• Santé - Stabilité, Forme, Protéine

[Biochimie] Extraction enzymes

acides, protéases,... Enfin, le tampon permet de rester dans des conditions isotoniques qui contribuent au maintien de la forme native de ta protéine.  [...] Oui en se plaçant à un pH proche du pHi, on favorise la stabilité de la forme native de la protéine. En effet, la structure protéique est conditionnée par le pH qui va définir la charge des acides aminés déterminante pour la conformation finale de la protéine.  [...]

stabilité d'un peptide cyclique

Les protéines n'existent que rarement sous forme native. Elles se replient en structure primaire, secondaire, tertiaire et meme quaternaires. Ceci est necessaire a leur forme, leur activité, leur stabilite. Je pense que la forme cyclique c'est le repliement de la protéine, notament grace a ses ponts disulfures etc.  [...] Il y a aussi question stabilité un autre point qui peut être abordé. En général les protéines ont des degrés de liberté au niveau liaisons peptidiques. Si l'on ferme le squelette alors on supprime ces degrés de liberté. Le peptide est plus rigide. La conformation est plus stable.  [...]

[Biologie Moléculaire] Turn over protéique

Des travaux anciens suggèrent que c'est la structure globale de la protéine qui détermine la stabilité métabolique. Il a été observé que des formes mutantes de certaines protéines avaient une durée de vie plus courte que la forme wt, et que la dégradation est corrélée à des propriétés physicochimiques comme le point isoélectrique ou la masse moléculaire.  [...] Pas forcément. C'est souvent l'expression différentielle ou la localisation de l'E3 ligase qui permet de réguler la stabilité du substrat (pour les protéines dégradées après ubiquitination).  [...]

Le scutoïde, cette nouvelle forme géométrique identifiée dans nos cellules

Des chercheurs décrivent une nouvelle forme géométrique trouvée dans des cellules épithéliales et qui favoriserait leur stabilité lors des torsions des tissus. Comme cette structure n'avait pas de nom mathématique, elle a été appelée scutoïde, en référence au scutellum des insectes.  [...] La nouvelle forme identifiée ressemble à un prisme, avec à une extrémité un polygone à six côtés et à l'autre extrémité un polygone à cinq côtés. sur le bord allongé, se trouve aussi une face triangulaire. L'équipe a décidé de nommer cette nouvelle forme géométrique scutoïde, à cause de sa ressemblance avec le scutellum du thorax d'un insecte.  [...]

[Biologie Moléculaire] augmentation expression et diminution quantité protéine

Hehe, grand classique. J'ai la même chose en ce moment. -40% de messager entre deux conditions, mais +200% en protéine. Il faut envisager des mécanismes qui modifient la stabilité du messager, la durée de vie de la protéine, des mécanismes de régulation de la traduction, etc.  [...] Tu as peut être une augmentation du turent over de ta protéine. Le problème c'est qu'il y a plein de possibilités. Ce qui est classiquement fait, c'est d'utiliser un inhibiteur de la traduction, et de regarder la quantité de protéines a différents temps pour déterminer sa stabilité.  [...]

mesure de l'expression d'un gene

POur ton marquage metabolique, tu ne fais pas abstraction totalement de la stabilite de la proteine tu n'arriveras pas a marquer une proteine tres instable...sauf si alors tu inactives le proteasome.  [...] Enfin pour le marquage métabolique, je ne supprime pas le biais de la stabilité de la proteine c'est vrai, mais je ne mesure plus que les proteine traduites pendant un temps donné et non pas la quantité totale dans la cellule. Si j'inactive le protéasome je peux optimiser ma mesure c'est cool ça.  [...]

Les résultats déjà obtenus | Dossier

Mais ensuite celle-ci doit être active. Or il est tout à fait possible que l' acide aminé incorporé via l'ARNt au niveau du codon stop modifie fortement la structure, l'activité ou la stabilité de la protéine enpêchant ainsi son fonctionnement normal.  [...] 5% d'activité ont été mesuré après traitement à la gentamicine dans les cellules possédant seulement la mutation Arg208 (17). Les auteurs expliquent que ces différences peuvent provenir de différents paramètres, tels que la stabilité de l' ARNm (les ARNm contenant un codon stop précoce sont instables), la durée de vie de la protéine etc.  [...]

Mutations silencieuses

la mutation peut entraîner le remplacement d'un aa par un autre mais la forme de la protéine ou de ses sites actifs n'est pas modifiée. soit les aa sont de propriétés voisines soit celà concerne une partie de la molécule éloignée des sites actifs.  [...] A partir du moment ou la proteine ne presente plus la meme activité, localisation ou stabilité que la proteine sauvage on ne peut pas parler de mutation silencieuse.  [...]

surproduction et purification de proteine

* Harmonisée * admettons que chez jejuni, un codon précis de l'ARN de ta protéine d'intérêt soit très peu retrouvé dans tout le transcriptome de jejuni (exemple, j'invente, on parle du codon CUG qui est très peu utilisé pour coder une leucine). Eh bien tu ne vas pas choisir le meilleur codon leucine chez E.  [...] _ Attention à tout ce que je raconte. je ne connais rien de ta protéine (taille, composition, stabilité, etc), j'insiste sur le fait que je parle d'une protéine transmembranaire de Plasmo. Je n'ai pas assez de recul et d'expérience pour te donner les grandes lignes d'une purif de protéine His-taggée.  [...]

Etudier la down-régulation d'une protéine

Petite question pratique. Je me demande, dans le cas ou l'on sait que telle protéine est moins abondante dans les cellules atteintes de telle maladie, quels moyens peuvent être utilisés pour trouver comment elle est down-régulée.  [...] -Si tu veux faire un truc à la mode pars du côté des histoires de répression épigénétique de l'expression des gènes type methylation/acetylation des histones/de l'ADN dans la région où se trouve le gène codant ta protéine d'intérêt dans les cellules malades vs saines.  [...]