• Forum - Génome, Parasites, Amorces

[Biochimie] (licence/master) Question sur la pcr pour un rapport de stage, merci

C'est une PCR qui permet d'étudier la variabilité d'un gène. On utilise des amorces ciblant un gène homologue sur les différentes espèces puis on utilise une enzyme de restriction puis on compare le profil sur gel. C'est une méthode plus longue que les autres PCR.  [...] La méthode multiplex- en temps réel est la méthode la plus rapide aujourd'hui. On connaît le génome des parasites donc on peut utilise des amorces spécifiques. Elle permet d'avoir les résultats plus rapidement interprétables. L'inconvénient est que la sensibilité et la spécificité sont plus faibles que pour les autres techniques.  [...]

[Biologie Moléculaire] PCR en temps réel

En fait, je voulais tester deux amorces différentes pour deux espèces de parasites appartenant à la même famille.  [...] Donc je voulais tester les amorces de deux espèces sur une même échantillon ( vu que c'est la même parasite donc la même maladie).  [...]

[Biochimie] La PCR et ses petis bugs

On pense donc à une DNAse, ou à une réaction parasites entre amorces. Cependant ces réaction marchait parfaitement il y a de ça 6 mois.  [...] Je ne sais pas si tes amorces sont parfaites mais, si elle sont dégénéré cela peu tout simplement venir du fabriquant. En effet quand tu commandes des amorces dégénéré les proportions d'une base sur un autre varie grandement (tu peux commander deux fois la meme amorces, tu n'aura pas exactement la meme soltuion).  [...]

taille du génome. - Page 2

Si les batracien ont un plus long génome que bien des mammifères, c'est peut-être d'une part parce qu'ils sont ectothermes. Je serais curieuse de connaître la longueur du génome de la seule chèvre à sang froid connue vis à vis de ses cousine A contrario, les plus petits génomes connus appartiennent à des bactéries parasites obligatoires de la muqueuse génitale dont j'ai oublié le nom.  [...] mais on peut retourner la question. dans le cas où certaines fonctions utiles à l'hôte sont accomplies par le parasite (ou plutôt symbionte dans ce cas), on peut considérer que les gènes du parasite sont une partie de génome de l'hôte délocalisé. C'est le cas chez l'homme, qui héberge des bactéries dans son tube digestif, et donc on devrait peut-être considérer le génome de ces bactéries comme une partie du génome de l'homme.  [...]

[Biochimie] Plus petit code génétique.

Mais sinon pour un organisme ou son appartenance au vivant ne fait pas débat on a les mycoplasmes, des bactéries très petites qui sont des parasites cellulaires qui ont 816 kpb donc autour de 800 gènes seulement ce qui est très réduit même pour une bactérie quand on regarde le génome de E.  [...] Si on exclu les parasites alors on a Candidatus Pelagibacter ubique qui est une toute petite bactérie présente dans tout les océans(bactérioplancton) avec un génome de 1300 kpb donc autour de 1300 gènes seulement car il n'y a pas d'introns, pas de transposons, ni de pseudogènes.  [...]

[Génétique] Combien la femme a-t-elle de gènes de plus que l'homme ?

Sinon ceci dit, la question n'a pas beaucoup d'intérêt en réalité. avoir plus de gène ne prédispose absolument pas à grand chose de plus, lorsque les disparités quantitatives sont d'un ordre de grandeur aussi faible par rapport au nombre de gènes au total qui constitue le génome.  [...] On sait que les parasites en général ont moins de gènes que les formes libres apparentées et on sait pourquoi (ils délèguent certaines fonctions à leur hôte), mais au-delà je ne crois pas qu'on ait une théorie qui explique la taille de génome et le nombre de gènes.  [...]

[Biologie Cellulaire] Parasite ?

Les parasites vont des virus aux vertébrés (les poisssons rémoras par exemple) en passant par des bactéries, des protozoaires, des métazoaires invertébrés, sans compter les plantes évoquées par Poulpy_K.  [...] Pour moi (et pour quelques autres) les virus sont vivants et sont bien des parasites, et du coup ils n'ont pas toujours d'ADN. Mais si par parasites cellulaires on entend un organisme formé de cellules (donc excluant les virus) alors oui, tous les parasites de cette sorte ont un génome constitué d'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] Amplification PCR

J'ai donc tester ces oligos sur l'ADNg de ces espèces séquencés et ce couple fonctionne très bien, je n'ai pas de bandes parasites. Néanmoins, j'ai également une amplifications sur mon témoin négatifs. Il ne s'agit pas du blanc sans ADNg hein, non il s'agit de l'ADNg d'une autre souche séquencée qui n'est pas supposer contenir ce gène dans son génome.  [...] Pour mon imprécision concernant le génome et le gène, j'ai vérifier les deux. Le gène n'est pas présent dans le génome de la bactérie (témoin négatif). En revanche l'une des amorces s'hybride avec 16 base sur 20 (recherche par clustalW), l'autre ne s'hybride nul par sur le génome de la bactérie témoin négatif.  [...]

[Immunologie] On nous ment ou pas?

Un truc en commun avec ta transmission, par voie disgestif ^^ rare sont les virus qui résiste aux acidité digestif, c'est plutot les amibes ou la voie de contamination par les parasites. De plus, si j'ai décrit un peu la structure du virus, ce n'est pas pour rien.  [...] D'ou tient tu cette info tu parles peut être d'une dormance mais je ne pense pas qu'il y a d'étape dormant du VIH, peut être une étape de maturation. Je le compare souvent au parasite car c'est aussi des parasites obligatoire intracellulaire. Les parasites sont vivants, ce qu'il faut savoir c'est que si les virus sont des parasites obligatoire intracellulaire, c'est pas pour rien, c'est parce qu'ils sont incapable de pouvoir synthétiser ses éléments structuraux rien que par son génome et donc il est obligé de détourner la machinerie cellulaire de sa cellule cible (les LT4 auxilliaires) pour pouvoir se multiplier.  [...]

[Evolution] Accélération de l'évolution.

Il y a d'abord la pression sélective de maladies parasites, virus, bactéries) hélas souvent mortelles avant l'âge de la reproduction, même de nos jours. j'ai en tête la paludisme. Tu sais comme moi que l'on retrouve chez les populations habitant dans les régions tropicales exposées au parasite P.  [...] Car l'homme est non seulement soumis aux pressions de l'environnement (y inclus parasites, virus, bactéries comme on l'a vu), mais en plus il le modifie rapidement, bien plus que d'autres animaux, et ça lui revient parfois comme un boomerang dans le génome.  [...]