• Forum - Mécanisme, Critères, Séquences

[Génétique] chevauchement séquences

Mon application doit donc pouvoir charger le fichier, le lire les données (séquence nucléotidiques) et faire des chevauchements puis fusionner pour avoir des contig.  [...] Problème. je n'arrive pas à comprendre le mécanisme d'un chevauchement Sous quels critères on détecte les séquences où il y a chevauchement.  [...]

[Biologie Moléculaire] shRNA

Tout d'abord as-tu regardé s'il existe des séquences siRNA qui ont déjà été utilisées et qui seraient publiées contre ce gène Cela peut t'éviter de tester des séquences maison qui ne marcheront pas à tous les coups.  [...] Sinon je sais qu'il existe des programmes en ligne qui te proposent en fonction de la séquence de ton ARNm des séquences siRNA en tenant compte de tout un nombre de critères mais malheureusement je n'ai pas en mémoire lesquels... Dans ce cas il faut que tu testes 3 séquences différentes contre ta cible pour t'assurer que l'une au moins va fonctionner.  [...]

[Génétique] Fougere et chromosomes ...

[On peut continuer sur les critères pour mesurer un génome, parler du nombre de séquences codant des protéines, par exemple, mais je ne vais pas aller plus loin dans ce message.].  [...] Ce mécanisme de duplication/différentiation semble assez commun dans l'histoire des lignées du vivant. Alors, peut-on dire que la redondance originelle ne sert à rien Oui dans un premier temps, et elle peut être même un fardeau, peut-être que non à long terme.  [...]

ARN double-brins

POur les developpement therapeutique contre les virus, l'idee est de ciblee grace a ces petits ARN des sequences des ARN viraux afin de les inactives. Des resultats recents publies dans PNAS montrent par exemple qu'il est possible d'empecher la replication du virus de l'hepatite C de cette maniere.  [...] J'avais assiste a un seminaire ou une boite vendant des oligos avait developpe un logiciel pour determiner les sequences les plus susceptibles de fonctionner. Selon eux, leur prediction etait fiable a 95%. Seulement, c'etait une boite et pas moyen de connaitre les criteres de choix.  [...]

[Biologie Cellulaire] Cancer : bénéfique à l'espéce

Est il possible que les mécanismes génétiques qui servent pendant le développement des différents type de cancer soit préexistant dans l'ADN, en quelque sorte, comme une sorte de mécanisme de mort programmé latente, qui se déclencherait selon des critères tel que l'interaction entre l'environnement et l'individu, parasitisme, consommation de drogue etc, etc.  [...] En simplifiant il s'agit bien de mécanismes qui préexistent dans la cellule, au moins de façon potentielle, mais qui se mettent à dérailler pour des raisons diverses, la plupart de temps à la suite d'altérations accidentelle de l'ADN (mutations somatiques) ou de mutations transmissibles prédisposant à certains déraillements, ou encore comme conséquence de l'action de certains mécanismes épigénétiques.  [...]

[Génétique] "Gene monogenetique"

je viens ici vous demander si vous pouviez me donner un maximum d' exemple de genes chez les plantes qui n'appartiennent pas a une famille multigenique (aussi bien dans les genes dits de menage que d'autres genes répendus dans divers procesus vegetaux). On me demande de comparer differents genes et differents mRNA au niveau sequences nucleotidiques mais je dois me concentrer sur des genes presents en un seul exemplaire (ou ayant fait l'objet d'une seule duplication) dans le genome des plantes afin de faciliter le travail mais pour etre franc au sein de l' ADN genomique j'ai pas trouvé beaucoup d'exemple correspondant a ces critères, en effet la majorite des genes monogeniques que j'ai trouvé sont soit mitochondriaux soit chloroplastiques.  [...] Je vous remercie d'avance de toute aide que vous pourriez me fournir.   [...]

5 grands groupes humains

En revanche, il ne faut pas perdre de vue que dans les méthodes de classification on fait des choix sur les critères servant à cette classification dans ce cas, il semble que les séquences choisies se sont faite par hazard mais sans a priori.  [...] Non je parlais simplement de séquencer les ARNr18s d'un échantillon représentatif de différentes populations, de comparer les séquences, de tracer l'arbre phylogénétique et de voir ce qu'il en ressort. Je ne sais pas si ça a déjà été fait où si c'est impossible pour des raisons d'éthiques (ou inutile comme tu le dis car pas assez de polymorphisme à ce niveau).  [...]

[Biochimie] PCR / sanger / amorces / séquences /

Tu peux trouver ces critères sur internet, mais je pense que ta séquence est bien trop courte pour pouvoir faire du design de primers.  [...] Et les amorces ne sont pas les 20 premieres car sur ta feuille d'exercice il y a un debut et une fin a ta sequence mais en vrai on parle d'une sequence chromosomique donc le debut de ta sequence sur la feuille n'est pas un vrai debut, c'est juste qu'on va pas te mettre toutes les bases du chromosomes donc debut et fin non pas de sens ici donc les 20 premieres exactement ca ne représente rien, tu ne dois donc pas choisir les 20 premieres mais 20 qui correspondes au critères que je t'ai cité plus haut.  [...]

taille du génome.

L'inverse est encore plus vrai, la proportion d'ORF (détectées sur critères de séquence uniquement) qui produisent un ARN est relativement faible.  [...] AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA AG....). Ca ne veut pas dire que ça ne sert à rien, peut-être que ça un rôle dans la structuration des chromosomes par exemple mais il serait surprenant que ces séquences jouent un rôle une fois transcrites et à fortiori traduites.  [...]

Grippe Mexicaine (grippe A-H1N1), vos questions. - Page 8

Je voulais regarder la norme EN149 de plus près pour en savoir plus sur les critères de résistance mécanique / à la désinfection... mais c'est AFNOR donc pas gratuit. soupir.  [...] emballement du systeme immunitaire a un sens très large... en l'occurence les mécanismes de l'allergie et de la grippe n'ont pas grand chose a voir, et n'utilisent pas du tout les mêmes mécanismes.  [...]