• Santé - Site, Calcul, Protéines

[Biologie Moléculaire] Recherche site pour calcul proba d'interaction entre protéines

Tout est dans le titre je recherche en ligne un site qui me permette de calculer la probabilité d'interaction entre deux protéines. Y'avait un lien dans les infos bibliographiques de ce forum mais le lien ne marche plus.  [...] Donc je pense que le site que tu recherches ne décrivait pas les interactions entre tout type de protéines, mais qu'il devait se focaliser sur certaines interactions bien précises de type reconnaissance enzyme/susbtrat, comme par exemple kinase/protéine à phosphoryler, protéase/protéine à cliver, ou bien des reconnaissances d'interaction de domaines connues WW ou SH3 avec région riche en proline.  [...]

[Biochimie] génétique - endonucléases de restriction

Vous avez compris la principe de l'exercice. En général, en première approximation, on considère la distribution des nucléotides comme aléatoire. On a donc à chaque position une chance sur quatre de trouver chacun des nucléotides.   [...] Donc la probabilité de trouver un site est (1/4) n avec n la taille du site de restriction. Ce genre de calcul vous amène à conclure qu'une enzyme telle que EcoRI génère des fragments de 4096 pb en moyenne.  [...]

[Biologie Moléculaire] [M2]Marqueurs moléculaires de l'évolution

On peut modéliser le même phénomène avec la méthode du maximum de vraisemblance. c'est le calcul de la vraisemblance d'un arbre pour un site donné et sous le modèle d'évolution choisi ainsi que le calcul de la vraisemblance pour le jeu de données (produit des probabilités des différents sites).  [...] Le problème des protéines c'est qu'elles ne sont pas toutes exprimées à tout moment. L'ensemble du génome n'est pas transcrit en permanence. Donc quand vous comparez au niveau protéique ou ARN il faut bien faire attention à ce que les individus soient comparables.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gamme étalon dilution

apres le calcule des concentrations de proteines inconnus a l'aide du graphe de la gamme il y a une question sur le calcul des concentrations reelles des proteines en tenant compte des dilutions.  [...] Alors si ti connais ta concentration final en protéines, tu peux facilement revenir à la concentration initiale en tenant compte des différentes manipulations que tu as fait pour y parvenir.  [...]

Articles importants dans Nature, Science ou Cell - Page 3

Donc elle pourrait être une méthode remplaçant peu à peu notre bonne vieille cristallo, mais en y réfléchissant bien ça pourrait être génial pour prédire la structure des protéines membranaires qui sont presque 'incristallisables.  [...] Il faut tout de même noter que ce programme Rosetta est lié à la plateforme de calcul partagé Boinc. Cette publi fait référence au pré-Boinc pour ce projet, dont le directeur de recherche David Baker a fait appel vu la puissance de calcul requise pour déterminer les structures de protéines par ordinateurs.  [...]

[Biochimie] Chromatographie d'exclusion sur colonne !

L'autre façon de voir les choses c'est que plus une protéine est en grande quantité plus elle va être éluée sur un nombre de fraction importante. Donc cela tu peux le vérifier puisque tu as fait des dosages par bradford. Regarde la concentration de chaque protéine dans chaque tube puis calcule la masse ou la quantité de chaque protéine.  [...] Pour répondre à Yoyo, je ne suis pas à la limite de mon pouvoir de résolution de mon gel. Mon gel sépare des protéines de 1000 à 50000 Daltons (Da) et mon cytochrome C fait 12 000 Da environ.  [...]

[Divers] Je recherche le nom... (bonne cause)

... du programme ou du site qui propose d'aider les scientifiques à décrypter le genome humain en mettant à disposition son processeur qui calcul.  [...] Plus sérieusement, y'en a plein des progs qui font tourner les processeurs. Futura-sciences a choisi folding car c'est en libre accès pour les laboratoires, alors que tousles autres programmes font ayer l'acès aux labos.   [...]

[Biochimie] explication concernant méthode de lowry

bonjour, pendant la séance de TP nous avons dosé des protéines par la méthode de LOWRY, en effet j'ai exploité les résultats pour tracer la courbe (la densité optique /µg de protéines(solution standard) en suite j'ai déterminé les concentrations manquantes de la solution de la protéine (ovalbumine.  [...] dilué et non dilué tout en déterminant la quantité totale des protéines dans la fraction soluble. ya t'il une formule exacte de calcul ou bien un démarche illustré a suivre Merci d'avance.  [...]

Quantité d'omega

Pourquoi nous divisons par 9 Car 1 gramme de lipide fournit 9 calories. En comparaison, la même quantité de glucides vous apporte 4 calories, tout comme 1 gramme de protéine. Et 1 gramme d'alcool vous amènera 7 calories.  [...] PS. si vous avez besoin d'une règle à calcul pour savoir combien vous devez en avoir dans votre bol alimentaire, vous allez déprimer un max, et il vous faudra encore plus d'Oméga (-).  [...]

NaCl et acidose - Page 2

de la dilution, (de réactions chimiques entre les bases tampons (phosphates) l'hémoglobine et les protéines plasmatiques), et en outre,  [...] L'utilité du concept de stewart vient du fait que justement cette méthode du calcul de la constante électroneutralité permet d'isoler les concentrations de l'organisme en acides faibles (cad les systèmes tampons. HCO3-, protéines, phosphates).  [...]