• Forum - ADN, Encombrement, Protéines

l'encombrement stérique

Tu fais référence à l'ADN donc je suppose que tu fais référence à l'encombrement stérique empêcant certaines protéines de s'y fixer par exemple ou à certaines protéines déja fixées (les histones H1 par exemple).  [...] Cet encombrement stérique est causé par la structure 3D de ta molécule (ou de ton ADN) et empêche d'autres molécules de venir intéragir avec un site actif par exemple.  [...]

[Biologie Moléculaire] stabilité ADN

Les protéines du type Rec A chez les procaryotes ou Rad 51 chez les eucaryotes se lient à l'ADN et déforme la double hélice en en étirant le pas. Cet étirement rompt les interactions hydrophobes entre bases consécutives de la séquence et permet ainsi la rotation (Nishinaka et al 1998) Du fait son encombrement stérique, un groupement hydroxyle porté par le carbone 2 du sucre empêcherait cette rotation.  [...] Un ribose est donc incompatible avec un mécanisme de recombinaison homologue alors qu'un désoxyribose permet la rotation nécessaire à l'échange.. Ceci fait de l'ADN le seul acide nucléique compatible avec ce processus (Shibata et al 2001). Ces échanges d'ADN interviennent dans de nombreux phénomènes du vivant.  [...]

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

Comme il le précise en théorie rien n'est définitif. Pour ce qui est de la capacité d'un facteur à lier l'ADN, nous sommes dans un cas particulier. En effet, les protéines lient l'ADN grâce à des motifs en doigt de zinc. Ce sont des régions riches en cystéine qui, par regroupement de 4 cystéine ou 2 cystéines/2 histidines stabilisées par un ion Zn2+ permettent la formation d'une structure en boucle qui peut interagir avec le sillon majeur de l'ADN.  [...] A priori, s'il y a renaturation que de cette partie là, la protéine pourra lier l'ADN dans le cas où il n'y a pas d'encombrement stérique au niveau de la liaison.  [...]

[Evolution] mécanisme de correction des mutations génétiques, quelle utilité évolutive?

Je n'ai pas conaissance de flagrant déli d'erronage d'une traduction protéique, mais rien ne l'interdit Simplement ça me semble plus compliqué à survenir que pour l'ADN, parce que si ça s'apparie mal dans le ribosome, ça pourrait bloquer par encombrement à l'intérieur du ribosome et ainsi condamner l'utilisation du ribosome concerné.  [...] Des erreurs dans la transcription ou traduction ADN-. ARN-. Protéine surviennent sûrement, et avec une proba plus élevée, mais ce n'est pas grave car ce n'est qu'une protéine sur des centaines/milliers qui sera impactée, toutes les autres protéines identiques feront le boulot, on n'est pas à une unité près dans une cellule.  [...]

Saturation BSA pour purif de protéine His-tagged

En fait, ce que je sous entendais, c'est que, s'agissant de protéines, leur liaison soit rendu partiellement impossible de part un encombrement stérique dû à un changement de conformation.  [...] Salut, donc apparement en suivant sans intervenir (n'étant pas encore familier avec les protocols) ce serai un probleme de liaison aspécifique entre ta protéine et ta colonne que tu as globalement réglé en saturant à la BSA.  [...]

[Microbiologie] les virus

les lipides,membranaires de l'enveloppe peuvent être solubilisé certain produits peuvent provoque un encombrement stérique ou des changement informationnels irréversibles au niveau des protéines virales externes impliqués dans l'attachement aux récepteurs cellulaires d' après le site.et bonne journée.  [...] Vrai. L'activité antiseptique est due au pouvoir oxydant du chlore. Le mécanisme d'action est la destruction des protéines structurales et enzymatiques de la cellule.  [...]

[Biochimie] Acides aminés

- Au niveau des protéines humaines, tu retrouveras (me semble-t-il) par exemple, plus souvent de la leucine que de la cystéine donc l'occurrence de la leucine est plus importante que celle de la cystéine dans ce cas.  [...] Il me semble que cette question de pourcentage est relative à la fonction des protéines et donc à leur structure (primaire en l'occurrence hihi). En effet, si tu regardes la composition et l'encombrement de certains acides aminés, tu dois t'apercevoir qu'ils seront plus faciles à synthétiser, à transporter, à dégrader ou à recycler pour la cellule que d'autres.  [...]

[Biologie Moléculaire] synthese proteique

Yoyo est un spécialiste de ce genre de problème et il se fera un plaisir de te répondre... Je crois que tout est une question d'encombrement stérique du premier tRNA au niveau du ribosome (sauf si je me plante). Néanmoins, il me semble que certaines protéines n'ont pas la méthionine comme premier acide aminé... à confirmer.  [...] Il ne me semble pas que la traduction puisse commencer sans le codon initiateur AUG (codant pour la méthionine). Cpependant, toutes les protéines ne commencent pas par l'acide aminé méthionine, car celui-ci est ôté lors de la maturation post-traductionnelle, si je ne m'abuse.  [...]

[Biologie Moléculaire] Petite question sur la terminaison de la traduction

Même si une mutation annule ce codon STOP en revanche il y a toujours des signaux d'arrêt de la traduction, je pense notamment à la queue polyA des ARN messagers. Cette queue permet la fixation de protéines pour la circularisation des ARNm, si le ribosome arrive jusque là il va y avoir un encombrement stérique qui va amener le désassemblage du ribosome.  [...] par exemple tu parle de la polyadenylation, en l'occurence si le ribosome n'est pas arreté par des codons stop, la presence de la queue poly A ne change rien, AAA correspondant a une lysine, alors la proteine sera polylysiné en Cter, car normalement pour la traduction, des proteines vont aider le déplacement des proteines qui seraient fixés sur l'ARN (car il n'y a pas que sur la polyA que des proteines se fixent) et qui rendent l'ARNm bien  [...] la demi vie de l'ARNm car en presence d'exonucléase 3' elle comencera par ronger la polyA sans impacter la réelle sequence de l'ARNm, alors qu'on ariverait vite a digerer des parties codantes sans cette polyA et la demi vie serait réduite, ce qui signifie bien que cette poly A est tout de meme accessible aux enzymes et qu'il n'y a pas tout le temps des proteines gênantes empêchant l'acces a cette sequence.  [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

Le shift de phosphorylation est du à l'encombrement stérique du phosphate qui perturbe et retarde la migration de la protéine modifiée, dans le gel.  [...] Je dois dire que j'ai assez de mal avec cette idée. Je serais plus pour celle de gorben parce que vu que la protéine est linéaire je pense pas que ça rajoute beaucoup d'encombrement, surtout à une protéine comme celle de LXR qui possède 1863 acides aminés. Mais bon c'est que mon avis.  [...]