• Santé - Substrat, Enzyme, Acides aminés, Site

les enzymes catalyse de la réaction enzymatique

Les acides aminés ont des propriétés propres, ainsi une suite d'acides aminés précise prendra dans l'espace une conformation précise (pour faire simple). Donc chaque enzyme à une conformation spatiale qui lui est propre, car une séquence d'acides aminés qui lui est propre.  [...] L'enzyme agit sur le substrat au niveau du site actif (une portion de l'enzyme qui agit avec le substrat). Tu comprends que si la séquence an acides aminés (la strucutre primaire) change, tu risques de changer la strucutre spatiale du site actif. Ton enzyme ne peut plus réagir avec le substrat, elle ne remplit plus son rôle.  [...]

[Biologie Moléculaire] Site actif d'un enzyme.

Le site actif est la région de l'enzyme où à lieu la réaction qu'elle catalyse. C'est là que le substrat de l'enzyme va être transformé en un nouveau produit en réagissant avec le ou les acides aminés de ce site.  [...] Le site de liaison est une poche définie par un ensemble d'acides aminés. suivant la nature de ces acides aminés (aa), seuls certains substrats seront capables de ce placer dans cette poche. Imaginons que ton site de liaison soit petit et possède des aa chargés négativement.  [...]

[Biologie Moléculaire] enzyme

Bonsoir, Ce sont tous les deux des enzymes protéolytiques mais ils sont différents par leur séquence d'acides aminés et par conséquent, leur structure 3D est différente. La structure est importante notamment au niveau du site actif. Imagine que le site actif soit une serrure et que le substrat soit une clé.  [...] Si la clé entre bien dans la serrure alors le substrat est fixé au niveau du site actif et l'enzyme peut agir. La trypsine et la chymotrypsine ont des serrures différentes.  [...]

[Biochimie] Spécificité de substrat , spécificité d'action

Si le substrat et l'enzyme établissent des interactions suffisament importantes, et si le substrat possède la bonne conformation, alors le site actif, généralement de 2-3 acides aminés, pourra jouer son rôle de catalyseur.  [...] C'était une mauvaise idée, l'enzyme dispose de moyens de contrôle et le dégrade. Pourtant, s'il a pu pénétrer à proximité du site actif, c'est que l'enzyme peut se lier à plusieurs acides aminés, structurellement proches.  [...]

plusieurs questions avant mon DS

La geométrie dans l'espace de ce site actif est complémentaire de la géométrie du substrat ce qui garantit la spécificité. De même ce sont les acides aminés qu'on trouve au niveau de ce site qui vont réaliser la réaction catalysée par l'enzyme. On peut donc expliquer au niveau moléculaire la double spécificité.  [...] et le code génétique définit 64 possibilités, dont 3 codons stop. en réalité, il n'y a que 61 combinaisons correspondant à des acides aminés, certaines combinaisons donnant le meme a.a, c'est pourquoi on dit que le code génétique est redondant.  [...]

peptide + feuillet beta et proprietes

on me dit.ce peptide est la sequence substrat d'une enzyme cellulaire. imaginez la zone de fixation des acides amines composant la zone de fixation de ce peptide et eventuellement, la structuration globale de cet enzyme qui fixe ce peptide. là je ne comprends même pas la question.  [...] est ce que je dois imaginer la zone de fixation du peptide qui servira de substrat (c'est a dire un autre morceau du peptide avec les AA que j'ai donnés) ou est ce que je dois determiner la nature de la zone de fixation de l'enzyme si c'est celle de l'enzyme je me disais qu'il faut des AA chargés + mais je ne vois pas quelle devra etre sa structuration.  [...]

[Biochimie] Problème de compréhension de la catalyse enzymatique

Grâce au concours de plusieurs acides aminés et/ou cofacteurs, l'enzyme conditionne le substrat pour que la réaction se fasse de manière optimale. Pour que cela soit possible spontanément, il faut élever la température pour augmenter l'agitation thermique (Brownienne) pour augmenter le nombre d'interactions avec les molécules adéquates.  [...] L'enzyme diminue donc cette énergie grâce à la constitution d'un micro-environnement catalytique au sein de l'enzyme. les acides aminés et cofacteurs sont disposés de manière spatialement optimale pour la catalyse de la réaction.  [...]

[Biologie Moléculaire] Conditions de la catalyse enzymatique ? interprétations?

L'enzyme possède un site catalytique qui de part sa structure 3D permet de positionner le substrat parfaitement dans l'espace pour que les réactions chimiques puissent avoir lieu. Donc l'eau ne peut pas faire ça je pense.  [...] Donc si elle est dénaturé, les liaisons peptidique de sa sequence d'acides aminées sont coupées. Mais si on remplace par exemple une solution avec substrat + enzyme qui était a 80° dans un milieu a 37°. est ce que l'hydrolyse du substrat va se réaliser ou bien non puisque la molécule est déformée et dénaturée.  [...]

enzyme et fonctions???

Cela est dû à deux choses. présence d'un site de reconnaissance (spécificité de substrat), et d'un site catalytique (spécificité d'action). La séquence du gène donne la séquence d'acides aminés, qui donne la configuration de la protéine dans l'espace, qui lui donne sa fonction.  [...] Oui mais ne jouons pas sur les mots. Affirmer qu'il y a une spécificité de substrat et de réaction, meme si la plupart du temps c'est vrai, c'est un abus, simplement. Parce que ce qu'on apprend en lisant cela, c'est que UNE ENZYME = UNE REACTION avec UN SUBSTRAT, et c'est faux suffisamment souvent.  [...]

[Biochimie] Inhibiteur allostérique

Plutôt que de se lier sur le site actif de l'enzyme où se déroule la réaction, comme c'est le cas d'un inhibiteur compétitif, l'inhibiteur allostérique se lie sur un autre site de l'enzyme (dite alors enzyme allostérique) et changer sa configuration / conformation, de façon telle qu'elle ne possède plus la même affinité pour son substrat.  [...] Oui c'est bien ça, c'est un inhibiteur non compétitif justement car il ne se lie pas sur le site actif de l'enzyme (le site actif = le site sur lequel se fixe le substrat).  [...]