• Santé - Structures, Protéines, Analyses

diffraction des rayons X

La diffraction des rayons X permet d'établir la structure des molécules en 3D. Pour cela il faut obtenir un monocristal de la substance que l'on veut étudier. C'est ce monocristal qui va faire diffracter les RX. Une fois mesurés l'intensité et la direction des rayons diffractés, on peut, (après quelques petits calculs…) remonter à la position des atomes dans l'espace.  [...] En biologie ce sont surtout les structures des protéines qui sont ainsi analysés (c'est un gros travail…).  [...]

[Biologie Moléculaire] ChIP

Recent advances leave no doubt that higher order chromatin structures play a fundamental role in many developmentally important mechanisms of gene regulation. In particular analyses in genetic model systems like yeast andDrosophilauncovered novel proteins that are involved in the regulation of chromatin structures.  [...] Here we present a method that preserves the architecture of the higher order chromatin structures by cross-linking cellsin vivowith formaldehyde. An immunoprecipitation strategy is then used to identify the DNA targets of chromosomal proteins of interest.  [...]

Expression de gènes

Enfin, le système d'épissage des ARN messager permet de faire augmenter énormément le nombre de protéines différentes ainsi que leur fonction. Sans compter les modifications post-transcriptionnelles... Heureusement, tous les gènes ne sont pas exprimés en même temps dans la cellule, seul une petite partie.  [...] Plus sérieusement, il m'arrive de devoir identifier des protéines suite à des analyses. Si je me contrefiche du niveau ADN et ARN, la structure de la protéine, ses interactions probables et sa fonction m'intéressent beaucoup plus. Je n'utilise donc pas tout les jours cette database. Mais vu qu'elle est toujours utile.  [...]

Régime sous haute surveillance

Ils ont ainsi analysé les conséquences d'une quinzaine de régimes, sélectionnés parmi les plus populaires (Atkins, Dukan, Ornish...). Les régimes analysés peuvent être classés suivant les apports qu'ils confèrent en macronutriments ( glucides, lipides, protéines ).  [...] Diagramme ternaire des contributions des glucides, lipides et protéines à l'apport énergétique total pour les femmes. Les différents régimes analysés sont positionnés sur le diagramme en fonction de leurs apports en macronutriments. Les apports nutritionnels conseillés (ANC) sont également indiqués (lignes pointillées et triangle gris). Anses.  [...]

Une technique douce pour repérer les tumeurs du sein

Cette méthode permet de faire bien d'autres choses. On l'utilise par exemple au laboratoire pour l'étude du fonctionnement cérébral chez l'animal. Alors que les analyses par rayons X donnent de belles images montrant les structures anatomiques, l'imagerie optique diffuse renseigne sur l'activité métabolique, permettant même d'estimer la consommation d'oxygène ou la densité des tissus.  [...] Les résultats montrent que les techniques d'analyse mises au point repèrent bien la présence de tumeurs et donnent suffisamment d'indications sur l'activité métabolique pour distinguer si elle est maligne (donc dangereuse) ou bénigne. De plus, expliquent les chercheurs, les résultats de l'examen peuvent venir compléter une chimiothérapie destinée à réduire la tumeur en permettant de suivre précisément les effets du traitement, et donc de l'ajuster au besoin.  [...]

[Biologie Moléculaire] P53 et réparation de l'ADN

Pour le vérifier, ces domaines peuvent être découpés, interchangés, insérés dans d'autres protéines ou analysés comme des entités distinctes. Appliqué à p53, ce découpage linéaire a permis d'identifier 4 grandes fonctions, chacune localisée dans un fragment distinct de la molécule (figure 1 haut).  [...] Pour ce qui est de l'apoptose, P53 inhibe aussi l'expression des gènes anti-apoptotiques comme Bcl-2, et en gène pro-apoptotiques, il n'y a pas que Bax mais aussi Bak, Bim et Bid qu'elle active tout autant. Autre chose c'est que P53 permet de séquestrer des protéines anti-apoptotiques pour favoriser le déclenchement de l'apoptose.  [...]

Les bases constituant les protéines

Merci bien pour la réponse rapide qui regroupe les principales techniques d'analyses des protéines. Je vais chercher sur google quelque précisions sur la spéctro et la RMN et je pense que ca me suffira car en effet on rentre dans des choses très complexe après.  [...] En effet, ne faisant plus de structure poussée, je ne suis plus au parfum de l'actualité et des techniques structurales. Je suis resté au niveau L3 structurale de ce côté là... C'est sûr que j'imagine mal mettre une grosse protéine du style Récepteur Tyrosine Kinase directement dans la MS/MS.  [...]

Un virus géant, Mollivirus, renaît du sol gelé après? 30.000 ans

Son génome est énorme pour un virus. 651.523 paires de bases dans son ADN (contre une dizaine de milliers pour ceux de la grippe ou du Sida ). Il est puissamment original. une fois la multiplication terminée, il embarque près d'une centaine de protéines, un record absolu, et, qui plus est, onze d'entre elles font partie des composants des ribosomes, cette machinerie qui sert à fabriquer des protéines à partir des informations venues de l' ADN, ce que, justement, un virus ne sait pas faire.  [...] Avant que ces techniques n'existent, il aurait fallu cinq ou six ans pour faire ce travail. Ces analyses ont bien montré l'originalité de ce grand virus mou. En tout, il fabrique plus de 500 protéines dont la plupart ne se retrouvent pas dans les autres virus géants.  [...]

CFTR humaine

J'ai bien cherché dans toutes les banques de protéines de je connaisse, je me suis perdu dans des analyses complexes de molécules aux noms indescriptibles, mais je n'ai pas trouvé le fichier type Rastop (.pdb) correspondant à la CFTR humaine (la protéine en cause dans la mucoviscidose).  [...] .. Ou plutôt si, mais il s'agit d'une version théorique (nbd1) et pas d'un profil de la molécule réelle. Je ne comprend pas puisqu'on trouve la deltaF508 réelle.   [...]

Les armes secrètes du terrible virus de la grippe espagnole

Le responsable de la plus terrible épidémie de l'histoire, qui a tué des dizaines de millions de personnes entre 1918 et 1919, déclenche chez ses victimes une folie autodestructrice du système immunitaire. Grâce à la reconstruction du virus, les mécanismes génétiques sous-jacents commencent à être élucidés, donnant des idées pour lutter contre la grippe aviaire. Mais fallait-il ressusciter ce serial killer.  [...] Les scientifiques ont utilisé les techniques dite de génomique fonctionnelle, consistant à étudier non seulement la composition des gènes mais aussi leur traduction en protéines et leurs interactions. Nos analyses révèlent des mécanismes possibles, explique Michael Katze, responsable au sein de l'équipe des études génomiques et qui a travaillé précédemment sur la souris.  [...]