• Santé - Site, Séquence, Promoteur

[Biologie Moléculaire] analyse gène

on me demande d'analyser une séquence d'un gène d'une espèce bactérienne et de repérer ses promoteur et ribosomes bindings site.  [...] 5'-AAGGAGGTG-3'). Cette séquence contient généralement le motif GGAGG situé à 6 ou 11 bases du codon initiateur (des distances plus grandes ou plus petites ont été observées).  [...]

[Génétique] carte de restriction

j'ai un exercice dans lequel je dois faire la carte de restriction. or je n'arrive pas à comprendre comment faire car j'ai. région du promoteur du gène et la séquence du site de clonage multiple.  [...] Tu prends la séquence de clonage et tu cherches tous les sites dans ta séquence promoteur+ gene. Ensuite tu en déduis la taille de chaque fragment généré par restriction.  [...]

séquence kozak

je souhaite faire une transgénèse chez la drosophile, je dispose d'un vecteur possédant le promoteur qui m'intéresse. De plus, j'ai également l'ADNc d'interet avec les séquence 5' et 3' UTR mais je clone directement à l'ATG. Je vais créer un site de restriction avant cet ATG afin de pouvoir le cloner faut il aussi que j'ajoute une séquence Kozak pour avoir une bonne expression de ma prot ou n'est ce pas nécessaire.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquence du promoteur du gène résistance à l'ampicilline

J'aimerais savoir où trouver la séquence du promoteur de ce gène. C'est pour savoir si le site de restriction que j'ai choisi n'est pas trop près du promoteur.  [...] Vous avez la séquence du plasmide. J'imagine que sur la carte vous devez avoir les limites de votre cassette ampi (promoteur et séquence codante). Y a qu'a compter pour trouver la séquence de votre promoteur sur votre plasmide.  [...]

[Génétique] Mécanisme de transcription

Pour commencer je confonds entre en amont et en aval par exemple. dans la transcription chez les Procaryotes, le promoteur est constitué de deux séquences comunes (séquence consensus ) sur le côté 5' en AMONT du site d'initiationet ya une autre séquence à -35 qui permet la fixation du facteur sugma.  [...] ensuite le promoteur est une molécule qui permet le début de la transcription en permettant à l'enzyme de se fixer à l'adn et de reconnaitre le site d'initiation, d'où commencera la transcription.  [...]

[Biologie Moléculaire] Promoteur Taq

Je suis en Licence 2 de Chimie et j'étudie les promoteurs utilisés dans la transcription. On me demande de schématiser le promoteur Ptac qui est l'hybride entre le promoteur de l'opéron tryptophane (-50 -11) et celui de l'opéron lactose (-10 +30).  [...] J'aurais voulu savoir si quelqu'un pouvait me donner un site où trouver ou même la séquence du promoteur Ptac.  [...]

[Biologie Moléculaire] Problèmes: Recombinaison d'un plasmide

Lorsqu'on incorpore un gène dans un plasmide disponible dans le commerce, on aimerait insérer le moins d'ADN supplémentaire possible en plus du gène réel avec son promoteur. Parfois, cependant, il n'y a pas de séquence de restriction appropriée dans la région avant et après le gène qui peut également être trouvé dans le plasmide.  [...] Si il n'y a pas de site de restriction utilisable encadrant ton gène, il va falloir en ajouter. On va donc ajouter 2 sites de restrictions différents de chaque côté de ton gène. Note que pour l'énoncé 1 tu peux utiliser 2 fois la même séquence de restriction car comme tu as déjà ton promoteur le sens d'insertion du gène n'a pas d'importance.  [...]

Animaux transgéniques

en général tu mets la séquence à exciser entre deux site Cre et le gène de Lox avec un promoteur conditionnel.  [...] La cre (recombinase) est placée sous le controle d'un promoteur qui code pour un gène s'exprimant soit à un certain moment, soit selon une localisation précise, soit les deux (il existe certains raffinements, ex. système CreER T2 ).  [...]

[Biologie Moléculaire] Il y a t-il une séquence promoteur chez les eucaryotes?

Il existe des UPE (upstream promoteur elements) ou DPE (downstream) = autres séquences de liaison en amont ou en aval du promoteur au sens strict.  [...] Maintenant pour ce qui est de la séquence du promoteur chez les eucaryotes, plusieurs promoteurs contiennent une séquence appelé boite TATA au environ de -25 pb en amont du point de départ, certains gènes contiennent un élément initiateur au lieu d'une boite TATA qui est localiser autours du site de départ (+1) et qui possèdent une cytosine à la position -1 et une adénine à la position +1.  [...]

Logiciel et méthodologie | Dossier

Le séquençage du génome d'A. thaliana permet de localiser un gène intégralement et par consé-quent le promoteur associé. Cette localisation peut se faire par l'intermédiaire de l'utilitaire Se-quence retrieval du site Internet Regulatory Sequence Analysis tools (Van Helden et al.  [...] L'autre analyse matricielle de cette suite, Gibbs, nécessite plusieurs passages car il donne rarement le même résultat, cependant si une séquence apparaît à chaque passage, il est probable qu'elle forme un consensus réel (van Helden et al., 2000).  [...]