• Forum - Compétition, Sonde, ADN

gel shift : hhhheeeeelllp !!!!!!!

g qd même encore une petite question...je sais qu'il faut faire des expériences de compétition sonde chaude/sonde froide pour tester la spécificité de l'interaction ADN/prot... s'il y a des aspécificités, est-ce dû au marquage de la sonde.  [...] je pose cette question car dans le cas de l'utilisation du kit dont je parlais la derneiere fois, on ne peut pas réaliser d'expérineces de compétition car c le gel qui est coloré apres l'electrophorese et il n'y a pas de marquage de sonde d'ADN, donc je ne vois pas pourquoi l'interaction ADN/prot serait non spécifique dans ce cas.  [...]

Hybridation in situ

La sonde peut s'hybrider de façon aspécifique sur l'ADN. Si l'on ne fait rien alors cette hybridation donne du bruit de fond.Le but du de l'ADN de saumon (on utilise celui ci parce que le saumon pond beaucoup d'oeuf, du coup on peut en avoir beaucoup rapidement) est de capter les hybridations aspécifiques.  [...] Donc si je comprend bien le principe, l'ADN de saumon se fixe sur l'ADN et l'ARN du tissu sur lequel je veux faire l'hybridation in situ, et quand je dépose la ribosonde spécique il y a une compétition entre l'ADN de saumon fixé et la sonde, diminuant ainsi le marquage aspécifique tandisque ma sonde se fixe sur l'ARN que l'on veut mettre en évidence.  [...]

Gel Shift : problème avec la compétition

Par contre lorsque j'ai réalisé une compétition avec ma sonde froide, avec un excès deX10 j'ai tjs un shift (qui tend à migrer moins loin que le shift sans compétiteur) et avec un excès de X35, j'obtient un shift plus important que sans le compétiteur et qu'avec la quantité X10, avec une intensité de ma bande plus grande.  [...] 2ème problème. j'ai également fait une compétition avec un ADN non spécifique (ADN plasmidique quelconque) et j'obtient la même chose mais avec les deux quantité de compétiteur je retadre encore plus.  [...]

[Génétique] Petite question sur la CGH

Autre petite question. toujours dans la CGH, on utilise de l'ADN contrôle avec l'ADN à analyser. Apparemment les deux vont s'hybrider ( de façon compétitive d'après Wikipédia... ) ensemble. Mais comment C'est un point que j'ai mal compris ^^.  [...] Ce qu'il faut savoir c'est que dans chaque puit, il y a une multitude de sondes fixées. L'ADN témoin et du patient peuvent donc être en compétition.  [...]

Pensez vous que l'homme va évoluer? - Page 2

Si on cesse de voir des especes differentes comme Les virus, les plantes, les insectes, les vertebres ou l'homme, mais uniquement des transporteurs de genes codes par l'adn, l'evolution et la coevolution se presentent sous un jour unique de competition de genes pour survivre.  [...] ta vision, que finalement chaque etre vivant n'est somme toute qu'un ADN particulier devant survivre me semble assez juste... quand a la notion de compétition, je dirais plutôt que cette compétition n'existe pas, c'est la pression du millieu qui en selectionant les individus adapté nous donne l'impréssion d'une compétivité consciente entre chaque ADN.  [...]

Chromosome/chromatine

Au sein de la chromatine qui correspond au chromosome décondensé en interphase on distingue deux niveaux de compaction. l'euchromatine correspond à l'état le plus décondensé où l'adn est enroulé autour d'octamère d'histones, pour former la fibre nucléosomique (encore appelée le collier de perles).  [...] Euchromatine = ADN décondensé il y a très peu d'histone car en compétition avec les facteurs de transcriptions si il y avait des histones comme tu le dis l'ADN serait encore condensé. Mais si non super explication.  [...]

[Biotechnologie] Résultats d'un criblage biologique...

Pour revenir sur les methodes, c'est en général des tests de compétition. on fixe la protéine d'intéret sur une microplaque et on regarde la capacité des molécules à empêcher la liaison entre la proteine et un ligand de la proteine qui est marqué soit par un élément radioactif, soit avec une sonde fluorescente.  [...] En general les manip sont faites en triplicate (une condition identique est testée 3 fois), et on obtient donc des pourcentages d'inhibition avec un ecart-type.   [...]

[Biochimie] (licence/master) Question sur la pcr pour un rapport de stage, merci

C'est une méthode très rapide. Ils peuvent avoir une spécificité plus réduite à cause de compétition entre les ADN ciblés et des amorces non adéquates.  [...] Pour la Multiplex, un des avantages est également de pouvoir quantifier (car en temps réel). Mais cela demande beaucoup de préparation pour le protocole. Après, au niveau du désavantage, vous avez toute à fait raison. il est cependant possible de diminuer, voir de supprimer cet inconvénient de compétition à l'aide d'optimisation des sondes et du protocole.  [...]

[Biologie Moléculaire] ADN et stringence

s'appareillent, il faut donc une faible concentration de NaCl et 10% de formamide.   [...] Mais je ne comprend pas pourquoi ne pas augmenter la concentration d'NaCl pour que cela stabilise l'adn et pourquoi ne pas diminuer le pourcentage de formamide pour qu'il ne rentre pas en compétition avec les bases.  [...]

[Evolution] question du jour

Pour répondre à la fin de ton message, mecton, à mon sens, il n'y aucun rapport entre les associations symbiotiques de cyanobactéries et autres protozoaires, et l'apparition des premiers métazoaires, puisque il n'y a alors ni génotype commun ni différenciation cellulaire.   [...] En ce qui concerne l'ADN non informatif, il me semble qu'il permet d'établir une distance physique entre 2 régions promotrices et donc cette distance diminue la probabilité, pour un facteur de transcription, de se lier au 2 promoteurs. Si ces 2 promoteurs sont proches alors ils entrent en compétition pour le facteur de transcription ce qui est moins le cas lorsque les promoteurs sont éloignés.  [...]