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Définition | CRISPR - CRISPR-Cas9 - Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats | Futura Santé

Les séquences CRISPR sont des répétitions trouvées dans le génome bactérien et correspondent à des séquences de virus. Il s'agit d'un système de défense qui garde la mémoire de l'agression d'un virus. Les ARN codés par CRISPR se lient à l' enzyme Cas9 qui peut couper l' ADN du virus.  [...] La communauté scientifique est divisée au sujet de ses applications car le CRISPR pourrait être utilisé pour empêcher des maladies génétiques de l' embryon. En avril 2015, des chercheurs ont annoncé qu'ils avaient testé la technique sur des embryons humains, soulevant ainsi de nombreuses questions éthiques.   [...]

Réflexions sur les épidémies

Tout porte à croire qu'un équilibre fiable existe entre le système immunologique humain et les virus naturels. Rompre cet équilibre pourrait avoir des conséquences imprévisibles.  [...] Et on a pas abordé dans cette discution les effets positifs pour l'hôtes des virus. Il y aurait beaucoup à dire, mais on peut se demander si il n'y a pas eu souvent des domestications par les cellules des virus et des fonctions qu'ils codent. D'ou la présence d'autant de génome ou de fragment de génome de virus inactif dans presque tout les génomes qui ont été séquencés aujourd'hui.  [...]

Virus = vivant ???

A mon avis tu extrapole un peu trop, la simplicité d'organisation des virus est la conséquence de l'utilisation/détournement de la machinerie cellulaire de son hôte. De nombreux parasites cellulaires, comme certaines bactéries ou certains champignons, ont elles/ils aussi des petits génomes, codant moins de fonctions que leurs cousines/cousin non-parasite.  [...] Il me semble aussi que lors du sequencage du genome humain, on a retrouve de nombreseuses sequences virales defectives, comme si de tresnombreux retro virus s'etaient integres dans les chromosomes et avaient perdu leur capacite de s'exciser... les virus comme moteur de l'evolution.  [...]

E1A ?

je suis resté évasif sur la subastance en question E1A... Après une petite recherche sur google, il s'avère que son nom est bien E1A, une protéine, et est utile pour le gene expression (je sais pas comment on dit en francais, peut etre que le nom de la protéine en francais n'est pas le meme...).   [...] C'est un transactivateur, c'est-à-dire que cette protéine va reconnaitre des séquences sur le génome viral et recruter les facteurs cellulaires pour forcer la cellule à transcrire le génome viral (donc fabriquer des protéines virales) plutôt que le sien. C'est une molécule-clé pour le virus évidemment.  [...]

[Biologie Moléculaire] oncogène, pro-oncogène

Certains virus animaux sont capables d'induire des tumeurs (ex. sarcome de Rous du poulet, découvert en 1911). Les propriétés transformantes de ces virus sont dues à la présence dans leur génome de séquences particulières, les oncogènes viraux (v-onc). Ces gènes renferment à eux seuls toute l'information pour l'activité transformante.  [...] Ces gènes sont des formes altérées de gènes normaux d'origine cellulaire, les proto-oncogènes, capturés par les rétrovirus au cours de leur réplication. Ces proto-oncogènes sont conservés dans toutes les espèces (de l'insecte à l'homme) et jouent un rôle essentiel dans l'embryogenèse, dans la transcription de l'ADN.  [...]

Coronavirus : vers un vaccin contre MERS-CoV

À partir des séquences génétiques du virus, les auteurs ont conçu des clones d' ADNc, c'est-à-dire la séquence d' ADN codante complémentaire à l' ARN viral, équivalente à ce qui va être lu par la machinerie cellulaire. Ce génome a été inséré dans un chromosome bactérien artificiel.  [...] Des mutations au niveau des gènes 3, 4a, 4b ou 5 n'altèrent pas les propriétés infectieuses du coronavirus. En revanche, une mutation dans la protéine d'enveloppe (protéine E) change la donne. si MERS-CoV continue à pénétrer dans la cellule et à répliquer son génome, il devient incapable de sortir pour contaminer les cellules voisines, ce qui le rend inoffensif car l'infection ne peut plus se propager.  [...]

SRAS : le retour de la pneumonie atypique au Canada ?

Jusqu'à présent les efforts pour cultiver ce mystérieux virus ont été vains mais les chercheurs ont annoncé que 800 nucléotides provenant de 4 régions du virus ont été séquencés à partir de virus isolés dans 8 échantillons. Pour 7 des échantillons les séquences se sont révélées totalement identiques à celles du virus du SRAS, pour le huitième échantillon une seule différence a été observée.  [...] Il est donc possible que ces nouveaux cas de pneumonies soit dû à une variante atténuée du virus du SRAS. Il est aussi possible que la très grande similarité observée entre les séquences de ce virus et celui du SRAS, ne soit en fait qu'une conséquence des techniques utilisées pour amplifier et sequencer le génome de ce virus.  [...]

Hépatite B : le plus vieux virus jamais séquencé

Deux études récentes ont réussi à identifier et séquencer le génome d' anciens virus de l' hépatite B. La première, mise en ligne le 10 mai 2018 sur le site bioRxiv (où les chercheurs partagent des versions encore non publiées de leurs travaux), émane d'une équipe menée par Ben Krause-Kyora et Johannes Krause.  [...] Pour reconstituer les génomes des virus, Eske Willerslev et ses collègues ont un peu fouillé les poubelles, plaisante le chercheur. Ils ont en effet analysé les séquences qui avaient été éliminées parce qu'elles n'appartenaient pas au génome humain. C'est à partir de ces morceaux que l'on peut reconstruire les génomes des virus, un peu comme un puzzle, résume Eske Willerslev, cité par The Atlantic.  [...]

Séquençage du génome du virus de la pneumonie atypique

Une équipe de chercheurs Canadiens a publié samedi dernier, la séquence complète du coronavirus suspecté d'être responsable de l'épidémie atypique qui sévit actuellement dans le monde. Le séquençage du génome du virus devrait permettre le développement de nouveaux tests de diagnostic ainsi que la mise au point d'un éventuel vaccin.  [...] La séquence confirme les résultats antérieurs sur l'origine du virus. Une boucle d' ARN à l'extrémité 3' du génome rapproche ce virus du virus de la bronchite infectieuse aviaire (IBV), qui touche principalement les dindes et les poulets. Certaines séquences d' ADN présentent des similarités avec le coronavirus de bovin ou avec le coronavirus causant des hépatites chez la souris.  [...]

Le séquençage de l'ADN pour les nuls !

La possibilité de séquencer le génome est le fruit d'un travail de longue haleine, développé par de nombreux scientifiques inventifs. Futura-Sciences décrypte pour vous, et en images, les étapes clés du séquençage.  [...] Pour séquencer un génome, qui comporte des milliers de paires de bases pour les plus petits virus, à quelques milliards pour l'Homme ou certaines plantes, il faut donc pouvoir réaliser de multiples séquençages. Il faut ensuite reconstituer l'ordre des fragments obtenus par recouvrement des séquences.  [...]