• Forum - Cadre, Lecture, Sens

[Biologie Moléculaire] mutation génétique

Sinon si la mutation de ton patient est une microdeletion changeant le cadre de lecture ou un codon stop alors cela va rendre instable l'ARNm (via la voie de degradation appelée NMD). Si en revanche c'est une mutation faux sens ou la deletion d'un exon complet, l'ARN ne sera pas affecté.  [...] de rien, ca le rends instable car le changement du cadre de lecture induit par la microdeletion (faut pas que ca soit un multiple de 3.) provoque l'apparition d'un codon stop prématuré (comme une mutation non-sens). Cela provoque alors la degradation de l'ARNm et l'inhibition de la traduction.  [...]

[Biologie Moléculaire] Pcr

moi j'ai un autre soucis je voudrais denaturer un fragment d'ADN mais de facon stable. J'ai essaye de chauffer mon ADN a 95 degres pendant 10 min et de le plonger dans la glace immediatement apres mais ca ne fonctionne pas...Avez vous une solution merci d'avance.   [...] on m'a conseillé de prendre la séquance nucléotidique du cDNA et de la traduire en Acide Aminé chose que j'ai faite et j'ai obtenu 3 Framds le sens 5`3` et 3 autres ds 3`5` selon les dif cadre de lécture.  [...]

mucoviscidose

Ce qui est vraiment rageant, à mon sens, c'est que cette maladie est dûe au contrôle strict du réticulum endoplasmique, c'est à dire que le CFTR muté n'a pas le bon repliement 3D mais sa fonction est quand même normale et donc par mesure de sécurité, la protéine reste au niveau du Golgi, elle n'est donc pas présente sur la membrane et ne peut par conséquent pas exercer sa fonction normale.  [...] Mais il existe d'autres formes (900 mutations en tout). protéine absente (non sens, décalage du cadre de lecture), défaut de régulation du canal, sélectivité modifiée, diminution du nombre de canaux... (source. http.//www.iefg.biotoul.fr/Liens/cou...oviscidose.pdf ).  [...]

[Génétique] séquence anticodon

Comment peut -on trouver la seqence d'un anticodon à partir de celle d'un ADN.   [...] Le brin sens ou codant de l'ADN a la même séquence que l'ARNm (où les U remplacent les T). Ensuite il vous faut connaître le cadre de lecture. Puis en prenant les bases complémentaires des codons trouvés vous obtenez les anticodons.  [...]

[Biologie Moléculaire] Cadre de lecture et sens de transcription

Si au cours d'une expérience on établit la séquence d'un seul brin d'un fragment d'ADN que l'on sait être interne à un gène, il est possible, au moins en théorie, de déterminer le sens de la transcription. Comment.  [...] Tout d'abord je ne comprends pas ce qu'on entend par fragment d'ADN interne à un gène, et je n'ai trouvé aucun document n'explicitant le lien entre cadre de lecture et transcription... Si quelqu'un pouvait m'éclairer... Merci.  [...]

[Biochimie] nouvelle sur le forum et besoin de vs pour du clonage, help

Pour la PCR le site internet qui va bien est primer3. Vous entrez votre séquence et il vous donne des oligos qui fonctionneront dans 95% des cas. Si vous souhaitez amplifier de longfragments (. 3kb) pensez à utiliser une PCR long range (type long expent de chez Roche).   [...] le système cellulaire est eucaryote. des cellules humaines issus de l'endothélium vasculaire.Il est vrai que je suis complétement néophyte à tout cela, et j'ai essayé de designer des primers avec des enzyles de restriction bien particulières, mais je ne sais pas si ce que j'ai fait est vrai, car je me suis positionné bien avant mon ATG pour designer mon primer sens, et je ne sais pas si cela décaleras mon cadre de lecture entre autre.  [...]

[Biologie Moléculaire] Petite question sur la terminaison de la traduction

Evidemment le cadre de lecture est important, mais il l'est aussi pour les autres séquences, AUG par exemple et donc pour en revenir a notre bon codon d'initiation, je ne concois pas qu'on puisse trouver plusieurs methionines dans une proteine (et donc plusieurs AUG respectant le cadre de lecture ) mais pas un seul autre codon stop qui respecterai le cadre de lecture lui aussi, derriere le premier codon stop alors qu'il y a 3x plus de codon stop dans le code genetique que de codons d'initiations.  [...] en revanche une délétion ou une insertion modifierons le cadre de lecture et impacterons le codon stop, mais la encore peut etre que ce nouveau cadre laissera découvrir de nouveaux codons stop derrière comme un. AA A UAG A UG A AA AAA.  [...]

[Biologie Moléculaire] qu'est ce qu'une ORF?

Pareil pour Piwi, dans ton exemple ce n'est pas vrai, on a toujours trois cadres de lecture possibles, meme si le deuxieme commence par un stop c'est un cadre de lecture possible, il commence juste apres le codon stop...non seulement on a 3 cadres de lecture possible, mais en plus on a aussi 3 ORF potentielles (on en a meme 6 si on considere le brin revese qui est ouvert dans les 3 phases lui aussi).  [...] Et ca change tout. Dans mon exemple le second cadre, qui existe effectivement, n'est pas ouvert puisqu'il conduit immédiatement vers un STOP. C'est un cadre de lecture certes mais il est fermé.  [...]

cadres de lecture et codon start

Le frameshift est très utilisé chez les virus, où l'information génétique est très condensée et les cadres de lecture se chevauchent. Par exemple, chez les rétrovirus, l'ARN contient entre autres deux cadres de lecture différents et chevauchants, gag et pol (codant respectivement pour les protéines de capside et la reverse transciptase + l'intégrase).  [...] mais donc dans ce cas-là, il n'y a qu'un seul codon start, qui est utilisé pour débuter la transcription puis la traduction, et le passage d'un cadre à un autre se fait en cours de traduction...et donc la question que je me posais n'existe pas...car là il n'y a que 3 cadre de lecture possible.  [...]

[Biologie Moléculaire] traduction et mutation

1) indiquez les acides aminés codés à partir de la séquence d'ARNm indiquée ci dessous dans les trois cadres de lecture de cette séquence. Si ou vous disait que ce segment est situé au milieu de l'ARNm qui code pour une grande proteine,sauriez vous quel cadre de lecture est utilisé réelement comment 5' AGUCUAGGCACUGA 3'.  [...] Si vous choisissez ce cadre de lecture, le prochain codon est un codon stop. Que se passe t'il avec un codon stop Cela est il valide avec l'énoncé.  [...]