• Forum - Fréquence, Distance, Génétique

[Génétique] Analyse de méiose en vrac (haplontes)

Si je me souviens bien de mes cours de génétique, pour déterminer si les gènes sont indépendants où liés, il faut calculer la fréquence de recombinaison ou encore la distance génétique (d= nb de recombiné / nb total) où 1cM=0.01 fréquence. Du coup si ta distance est.  [...] Sinon pour ton exo il faudrait que tu regardes le nombre de DP et de DR. Car si je me souviens lorsque DP = DR alors les gènes sont indépendants et si DP. DR alors ils sont liés et il faut calculer la distance génétique. Voici un lien qui pourrait t'aider.  [...]

[Génétique] carte génétique et physique

si j'ai bien compris la carte génétique est la position d'un gene sur un chrs par rapport a un autre gêne (fruit de l'étude familiale et des marqueurs polymorphes).  [...] Une distance génétique se donne en taux de recombinaison, lequel dépend de la fréquence de crossing-over entre les deux sites. Le test du lodscore s'utilise donc en cartographie génétique.  [...]

[Biologie Moléculaire] La génomique structurale !

Après, une carte génétique, c'est une détermination relative de distance entre deux gènes en observant le fréquence de recombinaison. ce dernier est obtenu par un croisement. nous croisons quoi là, qui avec qui je n'ai rien compris comment ce fréquence est utilisé pour la carte génétique.  [...] l'unité de cartographie représente une fréquence de recombinaison de 1% cad la distance entre deux gènes pour qu'un produit de meiose sur 100( meiose ou recombinaison meiotique soit recombinant).  [...]

[Génétique] Test 3 points

Et bien il est question de genes liés ( forcement) pour pouvoir calculer la frequence des gametes recombinées sur l'ensemble du croisement, et grace a cela, calculer la distance genetique entre 2 gènes.  [...] Le test 3 points permet a partir du test cross d'un trihybride de realiser plusieurs calculs de distance génétique. C'est tout ce que je sais.  [...]

Spéciation et notion d'espèce

Il me semble que la probabilité d'hybridation doit décroître avec la distance génétique. Donc pour chaque pool d'espèces on doit pouvoir définir une distance maximale d'hybridation (i.e distance génétique maximale au-delà de laquelle l'hybridation n'est plus possible).  [...] Mais quand je parle de distance génétique, il ne s'agit pas forcément de distance en nombre de mutations, ce peut être une distance en fréquences alléliques.  [...]

LOD Score

Bonsoir tout le monde, désolée de vous bombarder avec mes questions de génétique, mais ça me parait une discipline assez compliquée donc voilà,, alors j'ai essayé de comprendre comment se calcule le LOD score, et j'y arrive presque mais j'ai quand meme quelques problèmes, alors pour vous expliquer je vais prendre un exemple tout à fait aléatoire, disons que dans une famille nous avons un seul individu recombiné, et 6 qui sont de génotype parental, de ce fait le calcul de theta (la fréquence de recombinaison) est 1/6= 0,17 = 17% et donc la distance génétique entre le marqueur et le gène en question est de 17cM.  [...] et si par exemple on calcule ce LOD score, et qu'il soit entre -2 et 3 on sait que ce n'est pas significatif, donc notre théta n'est pas le bon et donc on choisit un autre et on refait le calcul (meme plusieurs fois), on fait un tracé et le Z maximal serait le Z optimal c'est à dire celui qui nous donne theta le plus correct et donc la distance génétique la plus correcte (ici je veut m'assurer que ce que j'ai compris est correct ou pas. ).  [...]

Distance génétique

Quand tu veux déterminer la distance entre le gène a et le gène b, tu dois compter la fréquence de crossing over entre a et b... mais pas celle entre b et c.  [...] Donc, tu ne dois pas prendre en compte f (aBc) + f (AbC). car dans ce cas tu comptabilise la fréquence de crossing over entre les gènes a et b ET la fréquence entre les gènes b et c.  [...]

Mapping unit

Juste au passage, 1 cM n'est pas une distance physique en nombre de paires de bases, c'est une distance génétique estimée par le nombre d'événements de recombinaison.  [...] De plus il existe des point chauds très précis où les CO apparaissent plus fréquemment. donc au-delà d'une certaine échelle de précision (plusieurs kb et pour certains organismes plusieurs Mb) la distance génétique n'a plus de rien à voir avec la distance physique.  [...]

[Génétique] Notion de distance génétique

A l'issue de ce croisement, il faut faire un tableau, on observera le nombre d'individus issus d'un gamète parental (A B) ou (a b) et le nombre d'individus issus d'un gamète recombiné (A b) ou (a B). La distance génétique se calcule de la façon suivante.  [...] (Si éloignés qu'il y a tellement de crossing-over entre les deux gènes, qu'il y autant de chance d'obtenir un gamète recombiné qu'un gamète parental.) Plus la distance calculée est grande, plus elle est surestimée. En calculant de petites distances entre deux marqueurs, puis deux autres et ainsi de suite, de proche en proche, on peut, par addition, calculer la distance génétique entre deux gènes très éloignés d'un même chromosome, voir entre tous les gènes, jusqu'à obtention d'une carte génétique complète.  [...]

[Génétique] Génétique des procaryotes L1 exercice transformation/distance génétique

Dans cet exo, on cherche à déterminer la distance génétique entre deux deux gènes en une seule étape en faisant une transformation. On a une souche donneuse (donc Hfr si je ne m'abuse) de génotype leu+met-aziR et une souche receveuse de génotype leu-met+aziS.  [...] Sachant que ton adn exogène est leu+met- et que ton adn génomiquee de la bactérie receveuse est leu-met+, tu va pouvoir calculer ta distance entre leu et met grace a la frequence de recombinaison = Nb simples recombinants / Nb de transformants.  [...]