• Forum - Charges, Acides aminés, Protéine

[Génétique] Myoglobine

Mes documents pour m'aider sont la représentation en 3D de cette molécule et la comparaison d une partie de la séquence des acides aminés de la myoglobine de quelques vertébrés.  [...] D'accord. En cours de traduction, la protéine se replie instantanément tout d'abord en fonction des interactions hydrophobes qui sont déterminées par les acides aminés... hydrophobes. Viennent ensuite les autre interactions faibles, ioniques, hydrogènes, toujours en fonction de la nature des acides aminés (polaires, chargés,  [...]

Besoin d'un peu d'aide : enzymes et acides aminés

Bonjour, il suffit de connaitre la structure primaire de la protéine, seuls certains acides aminés sont susceptibles de modifier la charge de la protéine. Il suffit de regarder selon leur pI quelle charge ils auront au pH considéré. Si le pI est proche du pH, il convient souvent de calculer plus précisément la proportion d'acide aminés qui seront protonnés ou non à ce pH.  [...] Forcément si les charges des acides aminés sont impliquées dans la forme de la protéine, si on fait varier le pH, on fait également varier les charges des acides aminés et donc on peut modifier la forme de la protéine. Souvent dans le cas des enzymes, le repliement fait apparaitre une poche (appelé site actif ).  [...]

[Biochimie] Etude de la reconnaissance enzyme, substrat

- Sachant que certaines liaisons faibles dans une protéine dépendent des charges + ou - portées par les acides aminés, proposez une explication à l'importance du pH dans l'activité d'une enzyme.  [...] On peut également trouver des exemples pour la différences ammonium/amine d'acide aminés comme la lysine. Il est probable que la charge des acides aminés soit optimales pour la catalyse à PH physiologique (PH 7,4 il me semble sauf dans certains cas cités par novocaine, à PH 7,4, les acides seront en tout cas majoritairement sous forme carboxylate et les amines sous forme d'ammonium).  [...]

Structures d'une protéine

l'activité d'une protéine dépend de sa forme et de la répartition des charges électriques (enfin, je suppose qu'il est plus correct de parler de nuages électroniques) en tout cas la nature des acides aminés est importante.  [...] La structure quaternaire est adopté par les protéines qui agissent en oligomère ou polymère. Par exemple la protéine p53 agit sous forme d'un tétramère. La structure tridimensionnelle d'une protéine p53 est une structure tertiaire, son association en tétramère est une structure quaternaire.  [...]

activité enzymatique : concentration en sels

Comme les enzymes sont des proteines elles sont soumisent aux phénomes de salting-in ou out. Ces phénomènes sont utilisés afin de précipité des protéines en laboratoire. Une forte concentration en sel peut faire précipité ta protéine et de ce fait lui faire perdre toute activité.  [...] Cela est du au fait que les sels stabilisent les charges des groupements R des acides aminés. Si notre protéine est alors une enzyme, elle peut utilisée ses charges por faire des liaisons ioniques ou des transferts d'hydrogènes tel que l'ARNase qui part diverses echange de protons entre deux histidines arrive à digéré l'ARN.  [...]

Composition d'un peptide

j'ai trouvé la solution pour la charge nette steph avait raison car elle correspond à la somme des charges portées par chacun des radicaux ionisables des acides aminés dans une protéine à un ph donné.  [...] pour calculer le phi il faut tracer un tableau des pk ionisable dans la protéine et leur attribué leur charge en fonction du pk des autre groupe. C'est pas clair comme ça mais il y a une bonne explication à page 9 de.  [...]

[Biologie Moléculaire] Charge des acides aminés

Bonjour, je suis en Paces et en biochimie on nous apprend que les acides aminés basiques sont chargé + et les acides aminés acides sont chargés - et j'aimerais comprendre pourquoi, pour moi c'est l'inverses les acides étant capables de céder un ou plusieurs proton H+ Ils devraient être chargés positivement. Merci beaucoup.  [...] Les acides aminés chargés + ont pour la plupart un groupe aminé -NH2 supplémentaire. Cette fonction est basique et capte les protons sous forme NH3+.  [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

Heu non tu peux pas dire ça parce qu'il peut y avoir d'autres acides aminés chargés dans ta protéine (histidines, arginines, glutamates, aspartates). Disons plutôt qu'elle va moins migrer vers la cathode que ta protéine P normale.  [...] J'ai un peu de mal moi aussi avec l'idée que les phosphates dépassent suffisamment des chaines latérales des acides aminés pour avoir plus d'influence sur la migration de la protéine que les chaines latérales elles-même. Mais bon, je ne vois pas d'autres explications non plus.  [...]

[Biologie Moléculaire] acides aminés - Page 2

Les acides aminés se rangent bien en deux groupes polaires et apolaires. Les ionisés ne sont qu'un cas de AA polaires. Ce sont des polaires chargés (les autres polaires étant les polaires neutre).  [...] - Il existe des centaines d'acides aminés mais seuls les 22 cités ci-dessus sont incorporés cotraductionnellement dans les protéines.  [...]

peptide signal et ribosomes libres

Sinon Yoyo, pour ta question sur les protéines résidentes dans le RE, elles possèdent ce que l'on apelle une séquence de rétention dans le RE qui est (il me semble mais je n'ai aucun bouquin sous la main pour vérifier) une séquence de 4 acides aminés en Nt je crois.  [...] Les protéines nucléaires sont effectivement traduites dans le cytosol. Elles portent en C-ter une courte séquence d'acides-aminés chargés positivement appelée signal de localisation nucléaire ou SLN bien qu'on la croise plus souvent sous sa dénomination anglaise NLS.  [...]