• Santé - Techniques, Séquence, Protéine

[Biochimie] Méthode d'études AA et protéines

Pour séquencer une protéine il faut bien sûr l'isoler et la purifier avant, mais ce sont pas des techniques de séquençage proprement dites.  [...] En fait, grâce aux hydrolases par exemple, dont tu connais les sites de coupures, tu vas pouvoir générer différents peptides à partir de la même protéine. Après le séquençage de ces différents peptides, tu vas pouvoir recouper les informations car certains peptides vont se chevaucher. Tu obtiendras ainsi ta séquence primaire.  [...]

L'expérience mystère..

Donc le Blast peut se faire mais si on découvre certaines annotations qui pourraient se rapprocher de la réalité, il faut confirmer par une technique. Donc que peut-on chercher sur la séquence du fragment, quelles annotations peut-on mettre, et quelles techniques utiliser pour déterminer leur nombre (si elles peuvent être plusieurs) et leur position.  [...] Vu que personne répond quand même, je dis quel était le premier gros point auquel je pensais. Vu que c'est des annotations de séquence génomique, je pensais tout simplement à toutes les techniques permettant de déterminer la structure d'un gène, et pour ça ya une grosse partie qui peut se faire sans passer par l'expression de la protéine codé par le gène.  [...]

La microscopie à 2 photons et le mouvement des proteines

Ou les auteurs visualisent sans fixation le mouvement d'une protéine cytoplasmique en temps reel, grace a deux techniques de microscopie. Le FRAP et microscopie à 2 photons.  [...] En utilisant la microscopie confocale simple ou a 2 photons, on peut aussi visualiser en temps reels l'interaction de deux proteines dans une cellule au cours d'un evenement biologique (technique de FRET). Ces techniques (FRET, FRAP, FLIP...), ont revolutionne la facon de penser les processus biologiques (et tout ca, essentiellement grace a la caracterisation d'une proteine naturelle fluorescente extraite d'une meduse, la GFP).  [...]

[Biologie Cellulaire] Techniques de localisation d'une protéine

J'aimerais savoir s'il existe des techniques pour étudier le transport d'une protéine entre le noyau et le cytoplasme, autres que les protéines de fusion GFP et l'immunolocalisation J'ai cherché des articles mais les techniques qui reviennent à chaque fois sont ces deux-là, je ne parviens pas à en trouver d'autres.  [...] En fait je vous explique un peu mieux mon sujet, on doit trouver différentes stratégies pour étudier le transport nucléo-cytoplasmiques de protéines, sachant qu'on doit trouver des exemples de ces stratégies chez un modèle animal (ou levure) et chez un modèle végétal.  [...]

Alzheimer : un nouveau gène impliqué dans la forme précoce identifié

La maladie d'Alzheimer est rare sous sa forme précoce, mais elle existe. Comme chez les patients plus âgés, elle se caractérise par une accumulation de protéines au niveau des neurones, dont la bêta-amyloïde qui va former des plaques amyloïdes. Benedict Campbell, Wellcome Images, Flickr, cc by nc nd 2.0.  [...] L' étude du génome des patients des 14 familles, grâce aux nouvelles techniques de séquençage complet de leur ADN, a permis de mettre en évidence des mutations sur un nouveau gène SORL1. Le gène SORL1 code pour une protéine impliquée dans la production du peptide bêta-amyloïde.  [...]

Protéines de surface de l'Hépatite B. Help!!!!

Je cherche des sites où l'on peut trouver la séquence du virus de l'Hépatite B et en particulier des protéines de surface (PréS2, PréS1 et S)...Je sais que ça existe parce que j'avais trouvé un site qui était une véritable mine d'or mais malheuresement, je n'arrive pas à le retrouver et ça fait plusieurs jours que je m'acharne ( j'avais noté l'adresse mais plusieurs évènements ont fait que je ne l'ai plus...).  [...] Mais ça n'est pas exactement ce que je recherche. J'ai beaucoup de site mais pas un seul ( à part le deuxième que tu m'a donné) qui me donne des détails (très) techniques sur les protéines de surfaces et notamment leur séquence...et ça me fait enragé parce que j'en avais trouvé un mais comme je l'ai dit dans mon premier message, je l'ai perdu.  [...]

[Biochimie] Isolement des protéines du périplasme de Bactéries + Test d'activité spé d'une protéine en SDS-PAGE

Pour isoler le périplasme et prouver que cette protéine est dedans ils utilisent deux techniques qu'ils disent complémentaires.  [...] Alors je pense que c'est plutôt une histoire de vocabulaire, mais pour prouver la localisation de la protéine dont ils étudient l'adressage, les auteurs parlent toujours de tester l'activité spécifique de SodA par SDS-PAGE ou autres techniques d'électrophorèse.  [...]

[Biochimie] modification génétique

En gros, l'une des techniques est de couper de façon spécifique la séquence qui nous intéresse, et de la remplacer par la séquence qu'on veut rajouter.  [...] Je ne sais pas comment le pavot par exemple (exemple... intéressant) produit son alcaloïde, mais je peux supposer sans trop de difficultés que ça nécessite plus d'une opération. Donc modifier cet alcaloïde peut rapidement signifier modifier plus d'une séquence d'ADN, rendant l'opération plus difficile à réaliser et à rendre viable par la suite.  [...]

Petite énigme à vous soumettre...

M'étant spécialisé ces derniers temps sur les techniques d'études protéine/ligand en RMN, je me propose de mieux te convaincre de mon raisonnement.  [...] Le coût, j'en conviens, est important, car la méthode demande des concentrations de ligand importantes (ratio de 1 protéine pour 300 ligands par exemple...). mais elle est utilisée. Si la méthode RMN te rebute, et que tu préfères des techniques plus simples de caractérisation de Kd et de Ki (par des tests in vitro ), j'ai envie de dire que ces tests restent insatisfaisants, car ne reflètant pas d'informations très poussées sur l'intéraction protéine-ligand, comme une cartographie des groupements mis en jeu dans le ligand, par exemple.  [...]

[Biotechnologie] Race PCR

A partir la séquence 5' de l'ADNc, on peut alors designer des primers spécifiques et cloner le gène concerné. Là c'est vraiment une finalité concrète. D'ailleurs en cours j'avais appris les innombrables techniques de RACE (car y en a pas qu'une) dans le cadre de l'apprentissage du clonage moléculaire.  [...] Mais à partir de la séquence 5' de l'ADNc normalement on le connait puisqu'on n'a jamais d'intron au début d'un pré-ARNm. Si quelqu'un passe ici et qui a les souvenirs plus frais que moi sur ces techniques de bio mol, qu'il n'hésite pas.  [...]