• Santé - Séquences, ADN, Base de données

[Biologie Moléculaire] Séquençage et métabarcoding

- Quels logiciels peuvent permettre à la fois le stockage des séquences ADN, la création de bases de données interne, la comparaison des séquences ADN avec des bases de données publiques, les alignements de séquences (à part Geneious).  [...] C'est aussi pour ca que je compare mes séquences avec des bases de données (pour les identifier) et que je souhaite avoir ma propre base de données. Quels logiciels peuvent permettre à la fois le stockage des séquences ADN, la création de bases de données interne, la comparaison des séquences ADN avec des bases de données publiques, les alignements de séquences (à part Geneious).  [...]

[Biologie Moléculaire] différence entre séquences d'ADN REVERSE et FORWARD

[Biologie Moléculaire] différence entre séquences d'ADN REVERSE et FORWARD.  [...] j'ai Téléchargé des séquences d'ADN à partir d'une base de données.  [...]

[Divers] Fac de Sciences, les débouchés.

Concernant la génétique et la bio mol, si tu aimes l'informatique, un master en bio-informatique pour être bio-informatien pour le traitement des bases de données des séquences d'ADN ou protéine pourra te convernir aussi.  [...] Pourquoi Ben parce que ce sont des matières utiles pour comprendre comment fonctionnent les appareils que nous utilisons au quotidien pour faire nos expériences. Et les stats, pareil, la plupart des articles scientifiques foisonnent de traitements statistiques des données.  [...]

[Biochimie] mutation...

Exemple. le codon ACC code pour la thréonine.Une mutation intervenant sur la 3eme base (ACA, ACT, ACG) n'aura pas de conséquence puisque ces 4 codons codent pour la thréonine (voir le code génétique comme le suggère Elohir).  [...] Enfin, concernant les mutation, il est préférable de parler d'adjonction de base(s) plus que de duplication. qu'il s'agisse d'une insertion intempestive, d'un bégaiement de l'ADN polymérase ou d'un insertion virale. En effet. une bonne partie de notre ADN est d'origine virale, certains gènes viraux ayant perduré au fil des génération de façon plus ou moins intacte, qui, combiné à des séquences voisines d'ADN, peuvent donner naissance(s) à de nouveaux gènes et créent de nouvelles perspectives dans l'histoire évolutive de chaque espèce.  [...]

Bases de données 3'UTR

Je suis interessé par la création d'une base de de données ne contenant que les régions 3'UTR des ARNms, j'avais pensé récuperer sur ncbi les séquences d'ARNm au format genbank puis faire un parser récupérant au niveau des features les valeurs de 3'UTR.  [...] Merci pour le lien mais j'avais déjà pu lire cet article, et le fait qu'ils se limitent à quelques organismes avait motivé on choix de créer une base de données moi-mêmeà partir de séquences du ncbi. que faire.  [...]

[Biologie Moléculaire] Lecture Sequence ADN et WB

- Première question. si on considère que la première base du premier codon est A, on a alors. ACT TTC TAG et ACT TCT AGX (où X est A, G, T ou C). Dans la première séquence TAG est un codon stop, dans la deuxième séquence, le dernier codon commence par AG et aucun codon stop ne commence par AG donc il n'y en a pas.  [...] Dans la pratique on ne s'embête pas on va sur une base de données où figurent les séquences des ARNm matures.  [...]

L'ancêtre des eucaryotes est une archée originale

Des arbres phylogénétiques d'archées ont pu être construits par les chercheurs de l'université d'Oxford grâce aux bases de données de séquences d'ADN génomiques. Proceedings of the Royal Society B.  [...] Le fait que les eucaryotes proviennent de cette archée semble compréhensible. ils vivent dans les mêmes conditions de température et ils possèdent des caractéristiques génétiques similaires, notamment dans leur moyen de répliquer l'ADN. Donc d'après ces nouvelles données, les eucaryotes et les archées ne descendraient pas d'une même bactérie.  [...]

Vers un diagnostic prénatal fiable et sans risques des trisomies ?

La preuve de la présence d' ADN foetal dans le sang maternel avait permis aux scientifiques d'imaginer de nouvelles méthodes. Ainsi, il avait récemment pu être montré qu'une simple prise de sang de la future mère pouvait permettre d'identifier spécifiquement l' ADN foetal et de le séquencer dans son intégralité.  [...] Cette technique permet d'extraire certaines séquences d'ADN à l'aide d' anticorps spécifiques, comme ici, avec des anticorps qui ciblent la 5-méthylcytidine (la base azotée cytidine qui porte la méthylation ), et qui permettent donc d'enrichir l'échantillon en ADN foetal.  [...]

[Divers] Bioinformatique: Banques/Bases/Centre de resssource

Une banque de données peut être séquences protéiques, peut être séquences nucléotidiques, peut être Eucaryotes, peut être uniquement Drosphile,... autant de banques de données que de données.  [...] Donc, je peux avoir plusieurs bases de données, en fait ce sont des ensembles de données tout court. alors que dans une banque j'aurai des thèmes. Donc, si j'ai plusieurs banques, je peux créer une base. C'est en tout cas que cela m'a été présenté, si je me trompe qu'on me corrige.  [...]

sequence de géne

Il existe des bases de données de séquences ADN qui sont en ligne et libre d'accès. Elles collaborent de sorte que toutes les séquences peuvent se retrouver, notamment au lien suivant http.//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ puis faire la requête dans le champ nucleotide du menu déroulant.  [...] Je conseille la recherche avancée car il y a probablement beaucoup de séquences différentes de ce gène donc il faudra préciser l'organisme etc.  [...]