• Santé - Séquences, Consensus, Site, Donneur

épissage alternatif VS épissage complet

Pour l'épissage alternatif tout va dépendre des facteurs d'épissage et des snARN + hnRNP car ce sont eux qui contrôle l'épissage mais aussi des séquences consensus de l'épissage qui sont le site donneur, le site accepteur, le site de branchement et la séquence polypyrimidique.  [...] Si par exemple tu as une mutation au niveau du site donneur (ou autre site consensus) celui-ci ne sera pas reconnu par les snARN et donc ton exon sera épissé.  [...]

[Biochimie] biologie Cellulaire

Ca signifie simplement qu'une séquence se retrouve à quelques variantes près dans un contexte donné. Le consensus est la moyenne de toutes ces séquences.  [...] Oui, et les régions à exciser sont définies par des sites consensus donneur et accepteur reconnus lors de l'épissage des introns.  [...]

[Biologie Moléculaire] Clonage avec plasmide

Les sites de restrictions sont en fait des séquences consensus dites palindromiques qui sont donc identiques dans le sens 3'-5' et 5'-3'. Ces séquences soont reconnues par des enzymes particulières très souvent d'origine bactériennes (EcoR1, EcoR5, BamH1...).  [...] Séquencer ne donne pas physiquement le fragment. Il faut que vous ayez déjà le ou les fragments pour pouvoir les séquencer (littéralement. en connaître la séquence, l'enchainement des acides nucléiques qui les composent).  [...]

[Biochimie] designer mes oligos

Tout d'abord, je suppose que tu as aligné tes (deux) séquences par clustalx ou w, histoire de vérifiée s'il existe des zones de similitude nucléique. N'hésite pas a faire tout les sens possible reverse, inverse, reverse inverse. En effet les logiciel disponible en ligne ne tourne pas toujours les brins dans tout les sens immaginable ce qui a pour conséquence de faire varier ton pourcentage de similitude entre deux séquence.  [...] Il te permet de faire un consensus en utilisant le code IUPAC. Tu peux meme dessiner directement des couples d'amorces avec ce site. Tu configure le GC%, la taille de l'amplicon etc.. Bref il est assez efficace. TU peux néanmoins dessiner tes amorces en utilisant la séquence consensus générer dans le site de primer3.  [...]

Génétique

c- des séquences consensus Je ne vois pas ce qu'ils veulent dire par consensus, peut être qu'ils insinuent que les scientifiques se sont mis d'accord sur des séquences précises, mais bon là encore je ne sais pas.  [...] Le promoteur est constitué de courtes séquences conservées d'une unité de transcription à l'autre et appelées séquences consensus.  [...]

Séquences consensus

Soit plusieurs sequences d'une meme proteine (ou d'une meme famille de proteines) que tu aligneras entre elles, afin de determiner la sequence consensus et l'existance d'eventuels motifs.  [...] Chapeau bas Yoyo, j'avais pas compris la question. et ne voulais pas me risquer sur le terrain des séquences consensus et de leurs exploitations.  [...]

[Génétique] Programme génétique et cellules

Il faut savoir que si l'ADN est effectivement découpé en plusieurs gènes, de nombreuses séquences permettent la régulation de l'expression génétique, et ne sont pas forcément considérées comme des gènes. ces séquences peuvent constituer des points d'ancrage de certaines protéines régulatrices par exemple.  [...] Il y a plusieurs manières de déterminer le poucentage de codant, essentiellement par des outils bio-informatiques appelés outils d'annotation de génomes. Les séquences codantes contiennent des choses particulières que le non codant ne contient pas. des codons Il y a aussi divers signaux tels des séquences consensus de promoteurs (c'est chez les Procaryotes, ça), des sites d'épissage d'introns, îlots CpG, etc.  [...]

[Biologie Moléculaire] Décision de replication de l'ADN

De plus, ce n'est pas parce qu'il existe des introns que les mutations n'affectent pas les séquences codantes. C'est juste que la pression de sélection est plus forte sur les régions codantes que sur les non codantes, et encore là il y a des nuances... Le moins de chances que ça affecte l'ADN codant est, tu conviendras, un non-sens.  [...] *Il existe une séquence ACS = ARS Consensus Sequence (11 pb). on l'appelle A-box et c'est le site de liaison du complexe d'initiation de la réplication (ORC).  [...]

structure prédictive de protéine et interaction ... tout un programme!!!

Déjà, est-ce que la séquence consensus d'arrimage de la kinase sur ses substrats est connue Est-ce que sa séquence consensus de phosphorylation est connue Ces séquences sont-elles présentes sur la protéine qui interagit avec la kinase.  [...] Tu n'as pas répondu à mes questions. séquences consensus d'arrimage et de phopshorylation de la kinase (pas besoin de la cristalliser pour les connaitre, des publications ont dû les identifier si ta kinase est assez connue). Une fois que tu as ces séquences, recherche leur présence sur ta protéine en les dégénérant (puisque ce sont des séquences consensus).  [...]

[Biologie Moléculaire] un gène= une proteine ??????

Les sites de réplications sont des séquences consensus qui sont disposées sur les chromosomes. Chez les eucaryotes il y en a plusieurs alors que chez les procaryotes il n'y en a qu'un seul attaché au mésosome.  [...] 4) A la fin d'un ARNm tu as un polyA avec une extrémité OH mais celle ci est protéger pour que l'ARNm ne soit pas dégradé par des exonucléases. Elle est protégée par les PABP si je me souviens bien, des polyadenosine binding proteins. Elles sont très importantes dans le devenir de l'ARNm.   [...]