• Forum - Forme, Groupement, Position

[Biochimie] Phospho-choline et phosphoro-choline ?

La sphingomyéline comporte une phospho-choline en position sn3, et dans les annales du concours de l'an dernier une question était. Les sphingomyélines comportent une phosphoro-choline et dans la correction la proposition (pas faite par les profs) était marqué vraie.  [...] perso dans mes cours, c'est écrit la sphingomyéline est un phospholipide formé d'une céramide liée à un groupement Phosphorylcholine en position sn1.  [...]

La proteine G

Une protéine G inactiva possède une sous unité alpha liée au GDP, alors que la protéine G active voit en fait sa sous unité alpha liée au GTP (et non plus au GDP) se dissocier du complexe formé par les sous unité bêta/gamma. C'est principalement la sous unité gamma qui ancre la protéine G en position sous membranaire, grâce à des modifications post traductionnelles visant à greffer un groupement hydrophobe à une extrémité de la sous unité gamma pour qu'elle s'insère dans la membrane lipidique.  [...] Ces modifs sont principalement la myristoylation, l'isoprénylation (ajout d'un groupement pharnésyl pyrophosphate), etc.  [...]

[Biochimie] Charge nette d'un peptide

Salut, pour calculer la charge nette d'un peptide a un pH donné il faut connaitre la forme ionique de ton groupement -R pour chaque acide aminé. Il faut pas oublier de prendre en compte la forme ionique de l'NH2 terminal et du COOH terminal.  [...] Pour savoir quel forme ionique a un groupement il faut connaitre le pH du milieu ainsi que du pHi (isoélectrique) de ton groupement.  [...]

Protéines

1)Pour savoir la charge d'un acide aminé, il faut regarder les groupements latéraux (entre pH2 et 9,5 les fonctions carboxyliques et amines terminales se compensent). Tu pourras trouver ici les valeurs des pka des groupements latéraux déprotonables. On constate que Tyr, Cys, Asp, Glu, His, Lys, Arg peuvent avoir des chaines chargées.  [...] Ensuite on applique la règle. si pH. pka le groupement est sous sa forme la plus positive (NH3+ pour NH2 et COOH pour COO-) et inversement si pH. pka.  [...]

[Biochimie] Les anomères !

Ces conformations 3D ont toute une activité optique en milieu aqueux parce qu'il s'agit de molécules possédant au moins un carbone chiralé (avec quatre groupements différents).  [...] Ces oses ne diffèrent que par la place des groupements - à droite ou à gauche de la chaîne (carbonée) principale - par convention, le groupement le plus oxydé est toujours à droite (= forme D ) en C 1.  [...]

[Biochimie] Synthése et dégradation des lipides ! Au secours !

Pour ce qui est du tris. On l'utilise pour indiquer que le composé en question, l'inositol, est substitué trois fois par un groupement identique, un phosphate (sur 3 positions differentes http.//en.wikipedia.org/wiki/Inositol_trisphosphate ). C'est different d'un triphosphate qui est un substituant formé de l'enchainement de trois phosphates liés entre eux par des liaisons phosphodiesters (cf ATP http.  [...] Une autre chose m'intrigue malgré tout. Ils disent que les phospholipases coupent au niveau des fonctions esters or la PLC coupe entre le O et le P. Normalement un grouppement ester si je ne m'abuse c'est COO non.   [...]

Cyclisation des oses

J'ai trouvé dans un livre la dénomination alpha-D-glucose-(1-2)-béta-D-fructose qui me semble correcte. Cependant, elle ne met pas l'accent sur l'orientation propre de la liaison (au dessus ou en dessous du plan) mais sur la position du groupement hydroxyle du carbone anomérique de chaque hexose.  [...] - Si il n'y à qu'un seul carbone anomérique impliqué dans la liaison O-glycosidique, met-on simplement alpha ou béta selon la position du groupément hydroxyle relié à ce carbone Si c'est le cas et que deux carbones anomériques sont impliqués, comment fait-on.  [...]

[Biochimie] Tas de problème avec les glucides

Toujours en prenant l'exemple du glucose,et de sa representation,je lis dans le site suivant fr.wikipedia.org/wiki/glucide je cite.au niveau de la representation de Fischer ans la forme D le groupement -OH porté par le carbone n-1 est à droite.  [...] Toujours en prenant le glucose,je comprends très bien comment det une forme alpha,une forme beta,pyranique ou furanosique.Mais je ne sais pas ou placer les groupement -OH.ceux qui sont a droite vont ils en hautet ceux qui sont a gauche vont en bas.  [...]

[Biologie Moléculaire] Ribose ou.. Beta-D-ribofuranose

C'est la structure secondaire. C'est à ce niveau qu'interviennent les notions d'hélice alpha et de feulliet plissé Beta. ces deux denières sont des formes régulières d'agencement l'une en forme d'hélice avec tous les résidus hydrophiles au centre ce qui est pratique pour faire un domaine trans-menbrannaire,l'autre le feuillet plissé ayant plus un rôle structural.  [...] La forme A est une variante de la forme B elle est juste un peu plus volumineuse (tout comme les forme C,DetE d'ailleurs). La forme Z est elle une peitie curiosité car elle tourne vers la gauche. Cette forme semble avoir un effet régulateur important mais tu verra ça plus tard certainement.  [...]

[Biochimie] ATP et énergie.

j ai trouvé 2 reponses. elle peut phospshoryler la molécule en lui donnant le groupement pi ce qui va modifier sa forme et permettre certain mouvements (ex. proteine se déplacant le long d un microtubule) quand le mouvement est terminé le groupement pi se détache.  [...] La deuxième peut être vraie aussi en provoquant un changement de conformation dans l'enzyme, guidant une tranformation stériquement.  [...]