• Santé - Structures, Fonction, Séquence

[Biologie Moléculaire] Structures

- La structure primaire, c'est la séquence en acide aminés. En fonction de la nature des groupements ( -R ) des acides aminés présents, des structures secondaires peuvent se former ou non. Certaines séquences favorisent plus facilement telle ou telle structure secondaire du fait de l'encombrement et des charges des groupements des AA qui la forme.  [...] De même, la capacité de la protéine à former des structure tertiaire dépend de sa séquence, c'est à dire de la nature et de l'enchaînement des AA qui la constitue. Il faut une certaine alternance d'AA hydrophiles et hydrophobe pour former un feuillet Beta puis ensuite pour pour faire en sorte que ce feuillet se positionne de façon optimale pour la fonction de la protéine.  [...]

[Biochimie] Arn

Rien n'empêche physiquement l'ARN de former des homodimères (ARN/ARN) ou des hétérodimères (ARN/ADN), c'est même un processus courant indispensable à certaines fonctions biologiques.  [...] Les ARN de transfert ou ribosomiques prennent par exemple des structures 3D indispensables à leur fonction grâce à des séquences palindromes permettant la formation de structures double-brin.  [...]

[Biochimie] structure secondaire des proteines

je sais que la structure primaire détermine la structure tertiaire(tridimensionnelle) d'une proteine, mais est-ce qu'elle determine aussi sa structure secondaire la phrase suivante tirée de mon cours me met le doute un polypeptide peut presenter de nombreuses structures secondaire en fonction de sa séquence.  [...] Il y a ensuite les structures secondaires, qui sont locales, (souvent les protéines en présentent plusieurs). Ce sont les hélices alpha, feuillets béta ou alors ce qu'on appelle random coil lorsqu'il n'y a pas vraiment de structure. Ces structures secondaires peuvent ensemble former la structure tertiaire qui constitue une protéine lui permettant notamment sa fonction et sa spécificité pour une autre protéine ou un autre molécule biologique (ADN par exemple pour les facteurs de transcription).  [...]

[Biologie Moléculaire] [biologie moléculaire] Swissprot

Ici c'est son numero d'accesion dans les bases de donnees. Lors de la soumission de la sequence la banque donne un numero automatique a la sequence. ce numero est unique et permet de retrouver ta sequence. Si plusieurs morceaux de proteines ont ete sequencees independament tu peux avoir plusieurs numeros (a toi de trouver celui qui correspond a la proteine entiere).  [...] FT. J'en suis pas sur mais celà doit donner des informations sur la séquences primaire tel que le site actif, site de fixation d'un ligand, zone d'épissage alternatif potentiel etc etc...). A vérifier.  [...]

[Evolution] Molécules homologues

Les structures 3D sont beaucoup moins variables que les séquences et je crois que la dernière classification des différents types de structures (hélices, feuillets, tonneaux) et groupes de structures fait état d'une diversité d'environ 600 éléments. Donc en gros beaucoup de protéines vont avoir la même structure sans avoir la même fonction donc dire que deux protéines ayant une homologie de structure sont homologues me choque car pour moi la véritable homologie est avant tout fonctionnelle (et c'est pour cette raison que j'approuve complètement la deuxième partie de ta phrase sur les domaines, car toujours selon moi c'est le domaine qui fait la fonction peut-être avant la structure même si les deux sont importants).  [...] Si on decide qu'une structure determine une fonction, on peut essayer de descendre d'une similarite de structures vers une homologie de sequences. Mais parler d'homologie de structures... C'est toujours delicat, il y a trop d'approximations.  [...]

transposon

Un transposon composite comporte d'autre gènes que celui de la tranposase. Sinon, on parle simplement de séquence d'insertion (IS), enfin il me semble que c'est ça.  [...] Seul les intégrons sont classifiés en fonction de leurs structures. Les intégrons sont composé d'une intégrase, d'un site d'intégration (att) et d'une cassette de genes. Il y a 3 classes d'intégrons. en fonction de leurs contenus en gène et de l'identité des séquences flankantes.  [...]

[Evolution] Evolution: Apparition du système nerveux et mouvement - Page 2

Après, l'idée que le mouvement nous apparait à nous comme un avantage sélectif et que le système nerveux est étroitement corréler dans le temps à son apparition est peut être un piège. Je m'explique. Apparemment nombre des fonctions qui nous caractérisent ne sont pas supportées par des structures qui avaient cette fonction à la base.  [...] Apparemment nombre des fonctions qui nous caractérisent ne sont pas supportées par des structures qui avaient cette fonction à la base. C'est l'idée d'exaptation que suggérais Aquilegia, l'idée que les structures ne sont pas apparut pour la fonction qu'ils occupent aujourd'hui.  [...]

[Divers] But biologique de la vie. - Page 2

Perso, je pense vain d'essayer de voir l'un des niveaux (comme les gènes) comme maître et les autres comme des conséquences. Cela me paraît plus clair d'appréhender les différents niveaux (gènes, structure cellulaire, populations, lignées, etc) comme interagissant sans hiérarchie, le tout formant un système qui fonctionne et se perpétue composé de sous-systèmes qui eux-mêmes fonctionnent et se perpétuent avec (grâce à ) interfonctionnements.  [...] La Nature laisserait-elle survivre des structures biologiques (en l'occurrence, des êtres vivants) qui n'auraient aucune fonction biologique à accomplir.  [...]

[Biochimie] recombineering...

Par contre l'idée d'utiliser une séquence IRES semble plausible, se système existant bien chez les droso (voir Pubmed. drosophila ires). Tu pourra tester ta construction chez la levure ou autre culture cellulaire avant de te lancer, pour voir si ton rapporteur est bien traduit.  [...] je ne connais pas la proportions d'ARN qui n'ont pas ces structures, mais je pense que je vais partir du principe que mon ARN les contient, et je vais juste mettre une séquence kozak bien placée avant le rapporteur peut être, mais des gars de mon labo me disent que c'est pas la peine, car parfois ça fonctionne sans.  [...]

[Biologie Cellulaire] Histoire de Lamarck

On retient de lui que les structures d'un organisme changent en fonction de l'utilisation de ces structures et ces modifications sont héréditaires.  [...] C'est l'action extérieure du milieu, pour lui, et la sollicitation ou non de certains organes ou parties du corps qui provoque leur transformation, transmise à la descendance (d'où le cliché sur la girafe). Les variations dans une espèce ne sont donc pas pour lui un point de départ, mais une conséquence.  [...]