• Santé - Sonde, ADN, Chromosome

[Biologie Moléculaire] technique d'hybridation moléculaire

j'ai réalisé une hybridation moléculaire avec des sonde 16S et des sonde spécifiques d'un gène avec les fragments d'ADN d'une souche bactérienne.Le profil d'hybridation avec la sonde spécifique du gène m'a donné une seule bande de taille 2 megabases. Mon prof ma dit qu'elle correspond à un mini-chromosome.  [...] je suis désolée mais j'ai pas compris la définition exacte d'un mini chromosome...est -il toujours présent dans le génome et pourquoi on considére pas que cette bande correspond à un plasmide par exemple.  [...]

[Biologie Moléculaire] hybridation moléculaire

Il faudrait que tu donnes les informations, sinon il va être difficile de t'aider. Qui plus est, la question serait sans doute mieux en chimie.   [...] ou chromosome) dans le génome des souches d'une bacterie enterique l'ADN des souches a été digéré avec l'enzyme I-CeuI, et une électrophorèse en champ pulsé a été lieu(figure A) ensuite une hybridation avec une sonde marquée spécifique du gène bal1(figure B ) et une sonde du gène de l'ARN ribosomal 16S (figure C).  [...]

[Génétique] CGH array

en fait, je sais qu'il y a de nombreux puits dans lesquels on met des fragment génomique humains ''normal'',et celui du patient. et cela est repartis ds l'ordre de chromosome. cela veut dire que dans le premier puit nous avons par exemple les sonde d'ADN normal du chromosome 1, que l'on va mettre en contact avec tous les chromosomes du patients surement pas.  [...] ..donc voila, si quelqu'un aurait la gentillesse de m'expliquer cette technique, j'en lui serai très très reconnaissante, surtout que j'ai rien trouve dans les bouquins et encore moins sur le net ou je me suis encore plus embrouillée.   [...]

[Microbiologie] Hybridation

Coucou tous le monde, au fait je vais faire de l'hybridation avec une sonde 16s et une sonde d'un gene de résistance,pour voir si le gene est chromosomique ou non, (puisque le 16s est du chromosome),pour la digestion donc j'ai utilisé l'enzyme. Iceu-1 (qui coupe l'adn) mais lors de la migration.  [...] Après, si l'expérience est un Southern-Blot (ou équivalent), la fréquence de coupure de l'ADN par l'enzyme doit être assez élevé pour que le profil de digestion soit lisse. Dans mon ancien labo, on utilisait des enzymes classique de type EcoRV, HindIII... Le point difficile étant que la zone de référence (pour toi le 16s) et la zone à tester (le gène de résistance) doivent toujours être détecté (et donc qu'il ne faut pas couper au niveau de la sonde - qui n'est généralement pas excessivement grande -500pb pour moi).  [...]

Polymerase Chain Reaction

L'objectif d'une PCR est d'augmenter la quantité d'ADN pour la rendre plus facilement détectable expérimentalement. Pour ce qui est de la méthode. les brins d'ADN sont chauffé a 95°C, a cette température ils se dénaturent, on se retrouve donc avec deux brins monocaténaires.  [...] Non le FISH et la PCR sont deux techniques très différentes et n'ont pas les mêmes objectifs mais utilisent tout les deux une hybridation. La PCR a pour but d'amplifier la quantité d'ADN pour le quantifier par exemple. Le FISH consiste a hybrider une sonde fluorescente complémentaire d'une séquence particulière dans le but de détecter des anomalies chromosomiques, par exemple si tu ne détectes un signal fluorescent que sur un chromosome pour la séquence qui t'intéresse dans un organisme diploïde cela signifie que la séquence a subit une délétion sur l'autre chromosome. Cela permet donc de faire des diagnostiques.  [...]

[Biochimie] Différence entre puce à ADN et sonde à ADN !

Une sonde à ADN est un fragment de nucléotides marqué (par un composé fluorescent, un radio-isotope ou une enzyme) que l'on utilise pour hybrider et détecter des séquences homologues, c'est-à-dire complémentaires.  [...] Une puce à ADN est un ensemble de sondes à ADN fixées en rangées ordonnées sur une petite surface.  [...]

[Biologie Moléculaire] l'hybridation d'une sonde

Une sonde est une séquence d'ADN ou d'ARN qui va se fixer in vitro ou in situ sur sa séquence complémentaire. Cela est utilisé pour différentes techniques comme le Northern Blot pour quantifier une séquence d'intérêt ou comme en hybridation in situ pour déterminer la localisation de cette séquence dans une cellule par exemple.  [...] Une sonde est une séquence d'acides nucléiques qui est complémentaire à un brin d'ADN mono-caténaire que tu souhaites marquer. C'est à dire que les bases nucléiques de la sonde et celle de ton ADN d'intérêt sont complémentaires. (par exemple, chaque fois qu'il y aura un C dans ton ADN, il y aura un G dans ta sonde, et inversement...).  [...]

[Biologie Moléculaire] Southern blot !!!

L'ADN de sperme de saumon permet, pendant le southern blot (et d'autres techniques comme le gel shift (EMSA)), d'empêcher les interactions non spécifiques avec la sonde (un peu comme la BSA ou le lait dans les western blot ou en immunohistochimie).  [...] Mais si la sonde, qui est en quantité saturante je crois, rencontre un ADN de saumon à peu près complémentaire, pourquoi irait-elle voir ailleurs s'il n'y a pas un ADN qui lui correspond mieux.  [...]

[Biologie Moléculaire] Marquage directe et indirecte d'une sonde ADN

[Biologie Moléculaire] Marquage directe et indirecte d'une sonde ADN.  [...] Ma question est a propos du marquage directe et indirecte dune sonde ADN. Le prof nous a dit que le marquage indirecte est utilise pour amplifer le signal mais je n'ai pas compri pourquoi une necessité d'amplifier le signal.  [...]

Sequence 5' pour un ADNc en Southern Blot

Voici ma question. Compte tenu du fait que l'ADNc ne contient que des exons comment se fait il que la sonde extremité 5' detecte quelque chose car il me semble que dans L'ARN mature ( qui permet d'obtenir l'adn c par RTPCR ), la sequence 5' n'est pas transcrite.  [...] salut, je ne suis pas sure mais le probleme me parrait beaucoup plus simple que ca. quoique c'est pas trés clair..quand tu dit une sonde 5'.qui s'hybride avec l'extrémité 5' de l'adn c ou g...ou bien tu parle de sonde marqué à son extrémité 5'...parceque si c'est le cas ca change tout.  [...]