• Forum - Bases de données, Connaissance, Software

[Génétique] question

Si tu recherches une protéine, le site d'uniprot ( http.//www.uniprot.org/ ) reste celui avec la base de donnée la plus importante. Mais tout est en anglais.  [...] Par contre les bases de données nécessitent souvent une petite connaissance du software pour l'utiliser correctement.  [...]

designer des sondes pour microarray

Des logiciels gratuits existent pour analyser les résultats mais à ma connaissance pas pour les designer. Il faudrait poser ta question sur un forum de bioinformatique comme bioinfo-fr.org.  [...] A ma connaissance, tous ceux qui ont fait des sondes pour microarray l'ont fait a la main. C'est a dire que tu recuperes ta sequence dans ncbi, tu cherches tes oligos avec l'aide d'un software si tu veux genre Vecteur NTI (gratuit chez invitrogen), puis tu blast pour voir si c'est specifique etc.  [...]

[Biotechnologie] Implants cérébraux

Je ne pense pas qu'il soit nécessaire de faire continuellement des up toutes les 18 heures. Le sujet que tu poses là est particulier et pointu, il y a donc peu de gens connaissant les réponses aux questions que tu poses. Le mieux est d'être patient, et accepter que le sujet ne trouve pas ses réponses (ce que je ne souhaite pas) si c'est le cas.  [...] - Connaître le cerveau n'est pas connaître l'esprit ou la personnalité. Petite analogie personnelle. on peut voir le cerveau comme la partie hardware de l'esprit. l'expérience et l'instinct comme la partie software. la conscience + l'inconscient + le subconscient comme un microprocesseur triple émulé - le tout servant à traiter les stimuli extérieurs qui ne sont que des données de la réalité.  [...]

Capacité mémoriel d'un cerveau d'un individu lambda? - Page 5

Un ordinateur est une boîte noire que se partage hardware et software. Je vous mets au défi de m'analyser cette boîte noire de façon bottom-up, tout ce que vous pourrez tirer de l'ordinateur de cette façon se sont les lois générale qui le gouverne comme la MQ, mais vous ne pourrez en aucune façon accéder à ce qui va s'afficher sur l'écran n'ayant aucune connaissance des logiciels.  [...] .. Comment donc ne pas croire que les disques durs, qui permettent depuis longtemps eux aussi d'organiser leurs données, notamment fragmentées, d'optimiser l'espace disque de même que le cerveau optimise la résurgence de certains souvenirs, comment donc ne pas concevoir une évolution qui, s'inscrivant dans celles plus larges de l'IA, permette peu à peu une modulation des données, sans cesse implémentées par de nouvelles, dans les mémoires artificielles.  [...]

[Biochimie] NanoDrop

J'ai cru comprendre que le NanoDrop ne fonctionnait pas avec des filtres déterminés, mais qu'il mesurait l'absorbance sur toute une gamme de longueurs d'onde.   [...] Le nanodrop est un spec. Il ne scanne pas les longueurs d'onde, par contre il peut toutes les lire. Je ne suis jamais trop rentre dans les details de la bete, mais normalement quand tu achetes un nanodrop ils te donnent un software pour le piloter. Tout est deja pre-cree dans le soft.  [...]

[Divers] analyse d'image

Je cherche un software qui ferait ca automatiquement (autre que Nucleus) ou alors un software qui me permettrait de selectionner grace a une baguette magique mes spots (ADN ou cell), puis de les analyser par la suite.  [...] Merci pour les soft. Je pense que je vais me tourner vers imageJ. Je me suis cree une macro qui me permet manuellement de mesurer la longueur, la largeur de la cellule, puis il calcule l'aire... mieux que rien.   [...]

[Génétique] trouble du comportement d'origine génétique.

du coup je me demande quel est l'image réelle des interactions entre les différentes et innombrables biomolécules et substances nucléaires chez un eucaryote unicellulaire, je veux dire quel est la hiérarchie des influences entre biomolécules nucléaires et d'un point de vue biophysique, qu'elle est réellement le support solide de la vie et le support vivant, je raisonne comme pour un ordinateur il y a une partie hardware et une partie plus virtuel software, dans le cas de la vie on sait que ce qui représente la vie proprement dites, c'est l'ADN mais l'ADN à hauteur de ce que je sais de la biologie s'avère plutôt un hardware du vivant qu'un software, les trucs qui représente vraiment le software du vivant sont plutôt les hormones et les cocktails d'hormone qui agissent pour qu'un comportement apparaît chez l'individu.  [...] tu ose traité cendres de jésuite. c'est pas gentil, c'est une querelle entre modérateur.., ou par sympathie tu le traite d'hypocrite ça veut dire ça jésuite en fin de compte...ou juste tu fait allusion à sa bonne connaissance de moi et de ma mentalité et de la méthode presque artistique avec laquelle il m'a répondu.  [...]

[Biologie Moléculaire] Software pour le design de sondes FISH

Je me tourne vers la communauté Futura-Sciences pour demander de l'aide... Je suis actuellement sur un projet de microbiologie qui consiste à repérer des bactéries grâce à leur fonction dans un mélange complexe. Pour cela, on utilise la technique du Gene-FISH qui repose sur l'utilisation de sondes polynucléotidiques spécifiques du gène que l'on cherche à repérer.   [...] Mon problème est le suivant. je dois designer des sondes permettant le repérage de la fonction qui m'intéresse, et je cherche donc un petit logiciel qui prendrait en argument des séquences (nombreuses et assez diverses) de gènes et qui donnerait en sortie une ou un mix de sondes polynucléotidiques qui s'hybrideraient à ces gènes.  [...]

Articles importants dans Nature, Science ou Cell - Page 6

The genome has often been called the operating system (OS) for a living organism. A computer OS is described by a regulatory control network termed the call graph, which is analogous to the transcriptional regulatory network in a cell. To apply our firsthand knowledge of the architecture of software systems to understand cellular design principles, we present a comparison between the transcriptional regulatory network of a well-studied bacterium (Escherichia coli) and the call graph of a canonical OS (Linux) in terms of topology and evolution.  [...] Sinon dans la meme ordre d'idée, on a obtenu des données de cryoEM a 5,5A pour deux ribosomes eucaryotes. Ce qui est quasiment des résolutions atomiques.  [...]

[Biologie Moléculaire] Ape Software

Avez vous déjà rencontré ce problème Existe-t-il un patch pour le stabilisé Ou connaissez vous un soft du même genre qui peut gerer les features créer par Ape.  [...] Bon l'avantage de Ape c'est qu'on peut faire une banque de séquences, ensuite le soft annote directement tes constructions.   [...]