• Santé - Site, Domaines, Protéines

[Biochimie] Interactions protéines

J'ai pu mettre en évidence (en culture cellulaire) que 2 protéines transmembranaires semblaient intéragir... Maintenant, je voudrais voir quels domaines de ces protéines pourraient intervenir dans cette intéraction... Le problème, c'est que j'y connais rien.  [...] Donc j'aimerais savoir si vous connaissez un site qui répertorie tous les domaines responsable d'intéraction entre protéines... ou même mieux... s'il y avait un site qui pourrait me chercher tout ca dans mes protéines ca m'arrangerait bien.  [...]

Généralités sur la protéine Kinase C | Dossier

De façon plus générale les kinases et les phosphatases sont associées pour réguler et coordonner différents aspects métaboliques. Ces contrôles se font par phosphorylation et déphosphorylation de protéines effectrices. Le nombre de domaines protéiques ayant une activité kinasique est proche de 400 (Hardie G.  [...] Il existe d'autres domaines C1 dans d'autres enzymes (Raf-1 kinase par exemple), mais ces protéines ne sont pas capables de lier les esters de phorbol. En comparant les structures primaires des domaines, on remarque l'absence, dans le second cas, des résidus d'acides aminés nécessaires à la formation de la poche hydrophobe, et donc au site de liaison (Toker A., 1998.).  [...]

[Biologie Moléculaire] P53 et réparation de l'ADN

Pour le vérifier, ces domaines peuvent être découpés, interchangés, insérés dans d'autres protéines ou analysés comme des entités distinctes. Appliqué à p53, ce découpage linéaire a permis d'identifier 4 grandes fonctions, chacune localisée dans un fragment distinct de la molécule (figure 1 haut).  [...] Mis bout à bout, ces différents domaines correspondent au portrait classique d'un facteur de transcription oligomérique. Mais ce découpage topographique révèle que chaque domaine peut aussi servir de site d'accrochage pour des protéines cellulaires telles que mdm-2 (dans le domaine de transactivation) ou p53BP2 (p53-binding protein 2, dans le domaine de liaison à l'ADN).  [...]

[Divers] [bibliographie] Bibliothèque de biologie/santé

Site regroupant le génome de plusieurs organismes modèles. Il permet de trouver des séquences (ADN, ARN, proteines), les homologues dans les autres espèces, de faire des blasts, de trouver les séquences en amont ou en aval, et donne également des indications sur la structure des gènes, les epissages, ect.  [...] Site regroupant toutes les informations ayant trait au génome murin (analyse des gènes, des protéines, présentation des modèles mutants existants, bibliographie, photos).  [...]

[Biologie Moléculaire] Site de coupure à la TEV protease

Si des agrégats protéiques se forment cela signifie que localement la concentration en protéines est plus élevée donc cela ne me choque pas que l'absorbance augmente.  [...] pour répondre a ta premiere question, tout depend d'ou se situe le site de coupure. S'il est entre deux domaines protéiques, alors il y a souvent des clivages de protéases.  [...]

[Biologie Moléculaire] addition de nouveaux gènes ?

D'une autre façon, la duplication a permis aussi de placer des domaines fonctionnels sur des gènes de fonction différente, car pour beaucoup de protéines que l'on rencontre, elles sont formées d'un assemblage de domaines fonctionnels réparties de façon diverse et avec une variabilité de combinaison qui régit la diversité de fonction de ces protéines.  [...] Et sans doute que ces ajouts de domaines sur des gènes a permis de les rassembler en de grandes voies très perfectionnées par la diversité d'action et la concordance des mécanismes. Au sein de grandes voies, beaucoup de protéines partagent en commun des domaines, mais sont tout de même très différentes.  [...]

[Génétique] comment savoir le mutations d'un gène que l'on a trouvé jusqu'à maintenant?

est ce que quelqu'un connait un outil ou un site qui permet de localiser sur un schéma ou un tableau tout les mutations découvertes jusqu'à maintenant d'un gène par exon et non par domaines protéiques.  [...] Alors tout simplement, démarre de google. Tu tapes entrez, tu verras dans les premiers liens un site avec pour adresse ncbi. Une fois dessus tu cherches dans les rubriques pubmed central tu te retrouves sur un moteur de recherches avec à gauche de la barre search, un menu déroulant.  [...]

De l'intérêt d'être chaperonnée... pour une protéine!

Autant que je sache, ces protéines chaperonnes permettent de faciliter l'acquisition de structures particulières. lors de la biosynthèse de protéines complexes. En ce sens, certaines protéines chaperonnes peuvent être généralistes, mais si la structure ou des domaines de la protéine doivent être spécifiques, et ne s'appliquer qu'à quelques protéines données, il doit y avoir des chaperonnes spécialisées, non J'espère en apprendre plus là-dessus en licence.  [...] Quand a la specificite des chaperonnes, il doit y en avoir une puisque certaines sont plus dediees a stabiliser des proteines d'une certaines voies de signalisation que d'autre. D'autre part, certain domaine de proteine sont reconnus par les chaperonnes et pas d'autres.  [...]

Expression de gènes

Ce site regroupe les informations de tout un tas d'autres databases, et permet de visualiser fonctions, localisations intrqcellulqire, domaines de la protéine, les différents transcripts, son expression dans différents types cellulaires et présente bien sur toutes les sources.  [...] Plus sérieusement, il m'arrive de devoir identifier des protéines suite à des analyses. Si je me contrefiche du niveau ADN et ARN, la structure de la protéine, ses interactions probables et sa fonction m'intéressent beaucoup plus. Je n'utilise donc pas tout les jours cette database. Mais vu qu'elle est toujours utile.  [...]

[Biologie Moléculaire] Analyse d'une séquence protéique

Je recherche des sites ou logiciels qui permettent de prédire à partir de la séquence de ma protéine d'intérêt, la présence de domaines de liaisons à des protéines régulatrices, des motifs particuliers, des sites de phosphorylation...etc.  [...] Une multitude d'outils sont dispo ici pour l'analyse des protéines. http.//expasy.org/tools/.  [...]