• Santé - Séquences, Séquençage, Génome

sequencage du genome humain

Le séquençage d'un génome permet de déterminer les séquences (d'ou séquençage) de nucléotides de l'ADN d'un organisme. Les fins de ce séquencage sont diverses selon la personne qui la réalise. Par exemple, il est interessant de connaître la séquence des gènes impliqués dans la division cellulaire, ou dans le développement etc.  [...] Grâce à ses séquences et aux modifications qui y ont été introduites (des mutations), on peut expliquer des maladies génétiques par exemple... Le séquencage du génome d'un organisme nous permet de mieux le comprendre, de pouvoir le comparer à d'autres organismes (les gènes exprimés sont ils différents similaires si oui, il est fort probable que ces deux organismes soient apparentés).  [...]

[Génétique] Sequençage à haut débit

Lors du séquençage d'un genome entier, par exemple Bac by Bac, pourquoi on procède a un clonage dans des vecteurs avant de séquencer..c 'est a dire pourquoi on fait pas directement le séquençage après la fragmentation du génome.  [...] Les techniques de séquençage modernes séquencent le génome en parallèle. Comme tu l'as dit, le génome est fragmenté, puis tous ces fragments vont être séquençés en parallèle. L'intérêt d'amplifier l'ADN, c'est par exemple si tu veux séquencer un très petite quantité d'ADN.  [...]

recherche d'opéron dans une séquence nucléotidique

je cherche des logiciels de bioinformatique qui me permettent de chercher les opérons, les promoteurs ainsi que les séquences 5' et 3' UTR dans une séquence nucléotidique chez les procaryotes.  [...] j'aimerai bien savoir en détail comment on peut procédre pour identifier ces séquences régulatrices à partir de donnée de séquençage du génome complet.  [...]

[Divers] La Vie sous une forme différente, dans des conditions différentes?

Depuis juillet 1995, on a séquencé complètement 2329 génomes différents, à l'heure à laquelle je poste ce message, dont 134 génomes d'archées (5,8%), 2046 génomes de bactéries (87,8%) et 149 génomes (6,4%) d'eucaryotes (voir la base de données GOLD ). Tout cela est à comparer avec les millions d'espèces vivantes déjà répertoriées, sans compter les microorganismes ou les virus.  [...] .. Avec le progrès du séquençage (qui a reçu un coup de fouet grâce au projet Génome Humain) de ces génomes, on parvient à extraire de façon automatique ou semi-automatique (dépendant des bases de données), des séquences d'acides aminés correspondants à des protéines (séquences vérifiées par la suite).  [...]

[Génétique] Génome humain: 22000, 24000, 25000 gènes ?

qu'une bonne partie du génome est couverte par des séquences de bonne qualité (avec peu d'erreurs). En fait il ne faut pas croire que le séquençage du génome humain a produit une suite de 3 milliards de lettres connues avec certitude. Les méthodes d'assemblage produisent des séquences avec des parties propres et puis d'autres parties plus ou moins douteuses.  [...] Il suffit de compter les ARNm pour en connaitre leur nombre, sans s'embêter à inventer des facteurs pour tenir compte de l'épissage alternatif ou autre. Pour rappel, au départ du projet de séquençage de notre génome, on considérait qu'on avait plus de 100 000 gènes (avec la même défintion que dans l'article), mais au cours des avancées, ce nombre n'a pas arrêté de réduire, du à l'extraordinaire complexité de notre génome et transcriptome.  [...]

[Biologie Moléculaire] Différence entre le séquençage d'un panel de gènes et le séquençage complet du génome

Différence entre le séquençage d'un panel de gènes et le séquençage complet du génome.  [...] Je me permets de vous écrire car je souhaiterais savoir quelles sont les différences en termes de méthodes, d'étapes et d'appareils utilisés entre le séquençage d'un panel de gènes et le séquençage complet du génome s'il-vous-plaît. Je me pose cette question dans le cadre de l'accréditation selon la norme ISO 15189 des plateformes de séquençage.  [...]

Séquencé son propre Génome

Craig Venter est une sacrée pointure, qui a prouvé que le séquencage d'un génome était possible par la méthode shotgun et c'est aussi un homme d'affaire efficace (avant lui on pensait que c'était impossible à cause des séquences répétées, mais je vais pas entrer dans les détails ^^).  [...] La personne qui possèdera la séquence de son génôme pourra apparement comparer celle ci à des séquences types de gènes identifiées dans diverses maladies génétiques.  [...]

Le génome de l'oursin de mer décrypté

Il aura fallu 3 ans pour séquencer les 814 millions de paires de bases de l'organisme au sein d'un projet co-dirigé par le Dr. George Weinstock du Centre de Séquençage du Génome Humain au Baylor College of Medecin au Texas, en collaboration avec le Mount Desert Island Biological Laboratory à Bar Harbor (MDIBL, Main).  [...] Ainsi, après le séquençage du génome humain et de nombreux organismes vivants, le séquençage du génome de l'oursin de mer apporte des informations cruciales qui permettent, en terme d'évolution, de remplir un intervalle restée jusque là vide.  [...]

Question idiote sur le génôme humain

En fait, deux stratégies ont été développées pour le séquençage de génomes entiers. 1°) Stratégie du chromosome walking (à petits pas).  [...] Le génome dans son entièreté est fractionné au hasard pour obtenir des plus petits morceaux. Comme au départ on a plusieurs molécules d'ADN équivalente, on obtient, après digestion, des fragments dont les séquences peuvent se superposer. Le séquençage est donc redondant.  [...]

Acides Nucléiques

Lorsqu'on fait un séquençage d'ADN, avec la méthode de Sanger, on reconstitue le génome ensuite par electrophorèse. Les acides nucléiques ont donc des charges différentes (car on se réfère à la taille de tous les fragments séquences et leurs charges ).  [...] L'ADN est chargé négativement. La séparation se fait en fonction de la taille des fragments qui diffère d'un seul nucléotide entre chaque bandes les plus proches visible sur le gel.   [...]