• Forum - Anticorps, Structure, Séquence

cible d'un anticorps

Concernant la reconnaissance par l'anticorps d'un épitope, elle peut de faire de 2 façons. soit par l'intermédiaire d'un épitope linéaire (là c'est la séquence qui est reconnue), ou par un épitope conformationnel (là c'est la structure).  [...] Tout ça ne répond pas trop à me demande de mécanisme. Un anticoprs (Ab) peut reconnaitre toutes les amyloides (que ce soit synucléine, beta, insuline,...), ce qui veut dire que ce n'est pas la séquence qui est épitope, mais une structure. Ici on parle d'un turn motif, à savoir que toutes les amyloïdes possèdent des brins beta antiparallèles, c'est ce motif qui serait reconnu.  [...]

[Biologie Moléculaire] D'une protéine à un gène à une protéine

Je sais qu'il est aisé de déterminer la structure primaire d'un protéine (et donc d'un anticorps) et de procéder à une reverse-translation d'une telle séquence d'acide aminés en une hypothétique séquence nucléique. Mais cela peut-il être juste ainsi.  [...] Qu'en est-il des mécanismes post-transcriptionnels et post-translationnels de la structure tertiaire et quaternaire particulièrement pour les anticorps.  [...]

Immunohisto

Par ailleurs, l'anticorps peut reconnaitre des structures +/- natives ou bien denaturees. En immunohistochimie, l'antigene est (normalement, et si l'on considere la fixation comme preservatrice) en conformation native. les proteines gardent une structure secondaire, tertiaire ou meme quaternaire.  [...] Les anticorps peuvent alors reconnaitre des epitopes conformationnels (par exemple, un motif d'acides amines regroupes spatialement mais eloignes sur la sequence, ou bien des boucles...). Cette structure spatiale n'a pas forcement la meme forme en fonction du tissu, puisque la proteine cible n'est pas forcement la meme exactement (glycosylation, phosphorylation, acylation...etc...).  [...]

[Biologie Moléculaire] Voir la structure (exons/intron) d'un gene sur la séquence

Bonjour, je cherche un moyen de connaitre le début et la fin des exons d'un gene sur une séquence d'adn. Je sais aller chercher la séquence du gene sur NCBI mais j'arrive pas a voir le début et la fin de chaque exon, la structure du gene en gros.  [...] L'annotation de génome n'est pas évidente. Si votre gène appartient à un génome séquencé vous pourrez utiliser ensembl. Sinon, je ne sais pas trop. D'autant moins si votre gène code pour un bidule exotique peu étudié.  [...]

[Biochimie] Méthode d'études AA et protéines

Est-ce que quelqu'un pourrait me confirmer ou m'infirmer les méthodes d'études utilisés pour déterminer une séquence en AA (structure I) et protéines.  [...] Et dernière question, peut-on considérer (ça me paraîtrait logique mais jprefrère demander) que les méthodes utilisés pour déterminer la séquence en aa sont les mêmes pour déterminer la structure primaire.  [...]

[Immunologie] Lymphocyte B

alors,B va multiplué en donnant des lymphocytes B, et bien Th va émit un agent de diffirenciation BCDF, puis aprés la diffirenciation des lymphocytes B, on obtien des lymphocytes diffirenciées.LBp (plasmique) qui produit des anticorps.et LBm non diffirenciée (mémoire) qui garde la structure d'antigene lors une autre contamination pour ne refaire pas le stade de reconnaissance avec l'antigene.  [...] ...........et je pense que les LB contient un CMH.car, il faux d'abord reconnaitre l'antigene pour produire des anticorps de meme structure (complimentarité entre l'antigene et l'anticorps) puisque chaque antigene a son propre anticorps spicifique.  [...]

Adn

La structure primaire d'une séquence d'ADN est généralement donnée en 5' -. 3' et en simple brin, par souci de simplicité, étant donné que le second brin est complémentaire. Mais ce n'est pas toujours le cas et tu peux croiser des structures primaires par paires de bases (littéralement avec les sections des deux brins complémentaires).  [...] La structure primaire, si tu veux, correspond à la séquence en acides nucléiques. La structure secondaire et tertiaire se réfèrent à la double hélice et ses conformations (ADN-Z, ADN-B, sur-enroulements, etc...).  [...]

[Immunologie] Idiotypie

Des anticorps anti-idiotypes peuvent apparaitre. en fait, de tels anticorps sont des anti-anticorps. Leur site de combinaison est complémentaire du site de combinaison de l'anticorps primaire, et sa structure spatiale est donc identique au déterminant antigénique spécifique de l'anticorps primaire.  [...] Les anticorps anti-idiotypes de ce type sont également appelés. image interne de l'antigène ou homo-anticorps. Idiotypes et anti-idiotypes forment un réseau de régulation dans l'organisme.  [...]

Sds-page

Je me demande si le SDS à un rôle différent selon sa concentration, ou son utilisation (en tampon ou en gel). Est -il possible qu'en plus de charger négativement les protéines, il les dénature plus ou moins suivant ces critères.   [...] Donc d'après vous, lors de ma révélation sur membrane avec des anticorps, mes anticorps reconnaissent mes protéines dans leur configuration d'origine (structure III) Je pensais qu'elles restaient sous conformation I.  [...]

[Biologie Moléculaire] Vrai ou faux : Daltons et taille moleculaire

Le terme taille s'applique à quelque chose de linéaire, non replié dans l'espace. Exemple, la taille d'une séquence nucléotidique ou d'une séquence en acides aminés (structure primaire).  [...] Dans un SDS PAGE tu dénature la protéine qui devient dès lors linéaire. Mais tu ajoutes aussi du SDS qui est un détergent ionique qui va charger négativement l'ensemble de tes protéines. Du coup, la charge globale intrisèque de la protéine n'entre plus en jeu dans la migration, seule la taille compte.  [...]