• Forum - Expression, Ménage, Cellules, Traitements

Ratio de deux gènes pour un tissu

Grâce au calcul de quantification relative à l'aide du deltadelta Ct, je connais l'expression de chacun de ces gènes pour les différents traitements (j'ai posé un traitement de référence).  [...] Toutefois, même si cette information est très intéressante, il est nécessaire pour le projet de calculer un ratio entre l'expression des deux gènes. Certains traitements favorisent l'augmentation du ratio (donc l'expression plus forte du gène 1 par rapport au gène 2 dans notre cas).  [...]

[Microbiologie] gène de ménage ?

Un gène de ménage désigne un gène ayant des fonctions sur les structures élémentaires. De plus, ces gènes se possèdent un niveau d'expression quasiment égal dans toutes les cellules d'un organisme.  [...] merci pour votre reponse.pourriez vous m'expliquer un peu plus la difference de fonction entre les genes de l'ARN 16S \ 23S\ 50S. je connais l'ARN 16S qui est codè par un gene chromosomique,et il est conservé chez toutes les especes.mais sa fonction est quoi exactement dans le génome bactérien ainsi que pour les autres sous unités.   [...]

expression d'un gène

Bonsoir, j'aimerai savoir dans quelle(s) condition(s) l'expression d'un gène est dite constitutive merci.  [...] Gène constitutif. gène qui est toujours exprimé (sans mécanisme de régulation). c'est-à-dire un gène d'entretien (gène de ménage. gène domestique ou housekeeping gene). gène s'exprimant de la même manière dans toutes les cellules d'un organisme. le produit d'expression de ce gène est indispensable à la vie de la cellule (à son métabolisme de base).  [...]

[Biologie Moléculaire] Q PCR - méthode de quantification relative

Ca doit être a peu près ce rapport, mais c'est l'inverse. Un Ct plus petit = une expression plus forte. Donc plus chez le A que chez le B.  [...] Le gène de ménage est votre témoin. Le problème avec l'ARN est que les quantités récupérées peuvent varier en fonction de beaucoup de paramètres. Pour être sur que le seul paramètre qu'on mesure soit celui de l'expression de ce gène, on le pondère par ce qu'on appelle un gène de ménage autrement dit un gène exprimé tout le temps dans les cellules à des taux constants car indispensables à la cellule pour son bon fonctionnement. L'exemple classique est les ARNr.  [...]

Besoin d'un éclaircissement (à propos des gènes)

Or, on peut etre gene de menage mais pas gene de structure...exemple. l'ubiquitine, dont l'expression varie peu (d'ou l'utilisation comme controle interne des mainps) mais qui est regulatrice. Certains facteurs de transcription tissu specifiques dont l'expression ne varie que tres peu dans une cellule mais qui regulent l'expression de genes.  [...] Et on peut etre gene de structure sans etre gene de menage...exemple certains filaments intermediares comme la GFAP dans les astrocytes (et eutres cellules gliales). C'est un gene de structure, puisque sa proteine est une proteine cytosquelettique, mais l'expression est tres variable en fonction de l'etat d'activation cellulaire.  [...]

Gène de ménage (gène de référence...)

Alors un gène de ménage est un gène exprimé constitutivement, c'est à dire en permanence comme par exemple l'actine ou la GAPDH. L'expression de ce gène te servira de point de comparaison.  [...] Donc, le gène de référence, c'est un gène de ménage, c'est à dire un gène qui est connu pour être indispensable à la survie de toute cellule et qui est exprimé de façon équivalente dans toutes les cellules et toutes les situations (en tout cas le plus possible, attentions aux biais).  [...]

[Génétique] Proposition d'expériences pour travaux futurs

La par contre je n'y crois pas trop. Sur la RT-PCR qui n'est pas quantitative, on arrive a voir de fortes variations d'expression de leur gene de menage. Imagine ce que ca va donner en qPCR quand ils vont tout ramener au gene de menage.  [...] La quantification de relA faite par les auteurs ne prouve en faite pas grand chose car le contrôle interne, hrdB, n'en n'est pas un car représente un gène de ménage ou promoter stringent donc forcément une cible de l'alarmone ppGpp, ce qui fait diminuer l'expression d' hrb après un stress.  [...]

[Biologie Moléculaire] Pcr quantitative eficacité de la pcr

L'efficacité est assez rarement égale à 100%. Des tas de paramètres influent sur celui ci avec des relations complexes. Si tu connais ton efficacité, tu peux savoir combien d'ADNc on donné par la suite les amplicons, donc non ça me parait pas illogique. C'est le but de calculer cette efficacité, car pour ce qui est de la limite inférieure pour accepter la manip, c'est un peu flou.   [...] Si tu utilises la méthode du delta Ct. si les efficacités des PCR ne sont pas identiques (ou au moins relativement proches), les pentes des droites (que tu génères en quantification absolue) ne seront pas parallèles, et tu vas introduire un biais dans tes calculs.   [...]

[Biologie Moléculaire] Quantification relative en qPCR

Je mène en ce moment des expériences de qPCR visant à quantifier l'expression de quelques gènes par rapport à un gène de ménage suite à une transfection.  [...] J'ai après récupération des résultats, utilisé l'équation de Pfaffl pour établir les ratio d'expression relative. J'obtiens des valeurs inférieures à 1 si le gène est sous exprimé et supérieures à 1 dans le cas contraire.  [...]

Différence RT_PCR semi-quantitative et Q-PCR

oui, je crois que son niveau d'expression change lors du cycle cellulaire, mais statistiquement sur le total de mes cellules il doit rester stable.  [...] Je n'avais pas pensé que l'expression des gènes de ménage pouvait être influencée par la température de croissance, mais c'est logique. Encore un paramètre en plus qu'il va falloir surveiller.'(.  [...]