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[Biochimie] etude de proteine de liaison à l'ADN

A priori je dirai immunoprécipitation de la chromatine (ChIP), dont le principe consisite à fixer la séquence d'ADN à laquelle tu t'intéresse sur des billes d'une colonne de chromato, puis à faire passer dans cette colonne les protéines dont tu suspectes la liaison à la séquence considérée. Après élution, tu récupères la protéines liée.  [...] Selon les cas, tu peux vérifier quelle protéine interagit avec ton ADN en ajoutant a ton mix ADN+ protéines un anticorps dirigé contre ta protéine d'intéret. Dans ce cas deux solutions.  [...]

[Immunologie] Synthèse d'anticorps

Les genes fonctionnels des lymphocytes B s'expriment ce qui provoquent la production d'anticorps membranaires. Les protéines (différentes selon l'anticorps, donc selon les réarrangements) de la région variable de la chaine lourde d'un anticorps provoqueront la spécificité de l'anticorps.  [...] Cependant, comme les réarrangements sont différents, les séquences en acides aminés le sont aussi, donc les protéines ainsi codées sont différentes, ce qui est visible sur la partie variable de la chaine lourde et légère de l'anticorps, ces parties variables définissetn sa spécificité.  [...]

peptide signal et ribosomes libres

Je voudrais quand même préciser qu'une protéine peut contenir une séquence signal et ne pas aller au REG. Les protéines à destinée nucléaire, ou mitochondriale possèdent également des séquences signal. Pour les protéines à destination des mitochondries, il y a intervention d'une hsp70.  [...] Il est vrai que si une protéine ne possède pas de séquence signal, elle est dite résidente et reste dans le cytosol. Les séquences signal sont en général exisées sauf dans le cas des protéines nucléaires (ce qui se comprend très bien car lors de la mitose, la membrane nucléaire se rompt et les protéine cytosoliques et nucléaires sont mélangées...).  [...]

[Biologie Moléculaire] Réplication de l'ADN chez les eucaryotes SOS

De plus, je comprends pas ce que veut dire il y a un OH et un P dans le vide je ne visualise pas ce que cela signifie et je m'en demande les conséquences.  [...] Elle va ensuite lier le brin qu'elle vient de synthétiser avec celui qu'elle a devant elle (synthétisé par l'autre ADN pol.). elle fait la liaison entre le OH libre (du dernier nucléotide qu'elle a jouté) et le P libre (du premier nucléotide de la séquence suivante).  [...]

[Biologie Moléculaire] Introns et régulation

Les introns sont des séquences non codantes à l'interieur d'un gène, il existe cependant des séquences non codantes extragéniques. Donc est-ce que toutes les séquences non codandes entre intergéniques interviennent dans la régulation et pour ceux qui le sont régulent-ils tous en tans que séquence (cis) est-ce que toutes les séquences régulateurs qui agissent par l'intermédiaire d'une protéine régulatrices sont des gènes (avec un promoteur terminateurs introns exons.  [...] Tout d'abord, non, toutes les séquences non codantes extragéniques n'interviennent pas dans la régulation (ex. les minisatellites). Il en existe cependant qui interviennent dans la régulation de façon cis. pour faire très simple, imagine qu'elles ont une séquence particulière à laquelle une protéine A pourrait se lier, et celle ci se lierait à une protéine B elle même liée au niveau du promoteur.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gène Rapporteur

Si on garde une partie du gène, ce sera plus pour voir le positionnement de la protéine du gène. Au début du gène, il y a des séquences indiquant où doit aller ensuite la protéine, les fameuses séquences signal. Ainsi on pourra voir si la protéine va en surface de la paroi, à l'intérieur reste à l'intérieur, etc.  [...] si je comprends bien, si l'on veut connaitre la localisation de la protéine d'intérêt avec une séquence régulatrice(recombinaison homologue), il faut forcément que le transgène possède une séquence d 'ADN de localisation (ex.NLS qui soit identique à la séquence d'ADN de localisation de la protéine d'intérêt) et le gène rapporteur.  [...]

Biologie moleculaire

comment peut -on déterminer les séquences nucléotidiques interagissant avec une protéine par les expériences de protection.  [...] tu mets ta protéine candidate avec ton ADN ou ARN. Ensuite tu utilises une RNAse ou DNAse pour dégrader tout ce qui n'est pas protégé, puis tu retires toutes les protéines, et tu séquences les nucléotides qui ont été protégés.  [...]

[Biologie Moléculaire] Structure des protéines

Mais si, elle est présente dans 2 espèces totalement différentes, bien que l'on l'a nomme de la même façon, qu'elle assure le même role biochimique dans chacune des espèces et qu'elle agit de la même façon dans chacune des espèces. il y aura 2 séquences codantes au total pour la même protéine.  [...] Pour produire une protéine de plante en bactérie, j'ai du faire modifier et optimiser la séquence pour que les codons correspodent.  [...]

Informations sur ce fameux test vih

Il ne peut pas y avoir que des complexes immuns dans le prélèvement à cause de la stratégie du VIH. Celui-ci appelle la réponse immunitaire, pour mieux l'attaquer et se mettre à l'abri. Les anticorps sont produits en telle quantité (ce sont des protéines) qu'il est impossible que tout les anticorps puissent réagir avec le virus, il y en a trop.  [...] Il y a cependant des exceptions, hein. Par exemple, le test de détection du p24, qui est une protéine virale, n'est possible que lors de la primo-infection (3 à 12 semaines après infection). Après cet antigène virale disparaît (mais pas les anticorps). Pour cela que ce test est plus complexe.  [...]

[Biochimie] Conformation préférentielle des acides aminés ??

Donc si j'ai bien compris c'est une méthode empirique pour déterminer des éléments de structures secondaires connaissant la séquence d'un peptide ou d'une protéine.  [...] Donc ensuite ils ont construit un algorithme où tu rentres la séquences de ta protéine et le logiciel va prédire les éléments de structures secondaires de ta protéine.  [...]