• Forum - Liaison, Enzyme, Substrat

[Biochimie] Site catalytique et site de reconnaissance d'une enzyme

Logiquement ces deux sites ne peuvent être totalement distincts (il faut bien êtré lié au substrat pour catalyser la réaction) mais j'aimerais savoir s'ils sont simpement confondus ou si l'un est inclu dans l'autre. Est-ce que quelqu'un saurait éclairer ma lanterne.  [...] Autre chose. la liaison enzyme/substrat est bien une liaison faible.  [...]

Inhibiteur compétitif

Tout comme la liaison du substrat à l'enzyme, la liaison de l'inhibiteur compétitif est réversible. Celui-ci, en se fixant à l'enzyme au niveau du site actif (site liant le substrat) réduit par conséquent son activité par compétition avec le substrat. Toutefois, l'enzyme peut atteindre sa vitesse maximale d'activité enzymatique si l'on augmente la concentration en substrat.  [...] Pour répondre à ta question, l'inhibiteur compétitif inhibe toujours l'activité enzymatique, bien qu'en présence de substrat celle-ci existe toujours (même si parfois très faible).  [...]

comment agit l ATP??

Ce sont les liasons entre les divers groupements phosphates transportés par l'adénosine de l'ATP qui sont qualifiées de riche en énergie. C'est la liaison avec le troisième phosphate qui libère le plus d'énergie. Des renseignements.  [...] 1) Une enzyme se lie à son substrat et de fait change de conformation. un deuxième site de liaison spécifique à l'ATP devient ainsi accessible.  [...]

[Biochimie] glycolyse et potentiel redox

Son substrat est le 3-phosphoglycéraldéhyde, et son coenzyme libre le NAD oxydé. Le mécanisme est de type bibi ordonné. Le complexe enzyme-substrat se forme grâce à une liaison covalente entre la fonction thiol d'une cystéine de l'enzyme et la fonction aldéhyde du substrat.  [...] On appelle acyl-enzymes les complexes enzyme-substrat liés par des liaisons covalentes. A cause de cette addition, l'état d'oxydation du carbone 1 du phosphoglycéraldéhyde est passé du niveau aldéhyde au niveau alcool secondaire, dont le potentiel d'oxydoréduction est plus élevé.  [...]

le fameux complexe enzyme-substrat

Bonjour a tous, j'ai une petite question. Voilà un prof m'a parlé de l'ajustement induit qui servait a fournir de l'énergie au substrat ce qui permettait d'abaisser l'énergie d'activation nécéssaire à la réaction mais je ne vois pas exactement comment ça se passe.  [...] Certaines associations enzymes + substrat se font par induction ( induced fit ), c'est-à-dire que le substrat modifie légèrement la conformation de l'enzyme (les enzymes s'avèrent plus flexibles qu'on ne le pensait) en s'y liant. Les deux sites de liaison ne sont donc complémentaires qu'après que le substrat est lié à l'enzyme.  [...]

DNAses, pourquoi spécifique aux ADN?

Et dans la formation du complexe enzyme-substrat, il n'y a pas que la structure du site ou se déroule la réaction qui compte (ici la liaison PDE), dans notre exemple la seule présence du groupe hydroxy sur le ribose peut faire la différence.  [...] Comme les jouets pour enfants ou on ne peut pas mettre le carré dans le trou rond, sauf que c'est à un niveau bien plus fin.   [...]

Béta oxydation des AG polyinsaturés

ensuite apparement il y a l'action d'une isomérase qui le transforme en C12. 2 (2,6). bon là on peut continuer la béta oxydation, et on se retrouve avec un C10. 1 (4), jusque là pas de problème mais après ca devient assez flou. Dans mon cours, on crée une insaturation en 2, ce qui donne un C10.   [...] En fait l'enzyme dont c'est le tour à l'étape c.10 (2,4), soit la crotonase, qui ne peut accepter comme substrat les deux doubles liaisons conjuguées, donc pour que la dégradation se poursuive il va falloir faire en sorte d'obtenir une double liaison en 2, d'où ce tour de passe-passe enzymatique.  [...]

[Biochimie] la lipogénèse

C'est juste une réaction de transfert de groupement carboxyle (carboxylation). Une enzyme transcarboxylase agence un groupement carboxyle sur une molécule, ici une molécule d'acétate ( activée par la coenzyme A, par une liaison thioester). l'enzyme transcarboxylase, pour pouvoir agencer le groupement carboxyle, doit alors être chargée par du CO2 - c'est à dire qu'elle doit disposer en réserve d'un CO2 qu'elle est prêt à céder à son substrat.  [...] Ici, biotine est un groupement prosthétique de l'enzyme. Ce groupement reste toujours associé à l'enzyme et lui confère son activitée de transcarboxylation, en agissant comme accepteur de CO2. Lorsque l'enzyme s'est déchargée de son CO2, elle n'en dispose plus (Enz-biotine), et doit alors se recharger pour pouvoir à nouveau effectuer une réaction de transcarboxylation.  [...]

[Génétique] Groupe sanguin et parentalité

Maintenant si Pili a hérité elle aussi du génotype 1F/1NF, son couple aura 1 chance sur 4 d'engendrer un enfant ayant le génotype 1NF/1NF, et le groupe sanguin O. Mais ce groupe est tellement répandu qu'il n'est même pas sûr qu'on s'en aperçoive.   [...] Oui... mais un peu moins bon en médecine. Les personnes qui ont un phénotype Bombay le savent ainsi que leur médecin. Elles ne sont pas lâchées comme ça dans la nature. elles sont bien informées sur leur groupe particulier et elles ont des cartes de groupe bien particulières (cf transfusion à risque).   [...]

[Biochimie] Problème de compréhension de la catalyse enzymatique

- J'ai lu que l'abaissement d'énergie d'activation était due aux tensions induites par le léger changement conformationnel au moment de la liaison substrat-enzyme qui rapprochait le substrat de son état de transition, donc le fait que l'énergie d'activation baisse serait du au fait que c'est l'enzyme qui a fournit cette différence d'énergie de part ses changements structuraux.  [...] Grâce au concours de plusieurs acides aminés et/ou cofacteurs, l'enzyme conditionne le substrat pour que la réaction se fasse de manière optimale. Pour que cela soit possible spontanément, il faut élever la température pour augmenter l'agitation thermique (Brownienne) pour augmenter le nombre d'interactions avec les molécules adéquates.  [...]