• Santé - Séquences, Unité, Consensus

Génétique

c- des séquences consensus Je ne vois pas ce qu'ils veulent dire par consensus, peut être qu'ils insinuent que les scientifiques se sont mis d'accord sur des séquences précises, mais bon là encore je ne sais pas.  [...] Le promoteur est constitué de courtes séquences conservées d'une unité de transcription à l'autre et appelées séquences consensus.  [...]

séquence Shine Dalgarno ou RBS

C'est une séquence consensus qui permet de lier le mRNA au rRNA de la sous-unité 30s du ribosome chez les procaryotes.  [...] Elle est située quelques nucléotides avant le codon ATG sur l'ARNm. Il existe evidemment une sequence complementaire sur l'ARNr.  [...]

Un prob a resoudre

- il faut une sequence consensus pour faciliter l'accrochage de la petite sous-unite du ribosome (sequence Kozak) qui comporte au moins 6 nucleotides (soulignes) et peut-etre que 9 c'est mieux (3 entre parenthese).  [...] Apres 14 annees d'efforts, on extrait de l'hypothalamus une hormone proteique constituee par la condensation de seulement 3 molecules d'acides aminés.La sequence de ce tripeptides est Glu-His-Pro.  [...]

structure prédictive de protéine et interaction ... tout un programme!!!

Déjà, est-ce que la séquence consensus d'arrimage de la kinase sur ses substrats est connue Est-ce que sa séquence consensus de phosphorylation est connue Ces séquences sont-elles présentes sur la protéine qui interagit avec la kinase.  [...] Tu n'as pas répondu à mes questions. séquences consensus d'arrimage et de phopshorylation de la kinase (pas besoin de la cristalliser pour les connaitre, des publications ont dû les identifier si ta kinase est assez connue). Une fois que tu as ces séquences, recherche leur présence sur ta protéine en les dégénérant (puisque ce sont des séquences consensus).  [...]

[Biochimie] ARNm Bactérien.

Ca dépend de l'exercice, s'il faut dans un autre exo, tu auras 1 ARNm procaryote et un autre eucaryote. Je pense que le but de l'exercice est de te faire repérer des séquence consensus que l'on t'a appris dans tes cours. Ces séquences consensus peuvent être spécifique d'un domaine phylogénétique (proca vs euca) mais pas toutes.  [...] Je ne connais pas ton niveau mais en principe, on n'apprend pas plus de 3 séquences consensus sur un gène eucaryote. la TATAA Box, le terminateur de transcription (qui est plutôt une structure secondaire repérée par ses répétitions de G et C complémentaires) et la séquence de polyadénylation.  [...]

[Biologie Moléculaire] Mutation site d'épissage?

Et pour expliciter mon propos, je dirais. Syndrome des lymphocytes nus, ou déficit en CMH de classe II, dû, justement, à une mutation affectant un site d'épissage du gène codant un coactivateur, l'empêchant d'être recruté sur le enhancer d'une famille de gènes cibles et par conséquent d'activer la transcription de ces gènes par acétylation des histones.  [...] Je confirme ce qui est dit plus haut, à savoir que des mutations sur les sites affectant l'épissage on ne s'en fout pas. Cela peut conduire à un exon skipping et si l'ARNm n'est pas reconnu comme anormal par les mécanismes de réparations de la cellule notamment voie NMD (il me semble)et bien cela peut conduire à un décalage du cadre de lecture, avec apparition d'un codon stop prématuré et protéine tronquée éventuellement non fonctionnelle.   [...]

[Microbiologie] Mise en évidence système SOS bactéries

Pour répondre à MaliciaR, je sais que le système SOS est un système de réparation mutagène de l'ADN. il est utilisé en dernier recours, lorsque la survie de la cellule est engagée. Il permet de faire au moins pire. réparer l'ADN de manière un peu hasardeuse pour sauver la bactérie, ce qui entraine des mutations mais de conséquences plus benignes.  [...] Je suis pas sur que l'on voit d'autres espèces de bactéries assez rapidement..puisque je suppose que toutes ces infos c'est pour le TIPE sur l'information.Forcément un TIPE ressemble plus a un TPE qu'à un projet de recherche, surtout les expériences sur l'adn (qui est pourtant la première chose a laquelle on pense en lisant information ) étant donné les moyens qu'on a en lycée.   [...]

obtension d'une séquence consensus..comment?

je m'interesse à la construction d'une séquence consensus à partir de l'alignement de 6 séquences nucléotidiques. J'ai utilisé le CLC sequence viewer ainsi que Jalview mais il y a des positions où le logiciel ne peut pas trancher et met un point. Je trouve pas mal de fois que 50% des séquences ont le nucléotide C et 50% ont le T par exemple.  [...] Ce résultat est tout à fait normal, une séquence consensus est par définition la plus proche possible de toutes les séquences de ton alignement. Comme tu as un nombre pair de séquences, il est donc logique de trouver des positions avec 50% C et 50% de T, impossible alors pour le programme de trancher, d'où le point.  [...]

Identification d'une protéine

Je pense que cela dépend du type de bande que tu as, à savoir si l'identité de la séquence est complète (du 1er aa au dernier) ou si elle est partielle... dans ce cas, ça pourrait correspondre à une pré(pro)protéine... Et ça compliquerait l'exercice. Le mieux à faire je pense, est de nous donner ta séquence en aa en piece jointe, pour qu'on se rende compte de la tête des résultats.  [...] Maintenant, si tu regardes les séquences consensus de ces domaines par rapport à la séquence de ta prot, tu peut voir que en gros, le consensus du deuxieme domaine contient en partie le consensus du premier domaine... Donc là, il va falloir voir quels résultats tu obtiens avec les allignements pour ne pas faire d'erreurs. Clique sur Format.  [...]

Créer amorces-Séquence consensus

Je dispose de 4 séquences de ce gènes chez 4 espèces (d'un invertébré marin). J'utilise donc le logiciel Bioedit afin d'aligner ces séquences et créer une séquence consensus. Cependant, lorsque j'utilise cette séquence consensus dans Primer 3, il me dit qu'il y a des bases non reconnues dans ma séquence.  [...] Suis-je donc obligé d'utiliser la séquence de ce gène chez 1 seule espèce.  [...]