• Forum - Facteur, Séquence, ADN

[Biologie Moléculaire] Liaison spécifique d'un protéine à l'ADN

Je me posais une simple question. Comment une protéine (facteur de transcription en général) peut-elle se fixer spécifiquement à une séquence d'ADN.  [...] L'ADN vient donc se nicher dans l'espèce de sillon formé par les feuillets béta. Cela aura pour conséquence le recrutement de facteurs de transcriptions qui reconnaissent le TBP et la transcription pourra démarrer.  [...]

Promoteur

Bof bof, c'est sur les deux brins. Un facteur de transcription reconnait une conformation de séquence d'ADN double brin, qu'on la mette dans un sens ou dans l'autre, la conformation reste la même... (voir les enhancers par exemple).  [...] Pareil que LXR, quand on parle de séquences régulatrices, c'est-à-dire que leur fonction implique des intéractions protéine-ADN, il faut considérer que la structure importante est l'ADN double-brin.  [...]

[Biologie Moléculaire] Principe de la LM-PCR

La LM-PCR est utilisé pour la technique de ChIP on Chip qui a été developpé afin de rechercher les sequences nucléotidiques associées a une protéines d'interet (Facteur de transcription) sur tout le génome. Elle permet d'amplifier les sequences d'ADN intergéniques coimmunoprécipité lors de la ChIP de séquence inconnue.  [...] Globalement, ca permet de faire une PCR quand tu ne connais pas ta sequence, puisque tu as fixe un adaptateur lors de la premiere etape. Les applications sont donc multiples.  [...]

[Génétique] enhancers

Un enhancer c'est un séquence activatrice de gènes qui sont plus ou moins loin alors que les éléments de réponse c'est des séquences d'ADN qui activent la transcription et qui sont reconnu par des facteurs de transcription.  [...] Un élément de réponse est une séquence d'ADN de quelques paires de bases sur laquelle se fixe un facteur de transcription. Cette séquence correspond donc à quelque chose de précisément défini. Il se cache sous ces terme la notion d'interaction chimique entre l'ADN et une protéine.  [...]

[Biochimie] Synthese protéique

soit donc aussi par transduction, le facteur de croissance, vient rencontrer un récepteur membranaire, et par effet TRANS, par des cascades de réactions cela va entrainer, la phosphorylations de protéines G cytosoliques puis la phosphorylations de kinases qui vont elles phosphoryler des facteurs de transcriptions qui vont donc eux aussi transcrire une séquence d'ADN.  [...] ensuite les ARNt sont nécessaires, ce sont ceux ci qui permettent la lecture de la séquence ARN et de traduire cela en protéines... ( tête de lecture),  [...]

[Génétique] Systeme GAL4/UAS

la protéine GAL 4 est une protéine de levure. C'est un facteur de transcription. On a découvert, chez la levure toujours, une séquence d'ADN (minimale) qui placée devant une séquence codante (quelconque) suffit à déclencher sa transcription, en présence de la protéine gal4.  [...] On a appelé la séquence UAS pour upstream activating sequence. La protéine GAL 4 se fixe sur la séquence UAS et déclenche la transcription par l'ARNpol. Les chercheurs ont pensé que cet ensemble facteur de transcription + séquence UAS pourrait être un bon système rapporteur.  [...]

[Biologie Moléculaire] Cis et trans

L'élément Cis est une séquence d'ADN, comme un motif reconnu par un facteur de transcription par exemple.  [...] En tout cas dans les publications ce sont des termes très peu utilisés. A la limite on les trouve toujours accompagné de -régulateur. trans-régulateur, cis-régulateur. Je pense que ces dénominations ont été reprises de la chimie où l'orientation spatiale des liaison adjacentes à une double liaison défini une configuration trans ou cis, mais aucun rapport logique avec la bio mol.   [...]

[Biochimie] Pcr

Bonjour, je révise la pcr mais je ne comprends pas une fois la pcr effectuée et le fragment voulu sélectionné. On en fait quoi Enzyme de restriction puis migration Séquençage.  [...] Le seul but de la PCR est d'amplifier une séquence spécifique (ou non dans certains cas très particuliers) d'ADN de façon importante, en gros on a assez facilement un facteur de multiplication de l'ordre du million voire plus. Ainsi il est plus facile de travailler par la suite avec un million qu'un seul exemplaire, la réponse que l'on désire sera plus importante et facile à observer.  [...]

[Biologie Moléculaire] Facteurs de transcription

Au niveau de la structure 3D du facteur de transcription on peut comprendre que deux facteurs de transcription peuvent être différents car pas la même séquence primaire d'acides aminés mais au niveau de l'ADN vu que sur tous les gènes c'est la même séquence du promoteur (boite TATA) je ne vois pas comment se fait la spécificité.  [...] *Les UT tissu spécifiques possèdent la séquence INR (pyr-A-pyr-T-C-pyr-pyr-pyr avc pyr n'importe quelle base pyrimidique donc T ou C) la séquence INR va fixer le facteur de transcription TF II I (. - TF 2i) qui va recruter la pol II.  [...]

[Génétique] Facteur de transcription mode de fonctionnement ds la cellule?

On va imaginer le cas suivant, une molécule va pénétrer massivement dans une cellule elle va se lier au facteur de transcription, ce dernier pénètre dans le noyau puis sur la séquence régulatrice au niveau de l'ADN, résultat il va y avoir induction d'une enzyme X.  [...] Si les 10 molécules vont se lier aux 10 facteurs, et là les 10 facteurs vont se lier à la même séquence sur l'ADN ou sur 10 séquences différentes.  [...]