• Forum - Fonction, Acides aminés, Chaîne

point isoelectrique

Je sais qu'il faut compter le nb d'acide aminé qui sont acides et basique et encore la fonction NH3 du début de la chaine d'acide aminé et le COO-. On est d'accord que ya deux acides aminé acides, trois acides aminés basique et apparement il faut aussi tenir commpte de deux acides aminé polaire.  [...] enfin je sais jamais très claire dans mes questions mais est ce que qqn peut m'aider à me faire comprendre quand est ce que des acides aminés se protonnent, ce déprotonnent si il sont acides ou non dans des milleux acides, neutre ou basique... merci d'avance.  [...]

[biochimie] amidation des acides aminés

svp je veux savoir pourquoi lors de réalisation d'une amidation des acides aminés (acide aspartique ou glutamique) la fonction amine se fixe sur la fonction carboxylique de la chaine laterale et non pas sur celle du carbane alpha.  [...] C'est parce que dans le corps humain, et les autres organismes d'ailleurs, la grande majorité des réactions chimiques est enzymo-catalysée, c'est à dire réalisé par l'intermédiaire d'une enzyme. Or une des caractéristiques des enzymes est qu'elles ont une très hautes spécificité de substrats, c'est la géométrie de la protéine, donnée par son enchaînement d'acides aminés, qui donne sa fonction.  [...]

[Biologie Cellulaire] immunofluorescence ???

Concernant l'immunofluorescence tu trouves ça très facilement sur le net... Tu utilises un anticorps reconnaissant spécifiquement ta protéine d'intérêt (même si en pratique c'est pas toujours aussi simple et spécifique et que ça nécessite beaucoup de mises au point).   [...] Typiquement, on utilise un fluorophore portant une fonction réactive (maleimide, isocyanate...), capable de réagir facilement avec la chaine latérale de certains acides aminés de l'anticorps (ex. lysine, cysteine).  [...]

[Biochimie] Hélice Alpha

Seulement, encore pour une histoire de fonction, on a des coudes (avec proline) qui permette de réorienté l'enchainement d'acides aminés. Les hélices sont différentes seulement dans leur longueurs et leur composition d'AA mais on a les mêmes angles phi et psi (enfin il me semble ).  [...] Chaque acide aminé a des propriétés différentes, a cause de son groupement R. Une chaine d'acides aminés, en fonction de leur groupement, peuvent donc avoir tendance à former des domaines différents comme des hélices alpha, présentes par exemple dans l'hémoglobine.  [...]

[Biochimie] Conséquence de changement d'acide aminé.

Beaucoup d'acides aminés auront une action en fonction de leur chaine latérale. Dans ce cas ci, une valine, assez neutre remplace un acide glutamique chargé positivement. Ce genre de modification, plutôt importante, va perturber l'équilibre électrostatique de la protéine et pourra entrainer une modification.  [...] Il est important de comprendre également que le repliement d'une protéine défini son activité. Le repliement se déroule notamment en fonction des propriétés physico-chimiques des acides aminés (structure primaire). Toute modification de cette structure primaire peut théoriquement influencer la structure secondaire, puis tertiaire.  [...]

[Microbiologie] Hydrophobocité de la surface bactérienne !

À la louche, je dirai que les bactéries Gram-, possèdant une bicouche lipidique externe, auront une charge statique de surface (fort) probablement négative.   [...] Quant aux bactéries Gram+, a priori je pense qu'on a une structure avec localement des moments dipolaires. Je pense qu'il y aurait des possibilités que ce soit légèrement négatif en fonction des acides aminés de la chaîne oligopeptidique. Néanmoins la structure doit être globalement neutre.  [...]

[Biochimie] liaison peptidique:seule liaison des aa?

1) Est-ce que les acides aminés possédant une fonction carboxyle ou amine sur leur chaîne latérale l'utilisent pour se lier à un autre acide aminé (ou à autre molécule) ou est-ce que les acides aminés ne se lient que par les fonctions situés sur leur radical ou chaîne principale.  [...] Comme l'a dit vpharmaco, les acides aminés sont généralement reliés entre eux uniquement par les liaisons peptidiques. Mais il existe des cas où les chaînes latérales interviennent. Je pense notamment à l'ubiquitine qui se lie covalemment par son extrémité C-terminale aux chaînes latérales des lysines des protéines à envoyer vers le protéasome.  [...]

[Biologie Moléculaire] Solubilité des protéines

Les acides aminés D et E sous forme ionisée mobilisent 6 H20 et sous forme protonée ils mobilisent 2 H20. Donc plus une protéine est riche en acide aminés ionisés et plus elle est soluble.  [...] Celle de droite est protonée mais pas ionisée, et celle de droit est ionisée mais pas protonée. Et les acides aminés D et E, qui sont respectivement l'aspartate et le glutamate, portent justement une fonction acide carboxilique sur leur chaine latérale.  [...]

Caractère acide ou basique des acides aminés

A l'inverse une molécule qui à un pHi élevé, va plutôt avoir tendance à capter les protons et donc rendre le milieu moins acide puisqu'il libèrera son proton à des pH de 10-12 pour les acides aminés tels que la lysine et l'arginine (on parle donc d'acide aminé basique).  [...] La notion de pHi permet de décrire le comportement électrique de l'acide aminé résultant de l'état dans lequel se trouve les fonctions amines et acides carboxyliques (et éventuellement d'une troisième fonction sur la chaine latérale), de telle sorte que le pHi est la moyenne des pKa pour ce genre d'acide aminé.  [...]

[Génétique] Contrôle du cycle cellulaire

Il faut arriver à conceptualiser la chose. Les cyclines sont là comme substrat, et les kinases sont celles qui réalisent les phosphorylations. Car par définition, les kinases sont des enzymes catalysant le transfert d'un groupe phosphate de l'ATP sur l'hyroxyle (groupe -OH) des acides aminés (chaîne latérale) qui ont une fonction alcool, soit Ser, Tyr et Thr.  [...] Pour faire simple, à chaque fois, ça sera un jeu de phosphorylation/déphosphorylation qui permettra de libérer ou pas le site pour l'ATP, et rendre fonctionnelle la CDK. (Cdc2 ici).  [...]