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[Biochimie] Sequençage de l'ADN

Une autre astuce de la technique est que l'ADN à séquencé est clivé en petits fragments (une vingtaine de pb) qui vont être chacun fixés sur une plaque couverte de séquences fixant les séquences adaptatrices. Arpès amplification on a donc des spots sur la plaque formés par les amplicons issu d'un brin initial.  [...] Ce sont ces clones (si l'on peut dire) qui permettent de générer un spot de fluorescence qui sera détecté à chaque étape de polymération. Cette stratégie permet de séquencer en parallèle plusieurs régions de l'ADN. Ensuite, une fois tous les fragments séquencés, on reconstitue le brin d'ADN initial par informatique.  [...]

[Divers] Fac de Sciences, les débouchés.

Concernant la génétique et la bio mol, si tu aimes l'informatique, un master en bio-informatique pour être bio-informatien pour le traitement des bases de données des séquences d'ADN ou protéine pourra te convernir aussi.  [...] De plus certains domaines qui à priori ne me plaisait pas sont devenus ma passion et vice versa. J'adore l'informatique mais la bio-informatique... beaucoup moins.  [...]

[Biotechnologie] Biotechnologies....

Il y a aussi un gros travail de rédaction d'articles (logique puisque c'est l'aboutissement normal des recherches). Il peut y avoir aussi du travail sur ordinateur (les personnes qui font du séquençage utilisent des programmes pour aligner les séquences d'ADN, on utilise aussi pas mal l'informatique pour faire de la phylogénie.  [...] Dans le stage de biologie moléculaire que j'ai fait entre mon DEUG et ma licence, on cherchait la position d'un virus/gène intégré dans l'ADN d'un insecte. La technique était exactement identique à celle utilisée pour rechercher la position d'un gène chez l'homme (amorces dégénérées crées à partir de la protéine isolée, création d'une banque d'ADN dans des phages, criblage de banque, séquençage...).  [...]

Programme de bio-informatique

Je cherche sur le net un programme bio-informatique qui regrouperais plusieurs programme d'analyse de séquences ADN et protéiques comme NIX anciens programme de HGMP qui pouvait traiter un contig.  [...] Mais si tu nous precise quelles informations tu souhaites obtenir sur tes séquences, on pourra peut-être te guider dans le choix des outils à utiliser.  [...]

[Biotechnologie] Fabrication d'une protéine d'intérêt ?

- d'abord par bio-informatique, on choisi la séquence de gène qui code la protéine qu'on veut et on fait un ADN complémentaire qui est obtenue par une transcriptase inverse faite à partir de l'ARN (au lieu de faire ADN transcrit en ARN, on démarre de l'ARN qui est transcrit en ADN).  [...] Bien que le code génétique soit universel, certains codons sont utilisé de manière préférentielle d'un organisme à l'autre tu pourras voir si ta séquence est compatible avec ton organisme sur ce site (en choisissant une valeur d'utilisation).  [...]

définition d'une séquence en biologie

Le mot séquence peut faire référence à séquence protéique, séquence d'ADN (entendez séquence des bases d'ADN puriques ou pyrimidines), séquence d'ARN (l'uracile remplace la thymine dans le séquençage), ou alors séquence au niveau d'un fichier texte contenant la séquence d'une molécule biologique (branche de la bio-informatique).  [...] Merci pour vos réponses je voulais savoir une dernière chose. que se passe t-il pour la séquence du brin droit de l'ADN En quoi elle est différente de l'autre brin.  [...]

Gènes artificiels

à ma connaissance, il existe des machines capables de synthétiser des courtes séquences d'ADN, de quelques dizaines de base. On peut ensuite grâce à des techniques de génie génétique insérer ces séquences en de slieux précis du génome d'une levure. Avec les techniques actuelles il doit être faisable (mais pas facile) de réalise rà peu près ce que l'on veut en terme de molécule d'ADN résultat (mais les biochimistes du forum répondront plus exactement).  [...] Ceci dit, c'est un peu comme en informatique être en mesure de changer un morceau de séquence binaire dans un fichier exécutable. Le rôle précis de chaque séquence d'ADN est loin d'être complètement compris, et la complexité dépasse de loin la seul traduction en protéines.  [...]

Petites questions de biologie !

Mais une mutation dans un intron peut avoir des conséquences gravissimes si elle se produit au niveau des sites d'épissage dans les régions 5' et 3' de l'intron... et donc ne pas être silencieuse. Si les sites sont endomagés, il peut ne pas y avoir d'épissage et on peut éventuellement (c'est un exemple) incorporer un intron dans lequel se trouve un STOP.  [...] In silico. là c'est un peu différent. On l'utilise pour montrer qu'on se sert de l'outil informatique pour réaliser quelque chose ( in silico se rapportant au silicium des microprocesseurs des puces informatiques). Ainsi, on peut dire que l'on procède, in silico, à la comparaison d'une séquence d'ADN inconnu avec des milliers d'autre.  [...]

[Identification] Comment isoler des bactéries non cultivables ?

Ensuite je clonerai ses séquences non encore observée afin de pouvoir les amplifier par PCR puis de les séquencer et les anaylser par Blast.  [...] les 1er analyses de métagénome réalisés par PCR, en consisté à explorer la diversité des séquences ADN r extrait des communauté microbienne.  [...]

[Biologie Cellulaire] genome

Cela votre cours explique cela de maniere assez débile, l'Homme étant diploïde, je ne vois pas l'intéret d'ajouter un facteur de complication de la chose... Enfin bref.   [...] Si on peut le savoir. On connait ces séquences, il suffit donc de regarder (par informatique) combien de fois elles sont présentes dans le génome (séquencé) d'intérêt.  [...]