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CRISPR Cas9: Fabrication d'ARN en laboratoire

- Le système de défense (de *vaccination* ) des bactéries*. Découverte des séquences palindromiques, bactéries qui *sauvegardent* une partie de l'ADN du virus, ADN virale coupée….  [...] Merci de votre réponse, j'ai fait quelques recherche sur comment on encode des séquences d'ARN mais je n'ai pas très bien compris.  [...]

L'étrange stratégie des bactéries contre les virus

Le génome des survivantes a été analysé et il a révélé une caractéristique particulière. l'abondance de séquences dites CRISPR ( Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats ). Cette curiosité de la biologie des bactéries, connue dans leurs deux grandes lignées (les Eubactéries et les Archées ), consiste en de courtes portions d'ADN (10 à 50 nucléotides ) répétées à l'identique un grand nombre de fois (jusqu'à 140) et séparées entre elles par une séquence qui, elle, reste unique et que l'on appelle faute de mieux un espaceur.  [...] La surprise n'était pas totale car on soupçonnait déjà ces séquences répétitives de jouer un rôle dans ce qui ressemble à un véritable système immunologique des bactéries. Mais l'équipe en apporte la preuve formelle avec une découverte étonnante. quatre espaceurs présentent des codes génétiques similaires à celui des bactériophages qui ont attaqué les bactéries.  [...]

Enfin une parade prometteuse contre les « super pathogènes » ?

Pour cette étude, les chercheurs ont utilisé à leur avantage un système bactérien appelé Crispr pour Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Un Crispr est constitué d'une série de petits morceaux d' ADN répétés un grand nombre de fois et séparés entre eux par des séquences uniques appelées espaceurs.  [...] Pourrait-on utiliser les Crispr comme outil pour éliminer les bactéries Pour le savoir, les chercheurs ont modifié génétiquement un Crispr pour qu'il reconnaisse un génome bactérien particulier plutôt qu'un virus. Ils ont ensuite introduit ce système à l'intérieur de la bactérie ciblée.  [...]

Système Cre/Lox et transposons

Par exemple, si deux transposons sont orientés dans le même sens, on peut avoir une recombinaison ectopique qui élimine une des 2 copie du transposon... Il se passe exactement la même chose avec le système Cre/Lox. si une séquence est entourée de 2 sites Lox P orientés dans le même sens, et si on ajoute la recombinase, on va obtenir la délétion de la séquence entre les 2 sites Lox P (c'est d'ailleurs un système d'expression inductible très utilisé en recherche).  [...] T'as regardé sur pubmed Le système Cre/Lox étant issu de bactériophages, peut-être chercher aussi vers cette direction. Ou sinon essaie de faire des comparaisons de séquences dans le sens de ton hypothèse, tu es peut-être sur la voie de quelque chose d'intéressant.  [...]

La résistance aux antibiotiques se transmettrait... par la pollution de l'air

Les gènes de résistance peuvent ainsi se transmettre rapidement d'une bactérie à l'autre, mais on ignorait encore jusqu'à quel point. Pour comprendre l'étendue de ces transmissions, des scientifiques de l'Université de Göteborg ont analysé les séquences de différents ADN plasmidiques retrouvés dans une variété de bactéries, grâce à des techniques couramment utilisées pour évaluer l' évolution des espèces.  [...] Ils se sont ainsi intéressés particulièrement au plasmide IncP-1, très répandu, dont 25 séquences ont été comparées. Selon les résultats parus dans la revue Nature Communications, ils ont constaté que les plasmides possèdent des séquences différentes, adaptées à celles des bactéries dans lesquelles ils sont retrouvés.  [...]

Cartographie génétique

La cartographie physique permet de déterminer la séquence complète du chromosome et la distance entre le gène et les marqueurs en Pb, et c'est là que je ne comprends pas grand chose, on m'explique dans mon cours que pour réaliser cette technique, on utilise un génôme que l'on fragmente en fragments de grande taille, on les insère dans des vecteurs (chr artificile de bactérie par exemple), on insère ces vecteurs dans les bactéries, puis on compare les séquences des clones en repérant les points communs entre ces séquences et par recoupement on trouve la séquence.  [...] .. bref vous avez surement compris en me lisant que la méthode pour faire une cartographie physique est vraiment très floue, je ne comprends pas pourquoi on doit mettre des séquences dans des bactéries pour les comparer, ni même ce qu'ils appellent un clone (grands/petits clones).  [...]

origine de réplication

Après aussi tout dépend des séquences d'incompatibilité de ton plasmide. Notamment chez les bactéries lorsque 2 plasmides pr ésentent les mêmes séquences d'incompatibilité (même si ces plasmides codent pour des gènes différents) l'un des deux va disparaître c'est la cure plasmidique.  [...] Ensuite un plasmide peut coder pour ses propres enzymes car il possède le gène. Mais les enzymes peuvent aussi être issues du génome de l'hôte ou du chromosome bactérien. Donc il est possible que si une enzyme nécessaire à la régulation de ton plasmide ou à son origine de réplication est absente dans la cellule transfectée et non codée par le plasmide alors l'origine de réplication sera non fonctionnelle. Mais là ce n'est qu'une hypothèse. ^^.  [...]

[Microbiologie] Plasmide 2Mu chez la levure Saccharomyces cerevisiae

J'aurai besoin d'explications sur le phénomène de réplication du plasmide 2µ de la levure. Je n'arrive pas à imaginer clairement le système de recombinaison qui intervient entre les deux séquences flip, système qui permet la formation d'un long concatémère 2µ.  [...] Étudiant Belge en 3e année de Licence en Sciences Biologiques (UMONS - www.umons.ac.be).   [...]

[Immunologie] génome et répertoire immunitaire

Le système VDJ permet par recombinaison d'avoir une infinité d'anticorps potentiels à partir de seulement quelques séquences.  [...] Approximativement. un anticorps est composé de plusieurs segments, chacun étant codé par un ensemble de gène différents (3 groupes de gènes). Au moment de sa maturation, le lymphocyte B va choisir un gène dans chaque groupe pour reconstituer l'anticorps complet (il procède par élimination des brins d'ADN excédentaire pour reconstituer un gène unique à partir des trois morceaux).   [...]

Transgenese!

Encore un question qui n'est pa lie a ce sujet ourquoi parfois en faisant la transgenese, par ex a des mais on l'integre dans un plasmides bacterien (et non directement dans le genome des maiis) et puis on les tarnsfert dans une bacteries avant de recuperer a nouveau ces plasmides pour les transferer au cellules des maiis.  [...] Bon effectivement la multiplication dans des bactéries (dans les plasmides) permet d'amplifier énormément une séquence d'ADN (on peut aussi utiliser des virus de bactéries, les phages, encore appelés bactériophages, qui permettent de multiplier des séquences d'ADN plus longues).  [...]