sous forme d' arbres dichotomiques.  [...]

[Biochimie] solubilité protéine, un beau SDS-PAGE

Comme c'est un premier test, je me suis placé dans des conditions classique de mon labo concernant l'induction. J'ai attendu d'être dans une DO600 de 0.6-0.8 pour induire à l'IPTG (4h). J'ai récolté les surnageants et culots juste avec l'induction à l'IPTG, et après 4h.   [...] Tout simplement tu lyses tes bactéries au sonicateur, tu doses les protéines du lysat et ainsi tu peux déposer à quantité égale en protéines.  [...]

[Divers] Chromosomes

Au cours de la division chaque cellule fille reçoit sa page de photocopie qui a alors la forme d'un I. On en revient donc à la forme de départ.  [...] Alors la cellule va attacher deux batons ensemble comme ça lors de la division, ça sera facile de départager. Le chromosome aura la forme d'un X(n°1).2 batons identiques reliés par le centromère avant la division. C'est la forme que tu dois dessiner avant la division.  [...]