• Forum - Fixation, Enzyme, Sites

enzymes allostériques

Quant à l'adjectif positif ou négatif. on parle d'effet positif si l'effet lors de la fixation de la molécule est une meilleure affinité de l'enzyme sur le/les autres sites de fixation de l'enzyme. et d'effet négatif si c'est l'inverse.  [...] Le dioxygène se fixant sur l'hémoglobine a un effet homotrope positif car sa fixation augmente l'affinité de l'enzyme à l'O 2 sur les autres sites encore non occupés (au total, il y a 4 sites / hémoglobine). aux poumons, spontanément l'hémoglobine se charge en O 2 et cet effet accélère le chargement.  [...]

spécificité de substrat glucose-oxydase

J'ai du mal à interpréter les phénomènes qui se passe au niveau des sites de fixation de l'enzyme et des soites catalytiques.  [...] Et bien le site catalytique de l'enzyme présente une affinité moindre pour les autres sucres que pour le D-Glucose...c'est au niveau de la conformation du substrat que ça doit se passer.  [...]

site catalytique = site actif ???

Mais il existe aussi des sites regulateurs qui vont modifier l'activité de l'enzyme en fonction de divers parametres tels que la fixation d'un effecteur, ou une modification post-traductionnelle (phosphorylation).  [...] Or j'aurai tendance a penser que ces deux types de sites peuvent etre regroupés sous l'appélation 'sites actifs, puisqu'ils jouent tous les deux un role important dans l'activité de l'enzyme.  [...]

[Biochimie] Mickaeliennes, allostérique et coopérativité: perdu!!

Une enzyme allostérique est une enzyme qui possède plusieurs sites de fixations pour un ligand et dont la fixation d'un ligand sur un des sites modifie les conditions d'un ligand sur des sites de fixation voisin.  [...] Lorsqu'un ligand arrive a se fixer sur un protomère, des liaisons faibles sont cassées on passe à une forme R. Les sites de fixations voisins sont plus accessibles, l'affinité avec le ligand augmente, et la fixation d'un ligand est facilité.  [...]

devenir de la valine et de la leucine

Oui surtout que souvent les sites catalytiques n'ont que certains acides aminés qui agissent. Le manque de l'un d'eux provoque donc une enzyme non fonctionnelle. En plus les acides aminés à chaine aliphatiques dans le genre de ceux que tu as énoncé interviennent souvent dans la formation de poches hydrophobes nécessaires à la fixation de substrats hydrophobes pour permettre leur hydrolyse ou toute autre de réaction catalytique.  [...] L'hypothèse de la formation de protéines non fonctionnelles est en effet pertinante. Elle l'est d'autant plus que ces acides aminés contribuent à la formation des sites actifs mêmes.  [...]

[Biochimie] Regulation de la glycolyse

Les inhibiteurs allostériques se fixent sur des sites dits allostériques, indépendants du site actif. Leur fixation entraîne un changement de conformation de l'enzyme qui de fait modifie son affinité vis-à-vis du substrat.  [...] La coopérativité traduit le fait que la fixation sur l'enzyme d'une molécule d'un effecteur allostérique (exemples. activateur allostérique et inhibiteur allostérique) influe sur la fixation des molécules suivantes. Dans le cas de coopérativité en présence du substrat (sigmoïde de v=f ((S)), si l'effecteur allostérique est le substrat lui même on parle de modulation homotrope.  [...]

[Biochimie] enzymologie

la liaison d'un Inhi a l'enzyme libre d'un cite prés de cite actif empéche la fixation de Sub par encombrement stérique... comment puisqu'ils ont un seul site de fixation.  [...] La fixation de l'inhibiteur provoque un changement de conformation de l'enzyme et la rend inactive ou modifie le site de fixation du substrat ce qui empêche la réaction.  [...]

[Biochimie] Enzyme allostérique et coopérativité

c¼est la coopérativité. Lorsque le substrat entre en contact avec l¼enzyme, il va difficilement trouver un site de fixation mais sitôt fait, il décuple la vitesse grâce à la coopérativité, d¼où le retard si vite rattrapé.  [...] Je vais prendre l'exemple de l'hémoglobine. Ce n'est pas une enzyme mais c'est le même principe. la fixation d'une molécule sur un site particulier (tel que site actif ou site régulateur) influe sur la fixation des sites voisins.  [...]

enzymologie

Les enzymes mickaëliennes fonctionnent sur un principe simple qui est celui de la fixation du substrat au niveau du site actif où il est transformé en produit qui est par la suite libéré. Il peut y avoir plusieurs sites actifs sur une même enzyme.  [...] les enzymes allostériques, quant à elles, sont constituées de plusieurs sous unités possédant chacune un site actif. C'est la fixation d'une molécule du substrat sur une des sous unités qui provoque une modification de la structure des autres unités. Ainsi, l'affinité de ces dernières pour le substrat est augmentée.  [...]

[Biochimie] A propos de l'inhibition de la pyruvate kinase

Moi je pense que le pyruvate entrant dans la mitochondrie sous action de la pyruvate déshydrogénase donne de l'acétyl-CoA qui va suivre le cycle de Krebs et ensuite il y a la chaine respiratoire puis la formation d'ATP. Puis l'ATP sort de la mitochondrie et passe dans le cytosol.   [...] Maintenant en se liant sur une enzyme, un inhibiteur peut empêcher la fixation du substrat sur le site actif, ou provoquer une déformation de l'enzyme qui rend celle-ci inactive (inhibiteur allostérique).  [...]