• Santé - Site, Branchement, Séquence

[Génétique] Quelques questions en génétique ( maturation et traduction de l'ADN)

3) Mise en place du spliceosme ( arrivée de U2 sur le site de branchement). Pourquoi l'Adénine du site de branchement est elle décalée par rapport au autres bases de la séquence de l'intron.  [...] Dans le cas de la définition exonique de l'intron, si je comprend bien, la 1er réaction trans-éstérifiction va se faire avec l'Adénine du site de branchement* de l'intron 1 et lextrémité 5' de l'intron2.  [...]

épissage alternatif VS épissage complet

Pour l'épissage alternatif tout va dépendre des facteurs d'épissage et des snARN + hnRNP car ce sont eux qui contrôle l'épissage mais aussi des séquences consensus de l'épissage qui sont le site donneur, le site accepteur, le site de branchement et la séquence polypyrimidique.  [...] Pour moi, si tu fais un épissage complet avant un épissage alternatif ce n'est pas possible car ton ARN est complètement épissé, il n'a plus de séquence intronique ce qui est le but de l'épissage. Donc tu ne peux plus refaire d'épissage par derrière.  [...]

[Biologie Moléculaire] Taille des exons, des introns et des régions UTR

J'ai actuellement un souci pour déterminer la taille précise des introns et des exons dans une séquence d'ADNc donnée. Il me semble qu'un intron débute par un site donneur GT en 5', qu'il contient un site de branchement contenant une Adénine et qu'il se termine par un site accepteur AG en 3'.  [...] Le but est donc de rechercher toutes les régions entre un GT et un AG qui contiennent un A puis compter le nombre de nucléotides Cela me semble long et bizarre étant donnée la taille de la séquence d'ADN (ADN complémentaire et non ARN).  [...]

Epissage alternatif pb de comprehension

L'intron débute par une séquence et se termine par une séquence AG en 3', avec un nucléotide consensus situé à peu près au milieu (site de branchement).  [...] La première a lieu au site de branchement de A avec le G de 5', ce qui nous donne une structure en lasso, avec les sRNP (nommés U1, U2, U5...) au centre (comparable à une bille fixée sur l'ARN)==. tu clives (= coupe) en G puis tu torts dans le sens anti-horaire de manière à avoir G (devant U) qui se colle à A au site de branchement==. ça donne une structure en lasso.  [...]

role des introns

De plus, même sans ce phénomène, ces séquences ne peuvent pas être inutiles. En effet, synthétiser de l'ADN coûte cher en matière d'energie, l'entretenir aussi, et l'excision-épissage aussi. Donc, on ne peut pas concevoir que l'évolution ait favorisé des mécanismes de gaspillage gratuits.  [...] Pour un petit rappel, la théorie de l'épissage alternatif a pris beaucoup de crédit lorsque le génome humain fut séquencé entièrement et que l'on s'est aperçu qu'il existait énormément plus de protéines que de gènes codants. Aujourd'hui, certains pensent (dont le prof qui a rédigé les notes de cours que j'ai sous les yeux.  [...]

[Biochimie] Adn/arn

J'aurais répondu faux car pour moi la liaison phosphodiester nécessite la présence d'un groupement OH que le désoxyribose ne possède pas en 2' et de plus, les exons/introns ne concernent que l'ARN, mais voilà je voulais être sur.  [...] Par contre concernant l'excision épissage, elle ce fait bien au niveau 2'-5' par une liaison phospho-diester ( entre le site de branchement et le site donneur).  [...]

[Biologie Moléculaire] Elements cis et épissage

Bon même si tu n'as pas du aller encore trop loin dans le mécanisme de l'épissage, tu dois bien te douter que l'intron est reconnu par le spliceosome (machinerie d'épissage). Et pour que la reconnaissance soit effective et correcte/précise, cet intron doit porter un signal qui permette de le distinguer des exons.   [...] Dans ton intron tu as en 5' un GU, en 3' un AG et en remontant à partir du 3' vers le 5' tu vas avoir une séquence riche en pyrimidines jusqu'à atteindre un A qui est le point de branchement sur lequel la première trans-estérification (le G du 5' sur le A point de branchement) aura lieu...bref.  [...]

la maturation du pré-ARNr

Dans un premier temps, une Adénine du site de branchement va attaquer la *Guanine* depuis son extrémité 2'-OH qui attaquera le groupe phosphodiester. S'en suit un clivage.  [...] Dans un deuxième temps, le 3'OH du groupe phophodiester précedemment coupé va attaquer la *Guanine* du site accepteur et se lier à lui pour virer définitivement l'intron, formant le Lasso et créer une liaison 3'-5'phosphodiester.  [...]

[Biochimie] la biosynthèse de la lys ,meth ,thr ,isoleu

- la rétroinhibition limitée aux branchements. ici, l'acide aminé qui est en excés inhibe la première étape de la séquence de réactions conduisant à sa seule synthèse (au début du branchement si tu préfères et pas au tout début de la série de réaction).  [...] - il existe également une rétroinhibition, moins fine, dite concertée chez certains organismes comme Bacillus. Ici il n'existe qu'une seule aspartokinase et il faut qu'il y est deux acides aminés (K et T) pour avoir rétroinhibition. Cependant cette rétroinhibition n'est pas totale et permet la synthèse des autres acides aminés.   [...]

[Biologie Cellulaire] excision/épissage par le splicésome

A propos du processus d'excision de l'ARN messager,le SNURP U1 se fixe au site donneur de l'intron par complémentarité de séquence pour pouvoir ensuite que les SNURPS U4, U5 et U6 clivent l'extrémité 5'. Donc si j'ai bien compris ici, le SNURP U1 sert de fixateur pour que les autres SNURPS viennent couper plus facilement l'extrémité 5' Parce que en soit un SNURP pourrait suffire pour exciser.  [...] En même temps, le SNURP U2 se fixe au point de branchement au milieu de l'intron. les SNURPS U1 et U2 se rapprochent avec formation d'une liaison covalente entre la guanine du site donneur et l'adénine du point de branchement pour que ensuite il y ait clivage de l'extrémité 3' par les SNURPs.  [...]