• Forum - Enzyme, Réaction, Groupement, Phosphate

[Biologie Moléculaire] Contrôle de la glycolyse

2/Je cois que en ce qui concerne la kinase, l'AMPc va se fixer sur des sous inutés régulatrices qui vont activer d'autres sous unités, les sous unités catalytiques afin de catalyser la réaction. L'AMPc est donc un effecteur de l'activation de l'enzyme. Il est sur que l'enzyme phosphorylée est plus active en tout cas (dans la majeure partie des cas, lorsqu'on fixe un groupement phosphate, l'enzyme est plus active.  [...] Mais il y a des exceptions, ou le groupement phosphate lorsqu'il se fixe au site actif peut etre un inhibiteur, ex. la triose phosphate isomérase).  [...]

[Biologie Cellulaire] Synthèse de lipide dans le REL

Etape 2. Phosphatase. le groupement P est détaché avec cette enzyme. Le groupement P subi une réaction par hydrolyse, P devient Pi, ( là j'ai beaucoup de doute, car sur le schéma je vois que O est lié avec H, est-ce que c'est dû à la réaction par hydrolyse ).  [...] Etape 3. Choline phosphotransferase. qui est une enzyme qui accélère les réactions chimique. ça va transformer la cytidine diphosphocholine en cytidine monophosphate et choline monophoasphate. l'enzyme casse les liaisons entre les 2 groupements phosphate et donc la choline monophosphate vient se lier au glycérol, mais le H qui était lié avec le O se transforme en ion H+ ( pourquoi est-ce par affinité ).  [...]

[Biochimie] la lipogénèse

C'est juste une réaction de transfert de groupement carboxyle (carboxylation). Une enzyme transcarboxylase agence un groupement carboxyle sur une molécule, ici une molécule d'acétate ( activée par la coenzyme A, par une liaison thioester). l'enzyme transcarboxylase, pour pouvoir agencer le groupement carboxyle, doit alors être chargée par du CO2 - c'est à dire qu'elle doit disposer en réserve d'un CO2 qu'elle est prêt à céder à son substrat.  [...] Ici, biotine est un groupement prosthétique de l'enzyme. Ce groupement reste toujours associé à l'enzyme et lui confère son activitée de transcarboxylation, en agissant comme accepteur de CO2. Lorsque l'enzyme s'est déchargée de son CO2, elle n'en dispose plus (Enz-biotine), et doit alors se recharger pour pouvoir à nouveau effectuer une réaction de transcarboxylation.  [...]

[Biochimie] phosphorylation

Oui j'ai compris que le NADH servait à générer un gradient électrochimique, mais est-ce que l' ATP qu'on déphosphoryle provient du cycle de Krebs.  [...] Parce que j'ai pas vraiment compris cette étape... la phosphorylation c'est mettre un groupement phosphate ou l'enlever pour faire de l'énergie Ou est-ce que la phosphorylation mets un groupement phosphate et c'est une autre réaction qui suit qui va enlevé ce groupement pour faire de l'énergie.  [...]

[Biochimie] Création de la liaison entre nucléotides

Dans ma mémoire il y avait formation de H(2)0, hors dans mon livre je vois qu'il y a réaction entre un groupement -OH du sucre de l'un des nucléotides et un -O(-) (lire O moins ) venant du groupement phosphate de l'autre nucléotide. On se retrouve avec la liaison P-O-C et dans cette histoire il me semble que seul 1 O et 1 seul H on disparu.  [...] En effet sur mes shémas le groupement phosphate est dépourvu d'H. Donc si tu dis vraiment et que un H vient s'ajouter en accord avec le PH nucléaire, une réaction entre deux -OH est possible, et de l'eau peut alors être formée.  [...]

[Biochimie] Le glucose dans les muscles...

- le foie contient une enzyme, la glucose-6-phosphatase, qui tranforme le glucose-6-P en glucose. C'est cette molécule qui quitte le foie.  [...] - le muscle ne possède pas la glucose-6-phosphatase, et dans cet organe le glucose-6-P (qui ne peut rejoindre la circulation sanguine) alimente directement la glycolyse. le glucose-6-P est donc utilisé localement pour fournir de l'énergie au muscle.  [...]

[Biochimie] transamination

Il y'a d'abord fixation de l'aspartate (S1)sur l'enzyme (E). Il suit le départ d'un groupement aminé qui se fixe sur le phosphate de pyridoxal (groupement prosthétique intimement lié à l'enzyme) donnant ainsi la forme phosphate de pyridoxamine.  [...] A ce moment, le transfert du groupement aminé du phosphate de pyridoxamine s'effectue sur l'alpha-cétoglutarate qui devient ainsi du glutamate (P2).  [...]

[Biologie Moléculaire] Transcriptase Inverse

Il faut retenir que le phosphate d'un nucléotide est lié en C5 du pentose, et que ce pentose contient un groupement hydroxyle en C3. La polymérisation se fait par formation de liaisons phosphodiesters entre le phosphate d'un nucléotide monophosphate (en C5) et l'hydroxyle en C3 d'un autre nucléotide (réaction d'estérification).  [...] pour chaque nouveau nucléotide qu'on veut ajouter, il y a trois phosphate dont on va couper les liaisons phosphoanhydrides pour récupérer l'énergie. c'est donc l'extrémité phosphate qui va libérer de l'énergie et devenir réactive, ce qui va permettre de rapidement former la liaison phosphodiester en réagissant avec l'hydroxyle C3 d'un nucléotide polymérisé.  [...]

Régulation post traductionnelle des enzymes

- Les régulations covalentes. phosphorylation ou dé-phosphorylation de l'enzyme pour son activation ou désactivation ( ajout d'un groupement phosphate au niveau d'un acide aminé spécifique) par le biais de kinases.  [...] - Les régulations non covalentes (allostérie). qui font intervenir des fixations réversibles de certains composés qui vont modifier la configuration de l'enzyme en augmentant ou diminuant l'affinité qu'elle a pour son ligand. On distingue entre autre l'effet feedback, où un produit de la réaction est un inhibiteur de celle-ci.  [...]

Pyruvate et phosphorylation

La Pyruvate Kinase (PK) prend le groupement Phosphate de ton PEP en position 2 et le transfère sur un ADP qui devient par la suite un ATP.  [...] Il est vrai que le terme Kinase désigne une enzyme qui ajoute un groupement phosphate, son contraire étant une Phosphatase.  [...]