• Forum - Acides aminés, Liaisons, Hydrogène

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

- Nous avons dit dans le Cours 1 (Le phénotype dépend des protéines) que la structure des protéines est due aux affinités entre les différents acides aminés et dans le cours 2 (L'activité enzymatique) que la structure de l'enzyme (qui est une protéine) était due aux différentes liaisons liant les acides aminés.  [...] - Pouvez-vous m'apportez des précision svp sur les liaisons hydrogène liant les différents acides aminés et au niveau des ponts dissulfures se forment-ils à chaque fois qu'il y a deux cystéine Est-ce qu'il y a d'autres acides aminés qui provoquent la formation du pont dissulfure.  [...]

Acides aminés

Après t'as les deux acides aminés soufrés classiques. la méthionine et la cystéine. La cystéine est très connue pour faire les ponts disulfures au sein des protéines grâce à l'oxydation, entre deux SH. Comme le milieu intracellulaire est réducteur ça se fait à l'extérieur de la cellule.  [...] Et enfin la distinction acides aminés apolaires/polaires. il suffit de regarder la chaine carbonée et s'il y a présence de fonctions OH pour faire des liaisons hydrogène avec l'eau.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéine ou Chaine Polypeptidique?

De ce que j'ai compris, la chaine polypeptidique est la chaine contruite par le ribosome et l'ARNt durant la phase de traduction. Ce serait une chaine constitué de plusieurs acides aminés liés les uns aux autres tandis qu'une protéine aurait subi des liaisons covalentes (pont disulfures, hydrogène...).  [...] Effectivement, il est pratique de différencier des peptides (en quelque sorte, de petites protéines mais sans structure tertiaire) et les vraies protéines, celles avec un nombre d'acides aminés très grand, avec des repliements spatiaux, avec des centres actifs, etc.  [...]

[Biologie Moléculaire] structure des protéines

Structure secondaire. liaison peptidique entre un atome de carbone et un atome d'azote de deux acides aminés. liaison hydrogène entre les groupements C=O et N-H de 2 liaisons peptidiques.  [...] Dois-je plus particulièrement parler des hélices alpha, brins béta et des coudes aussi ou est-ce que ça rentre dans les liaisons hydrogènes.  [...]

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Les protéines qui se lient plus spécifiquement à l'ADN vont plutôt reconnaître la partie variable de l'ADN cad l'enchaînement des base. Dans ce cas, les protéines établissent plutôt des liaisons hydrogène avec les bases de l'ADN. Les acides aminés les plus mis en jeu étant ceux qui établissent le plus de liaisons hydrogène cad glutamine, asparagine et arginine.  [...] Pour l'ADN, les interactions sont différentes selon la base considérée, suivant les différents groupements chimiques qu'elle possède. Elles peuvent toutes établir des liaisons hydogène mais le nombre de ces liaisons peut varier, et les atomes sont donneur ou accepteur d'hydrogène suivant les positions.  [...]

[Biochimie] Liaisons Hydrogène acides aminés

Je me demande si un acide aminé donneur de liaisons Hydrogène peut créer une liaison hydrogène avec un autre acide aminé qui n'est ni donneur, ni accepteur Faut-il forcément un donneur et un accepteur.  [...] Pour en revenir aux acides aminés, et en se concentrant sur la chaîne R, une R polaire aura une liaison hydrogène bien plus faible avec une chaîne apolaire qu'avec une chaîne polaire ou même électriquement non neutre.  [...]

Liaisons H et ponts disulfure.

Il faut obligatoirement deux acides aminés cystéines (et donc deux atomes de souffre) pour faire un pont disulfure. Une liaison hydrogène se fait avec un hydrogène et un atome nucléophile (O par exemple).  [...] Pour les liaisons hydrogènes elle participent aussi à la stabilisation de la protéine mais aussi à la liaison entre l'enzyme et son substrat. Voit plutot les liaisons hydrogène comme une bande Velcro, si on à une liaisons hydrogène ca ne tient pas longtemps, mais si on multiplie les liaisons hydrogène ca devient de plus en plus stable.  [...]

[Biologie Moléculaire] acides aminés

Ces acides aminés polaires sone appellés aussi hydrophyles car il peuvent former des liaison de faible énegie. liaison hydrogène(résultat d'attraction entr l'interaction du dipole formé par le groupment polaire et clui du la laison oh fortement polarisée de l'eau).  [...] L'autre grande classe est celle des acides aminés apolaires ou hydrophobes dont les liaisons ne sont pas polarisés comme une liason c-H ou C-C, formant des chaines hydrocarbonées ou encore un noyau aromatique existant chez la phe qui est stabilisé par effet mésomère(déloclisation des életron des liaison pi) empechant toute interaction avec un groupement chargé.  [...]

protéine: hydrophile ou hydrophobe

En effet, un polypeptide résulte de la réaction de condensation de plusieurs acides aminés. Un acide aminé est un molécule composé d'un carbone central ( alpha ) lié à un atome d'hydrogène, à un radical R ( où R représente un groupement fonctionel ) ainsi qu'à un groupement amine et carboxylique.  [...] Quelque trucs pour t'aider. Tu regardes l'ionisation en fonction de ta solution ( tiens compte du potentiel hydrogène de ta solution ) des atomes qui constituent les acides aminés de ta protéine.  [...]

structure du collagène

je me demandais combien le collagène de type I compte d'acides aminés modifiés, et la nature des ces acides aminés ainsi que de leurs modifications, quelqu'un peut-il m'aider.  [...] l'article précise que les molécules de collagène sont liées entre elles par des interactions hydrogène, mais ne parle pas des acides aminés modifiés, à part l'hydroxyproline (j'ai lu l'article en diagonale, j'en ai peut-être ratés certains).  [...]