• Forum - Groupement, Phosphate, Réserve, énergie, Synthèse, ADN

[Biologie Moléculaire] la molecule d'ADN

SVP, pourquoi le reste nucléotidique de l'extrémité 5' porte-t-il un groupement triphosphoryl.  [...] Les questions en pourquoi sont toujours un peu délicates en biologie mais en gros ce groupement phosphate est une réserve d'énergie qui est utilisé pendant la synthèse d'un brin ADN. tous les nucléotides en ont un et le perdent quand ils s'assemblent sauf le dernier du brin à gauche, en 5'.  [...]

Respiration cellulaire

Dans la phosphorylation, le rôle de l'ATP est double. il apporte le groupement phosphate P (ATP=ADP+P) mais apporte également l'énergie à la synthèse de la nouvelle liaison (sérine-P, par exemple).  [...] Citons enfin un exemple qui ne nécessite pas d'ATP. la synthèse de l'ATP (trop facile ). Pour synthétiser de l'ATP il faut de l'ADP, du phosphate et de l'énergie (impossible de former une liaison covalente sans source d'énergie). Ici, on est dans un cas un peu particulier de couplage mécano-chimique.  [...]

[Biologie Moléculaire] Inhibiteurs nucléosidique et nucléotidique

- les nucléosidiques + nucléotidiques analogues d'une part. ils s'incorporent dans l'ADN néo-synthétisé. en fait, le nucléosidique est transformé en nucléotide par l'ajout d'un groupement phosphate =. production d'un analogue qui peut être utilisé dans la synthèse en cours de l'ADN viral. But. empêcher l'élongation.  [...] - les non-nucléosidiques inhibiteurs de la RT d'autre part. agissent directement sur la RT (ils s'y lient et l'empêchent de fonctionner). But. l'empêcher de travailler.   [...]

[Biochimie] Réactions endothermiques et exothermiques

Voilà. La formation d'une liaison est un processus exothermique (delta G négatif) et sa rupture est endothermique (delta G positif).   [...] De plus, j'avais appris pour la transcription de l'ADN en ARN messager que l'énergie nécessaire pour la polymérisation des nucléotides en ARN provenait de la déphosphorylations des nucléotides, ce qui voudrait dire que la rupture de la liaison qui relie le groupement phosphate à la base azotée est exergonique donc exothermique (si je ne me trompe pas ^^).  [...]

[Biochimie] ADN: pKa du groupement phosphate, acidité etc.

Première question. On dit que les acides nucléiques ont un caractère acide, je peux le concevoir puisque l'acide phosphorique est un donneur de protons, or au pH physiologique, ce dernier va laisser partir ses protons. Donc l'ADN devient basique. J'aimerais savoir si je divague ou si c'est correct.  [...] Deuxième question. N'oublie pas que dans l'ADN deux fonction -OH du phosphate font une liaison ester (neutre) avec les sucres. Donc au final on a qu'une seul charge négative dans notre polynucléotide sauf au niveau des extrémités ou on a deux charges négatives.  [...]

[Biochimie] phosphorylation

Oui j'ai compris que le NADH servait à générer un gradient électrochimique, mais est-ce que l' ATP qu'on déphosphoryle provient du cycle de Krebs.  [...] Parce que j'ai pas vraiment compris cette étape... la phosphorylation c'est mettre un groupement phosphate ou l'enlever pour faire de l'énergie Ou est-ce que la phosphorylation mets un groupement phosphate et c'est une autre réaction qui suit qui va enlevé ce groupement pour faire de l'énergie.  [...]

Le virus à la limite du vivant

La glycolyse (le seul métabolisme énergétique en absence d'oxygène) n'est pas une respiration. la phosphorylation de l'ADP est dite liée au substrat, elle se fait directement par transfert de groupement phosphate, contrairement à la respiration qui couple la synthèse d'ATP aux réoxydations de cosubstrats via un gradient de H+.  [...] En tous cas, voire les choses comme ça rend les choses plus claires dans ma tête parce que ça explique comment les êtres vivants ont pu trouver l'énergie avant l'apparition de la photosynthèse qui est horriblement dure à réaliser.  [...]

[Biologie Moléculaire] Replication de l'adn?

2°/ Le PPi, c'est le groupement Pyrophosphate qui est libérée suite à l'hydrolyse de la liaison phosphodiester, réaction qui libère l'énergie nécessaire à l'élongation de la chaîne ADN.  [...] Ce que vous appelez un désoxyribonucléo t ide triphosphate serait en quelque sorte, au sens général du terme, un pléonasme.  [...]

débrifing sur l'ADN.

la molécule d'ADN est hydrophyle car elle possède des charge négatif, donc elle est charger négativement. c'est vrai ces charges la déstabilise un peu.les charges négatif sont du au groupement phosphate présent sur les nucléotide. (lorsqu'on dit groupement phosphate ce sont des groupement acide phosphatidique HPO4 (2-)).  [...] Le nucléosome est stable car il est constitué d'histones basiques dont la charge positive permet une interaction forte avec les groupement phosphates de l'ADN double brin, c'est cela J'avais lu quelque part que les liaisons hydrogènes intervenaient, est ce possible.  [...]

Manipulation des acides nucléiques

- La phosphodiesterase, je n'ai pas d'info sur cette enzyme, je me doute qu'elle coupe la liaison phosphodiester, mais j'ignore si c'est en amont ou en aval du phosphate.  [...] Enfin, la polynucléotide kinase est une enzyme capable de phosphoryler des extrémités 5' libres, ou préalablement déphosphorylées via l'action d'une phosphatase.  [...]