• Forum - Concentration, Souche, Tests, Absence

[Microbiologie] Comment déterminer la concentration d'une souche d'E. sakazakii ?

Je dois déterminer la concentration d'une souche d' Enterobacter sakazakii mais vu que les tests qui lui sont relatifs sont qualitatifs et ne permettent de répondre que par absence ou présence, je ne sais pas comment estimer la concentration bactérienne. Avez-vous une solution.  [...] Il faut savoir que je partirais d'une souche lyophilisée donc sous forme de pastille mais il n'est pas dit que toutes les pastilles soient de même concentration puisqu'elles ne sont pas calibrées.  [...]

[Microbiologie] Tests quantitatifs sur souches non calibrées ?

[Microbiologie] Tests quantitatifs sur souches non calibrées.  [...] J'ai a ma disposition des souches non calibrées faites pour tests qualitatifs mais dans le cadre d'une étude, je vais créer une suspension à partir de cette souche et je cherche à connaître sa concentration. Comment puis-je faire avec une souche non calibrée.  [...]

[Génétique] [M1] Résistance des levures au 5-fluoro-uracile

en TP nous avons étudié la résistance de 6 souches de levures au 5-fluoro-uracile (un analogue toxique de l'uracile), sur 7 boîtes, chacune avec une concentration différente en 5FU (de 0M à 5. 10^-4M). Le but étant d'estimer à quel niveau de la voie de biosynthèse des pyrimidines chaque souche est mutée (la mutation entrainant la résistance = absence de sensibilité au 5-FU).  [...] Nous avons utilisé, selon les groupes, soit du milieu complet, soit du milieu minimum, pour couler les boîtes. Et nous avons étudié la croissance (ou arrêt de croissance) selon les souches et les concentrations en 5FU.  [...]

[Microbiologie] Antibiogramme : problème de définition

Plus exactement, la CMI est donc en toute logique une concentration d'antibiotique qui fait un effet sur la souche bactérienne.  [...] Peut être qu'en utilisant cette définition, ce sera plus simple. la concentration critique inférieure est la dose minimale d'antibiotique qu'un malade peut recevoir sans danger plutôt que la concentration critique inférieure est la dose minimale d'antibiotique qu'un malade peut recevoir sans danger et qui fait effet sur la souche bactérienne.  [...]

Détection bactériennes

Voici ma problématique, je cherche le moyen de détecter 1 à 10 bactérie par mL, mettre au point un test du genre ( présence ou absence ), peut importe la souche Gram + ou Gram -.  [...] une bactérie par millilitre c'est très peu. Avec toutes les méthodes connues tu vas être dans le bruit de fond. La PCR par exemple amplifie toujours quelque-chose dans les témoins négatifs. Il y a de l'ADN bactérien dans la taq, c'est connu et publié. Il te faudrait concentrer tes échantillons.  [...]

[Microbiologie] Catalase et Oxydase

Sa veut dire simplement ta souche n'est pas pure et que t'es en face d'une infection plurimicrobienne si tu fais un diagnostic.-D.  [...] Pour l'autre, je ne sais pas trop. C'est positif si on a du rouge qui finit par virer au violet. Or, j'ai eu du violet, mais pas de rouge avant. (et je précise aussi que j'ai mis un peu de gélose sur ma lame, au lieu de mettre que la souche en surface, je sais pas si ça peut avoir une influence..).  [...]

[Microbiologie] help SVP

Une fraction d'une souche bactérienne Salmonella a servi à ensemencer 100 ml de deux milieux complexe différant par leur concentration en NaCl(=suspension S1 et S2).  [...] Immédiatement à t0, une petite fraction de S1 et de S2 sont diluées 20000 fois et l'on étale 0,1 ml de chacune des dilutions sur un milieu gélosé spécifique, après une nuit de culture dans une enceinte sans oxygéne on compte le mme nombre de colonies pour les 2 dilution. 100 colonies.   [...]

[Biologie Moléculaire] Clone sans ADN

Ensuite, je fais une ligation, soit overnight à 16 degré ou encore 1 heure a température de la pièce. Puis, je fais une transformation (version longue). J'ai des clones sur mes géloses ainsi qu'un bon ratio par rapport à mes géloses contrôles, tout ce qui a de plus simple jusque là.   [...] Lors de l'extraction d'ADN, (j'ai tenter le mini-prep maison et le kit mini-prep biobasic) je n'obiens aucun ADN lors de la migration sur gel d'agarose. J'ai répété l'expérience plusieurs fois, à partir du début, ma superviseur a testé également les clones et à chaque fois, il n'y a pas d'ADN.  [...]

[Biochimie] Dot Blot et Northern Blot

J'ai utilisé le dot blot sur l'ADN génomique bactérien lorsque je cherchais la présence d'un gène dans un grand nombre de souche. Ca m'a permis de faire un premier screening rapide avant de continuer le reste des tests.  [...] Mais c'était un dot blot ou un colony lift Moi quand j'ai eu à screener la présence d'un gène comme tu l'as fais j'ai préféré le colony lift (réplique des colonies sur une membrane nitrocellulose puis en gros l'équivalent d'un southern blot). En revanche je n'ai pas déposé directement l'ADN extrait de chacune des colonies gouttes à gouttes sur la membrane.   [...]

[Biochimie] Experiences peste

A ca, s'ajoute le test de sensibilite. Vous voulez cultiver en presence d'agents tuant des bacteries dont vous ne savez rien... Quelles concentrations allez vous utiliser quel milieu de culture Comment ces composes etaient utilises durant les epidemies pour se proteger Est ce que le test envisage pourra repondre a cette question.  [...] Pourquoi ne pas tout simplement prendre une souche pure d'E. coli (non pathogene) dans votre lycee et tester differente concentration des composes (generalement dilution en serie de facteur 2). Vous savez comment E. coli pousse, ses exigences etc. Les conclusions seront correctes.  [...]