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[Biochimie] génétique - endonucléases de restriction

Un ADN génomique contenant 40% de guanine est hydrolysé par une enzyme de restriction reconnaissant le palindrome AATT. Quelle est la taille moyenne des fragments générés par l'hydrolyse enzymatique.  [...] Donc la probabilité de trouver un site est (1/4) n avec n la taille du site de restriction. Ce genre de calcul vous amène à conclure qu'une enzyme telle que EcoRI génère des fragments de 4096 pb en moyenne.  [...]

[Biologie Moléculaire] Calcul de rendement

Bonjour. Voilà en ce moment je réalise des TP de biomoléculaire. On me demande de réaliser un calcul de rendement de purification des fragments obtenus lors d'une digestion. pCR-GAI digéré avec BamH1 et Hind III, 2 sites de restriction pour chaque enzyme.  [...] On obtient 4 fragments, on désire obtenir un fragment de 704 pb (la moitié 5' du gène), qu'on liera sur un autre plasmide pSK lui aussi coupé par ces deux enzymes (pour avoir les bonnes extrémités). Ce plasmide pCR fait 5484 pb.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fréquence de sites de restriction

La taille du génome de P. aeruginosa est = 6,3^10 6 pb. Donc, avec le calcul ci-dessus, on aura que la taille moyenne des fragments est de 7000pb.  [...] Je ne comprends pas ce calcul. Je ne vois pas en quoi diviser le nombre de fragments générés (si ou coupe à 100% d'efficacité) avec la probabilité de couper donne quelque chose ressemblant à un rendement.  [...]

[Biochimie] Sequençage de l'ADN

Pour les fragments de 100 bp je sais pas exactement mais il me semble que c'est mécanique... j'imagine mal qu'il existe une enzyme super bien élevée qui coupe tout les 100 paires de bases (quoi que).  [...] Ca dépend, les enzymes de restriction reconnaissant des sites de restrition courts, 3 bases par exemple, clivent selon un calcul probabiliste toutes les 64 paires de bases. Pour les sites de restriction de 4 bases, leur fréquence est en moyenne toutes les 256 bases.  [...]

[Biologie Cellulaire] Exercice Bio PCEM1

On calcule déjà la moyenne des colonies par boîte. le calcul nous donne 11 colonies.. mais après je ne vois pas comment il faut faire.  [...] 2- On considère que chaque colonie obtenue après étalement est le fruit de la croissance d'une cellule ensemencée. Donc en moyenne dans les 200 microlitres étalés, il y avait 11 cellules.  [...]

[Biochimie] Influence de la concentration en enzyme Calcul activité spécifique

Si au cours d'une étape de purification l'enzyme a été partiellement dénaturée (à cause de conditions défavorables ou d'une erreur), la mesure de l'activité spécifique ne pourra donner qu'une information approximative voire fausse de la pureté de la protéine.  [...] On peut tout de même considérer que l'enzyme non fonctionnelle est une impureté... Donc tout dépend de quel point de vue on se place. du point de vue de la protéine (sous toutes ses formes) ou du point de vue de l'enzyme fonctionnelle. Enfin c'était juste une parenthèse en passant.  [...]

[Biologie Moléculaire] calcul vitesse moyenne reaction catalysée

En premier temps je voudrais vous demander quelle est la formule pour calculer la vitesse MOYENNE d'une reaction catalysée.  [...] la question sur mon tp. Comment peut-on evaluer la vitesse moyenne de la reaction catalysée par l'enzyme dans une intervalle de temps donné.  [...]

[Microbiologie] détermination nombre paires de bases en electrophorese

je voudrais savoir s'il existait une formule pour calcul le nombre de paires de bases des bandes de fragments électrophorétiques en fonction de la distance de migration.  [...] précision la distance tu peux l'exprimé en cm ou en mm sa na pas trop d'influence. il faut juste pensé à utilise la même unité dans la droite étalon et dans tes fragments d'adn. elle se lit du haut du gel vers le bas dans le sens de migration. le zéro étant le haut (endroit du dépôt).  [...]

[Evolution] Évolution humaine en parallèle - Page 2

Tiens j'ai fait le calcul pour un processus de branchement avec nombre poissonien d'enfants. Si chaque femme a en moyenne 2 filles, il suffit de 5 femmes pour que la probabilité d'extinction finale soit moindre que 1 pour 1000. Si je prends un nombre géométrique de filles et toujours 2 en moyenne, il faut 10 femmes.  [...] En effet il y a eu des expériences d'évolution expérimentale qui ont montré que sous les mêmes conditions environnementales (donc les mêmes pressions de sélection) des populations de bactéries isolées les unes des autres divergeaient inexorablement. Il en serait probabiement de même des humains évoluant dans deux planètes, même si les environnements étaient voisins.   [...]

[statistiques] Tester la normalité d'un échantillon

Oui c'est possible (mais là on a des effectifs trop faibles). il faut rechercher combien on devrait avoir en théorie (pour une loi normale de même moyenne et même écart-type) d'individus pour les intervalles sur lesquels tu observes expérimentalement des individus (ça se calcule grâce aux tables de la loi normale, qu'on trouve dans le bouquins de stats), et de faire un chi-deux pour comparer effectifs théoriques et observés (ne pas oublier que dans ce cas, le nombre de degrés de liberté équivaut à nombre de comparaisons -1- nombre de paramètres estimés, le nombre de paramètres estimés étant ici de deux (écart-type et moyenne)).  [...] je pense que tu a raison au sujet des maximum que j'ai pris. Je vais essayer de faire ce que tu propose ( écart type, moyenne...) mais ca me semble compliqué pour la raison suivante. en fait j'ai mesuré l'activité EMG lors d'un exercice d'imagerie mentale pour voir un tel exercice provoquait une légère activité musculaire, aussi j'ai donné un signal de départ pour l'exercice mais chaque personne a pris plus ou moins de temps pour réaliser l'exercice.  [...]