• Santé - Stage, Demande, Plasmide, Protéine, Souche

[Génétique] Experience temoin gene delete

Voila je travaille sur la fonction d'une proteine chez la levure. J'ai suivi la croissance de deux souches (sauvage et mutee*, la mutation correspondant a la deletion de la proteine etudiee) et observe une difference du taux de croissance. Bref.  [...] Pour me constituer un temoin, mon tuteur de stage m'a demande d'apporter via un plasmide le gene de la proteine etudiee dans la souche deletee (et donc normalement retablir le phenotype sauvage. Et ainsi s'assurer que la difference observee entre ces deux souches est bien due a la deletion de la proteine et non pas a un effet que pourrait avoir le fait d'enlever simplement le gene (pour exemple deregler un autre gene).  [...]

[Biologie Cellulaire] CSM et pcdan 3

Je commence un nouveau stage depuis peu et le labo travaille sur des cellules souches mésenchymateuses. Une manip consiste à les transfecter stablement avec le plasmide pcdna3 ou pcdna3.1 afin d'exprimer stablement une protéine (donc sous contrôle du promoteur fort CMV).  [...] Le soucis est qu'ils ont pu remarqué depuis quelque temps l'expression du gène tend à diminuer au bout d'un moment, et que donc l'expression constitutive ne l'est plus tant que ça.  [...]

[Biochimie] Docking Protéine-Ligand

Je fais un stage sur la contextualisation du docking moléculaire. J'aurais voulu savoir si des personnes s'y connaissaient et pour celles-ci si elles pouvaient m'expliquer le déroulement du procédé de docking. Concrètement on vous demande de docker telle protéine, quelles démarches allez-vous effectuer A propos des protéines, y a-t-il un palmarès des protéines les plus dockées.  [...] En fait, je cherche à savoir exactement ce que font les bioinformaticiens quand ils doivent docker des séries de ligands aux protéines. On s'intéresse pour l'instant à l'étape précédant le docking. Comment préparent-ils la structure de la protéine Y a-t-il des règles générales (enlever des molécules ou des atomes) ou bien c'est au cas par cas Dans le cas par exemple de la protéine neuroaminidase du virus H5N1, que font-ils exactement Quels logiciels utilisent-ils pour préparer la protéine et pourquoi ces logiciels et pas d'autres Quelles sont les raisons de ces choix De nombreux logiciels existent et sont plus ou moins utilisés pourquoi.  [...]

[Génétique] Tale nuclease

D'accord, merci bcp pour votre réponse mais pour ce qui est de l'utilisation des ARNm. de quoi le plasmide doit être constituer.  [...] oui effectivement on a deux plasmides qui sont déjà prêt, en fait moi je suis en stage et on a demandé de réaliser a protocole expérimental pour une inactivation d'un gène spécifique dans des cellules humaine en utilisant des TALENs. et vue que je n'ai jamais utilisé cette technique ni même vu en cours je ne sais pas trop comment le faire pour moi.  [...]

Procédure pour demander un stage

J'aurai une UE de stage en labo (immunologie) au second semestre mais je ne connais pas la procédure à suivre pour la demande de stage dans les labos.  [...]

[Biologie Moléculaire] Pcr

je suis actuellement en stage et je doit construire un plasmide ré combinant.  [...] Je mal à comprendre comment peut on jouer sur les séquences, et faut il toujours commancer par le triple ATG des amorces pour faire la PCR et la place de la PCR dans la vérification de l'intégrité des plasmides.  [...]

[Divers] Etude recherche médicale et biologique

Par contre, pour pouvoir te spécialisé facilement, tu devrais faire de nombreux stage. C'est un conseil. A l'IUT tu en aura 1 ou 2 (selon les IUT). Si tu fais une fac, tu peux toujours demandé à faire des stages pendant certaines vacances, ils te feront peut etre une convention.  [...] Tu peux proposé de venir avec ton stage. Par exemple, je venais de Brest et je voulais revenir à Brest pour mon stage. J'ai trouvé un stage ici, j'ai appelé la fac à Lille pour leur demandé si c'était possible. Il n'y a eu aucun problème.  [...]

[Biologie Moléculaire] pb de mutagenèse dirigée

je suis en stage et j'essaye de faire de la mutagenèse dirigée grâce au kit de stratagène QuickChange Lightning Site-Directed Mutagenesis Kit. je sais que la taille maximale du plasmide à utiliser pour ce kit est de 14 Kb et je travaille à partir d'un plasmide de 13.  [...] je travaille avec un plasmide type pcDNA3 de 4.5 Kb dans lequel g mis l'ADNc du gène du facteur Willebrand (8.9 Kb). l'amorce que j'utilise fait 30 b avec 15 bases de chaque coté de la mutation et elle a été commandée sur le site recommandé par Stratagene, donc je pense pas qu'il y ait un problème à ce niveau.  [...]

mutagénèse dirigée

Tu ne vois pas l'interet du systeme, tu ne design pas la mutation ponctuelle, tu en generes des milliers de manieres aleatoires et tu selectionnes celle qui porte un interet sur ton gene (c'est d'ailleurs inimaginable de les generer une par une sur plasmide au hasard ).  [...] c est sur que le mieux serait de passer par un plasmide mais bon... mon stage finit dans 1mois 1/2 alors j aimerai aller au plus vite.  [...]

[Biologie végétale] Probléme fluorescence protéine pariétale

[Biologie végétale] Probléme fluorescence protéine pariétale.  [...] Je suis en stage de master et je cherche a localiser une protéine supposée pariétale en faisant une proteine de fusion avec la YFP.  [...]