• Santé - Séquences, Acides aminés, Données

[Divers] La Vie sous une forme différente, dans des conditions différentes?

.. Avec le progrès du séquençage (qui a reçu un coup de fouet grâce au projet Génome Humain) de ces génomes, on parvient à extraire de façon automatique ou semi-automatique (dépendant des bases de données), des séquences d'acides aminés correspondants à des protéines (séquences vérifiées par la suite).  [...] En date du 3 décembre 2012, on connaissait la séquence d'acides aminés de 18877226 protéines différentes (voir les données Uniprot de la PDB). De ces ~19 millions de protéines, seules 538585 ont été vérifiées expérimentalement (voir base de données UniProtKB ).  [...]

[Biochimie] Conformation préférentielle des acides aminés ??

Voilà j'ai pas très bien commpris à quoi correspondait au niveau des conformations préférentielles des acides aminés. Chou et Fasman.  [...] Pour cela ils ont tout d'abord analyser des structures 3D de protéines déterminer par cristallographie des rayons X. Ces structures sont stockées sur une banque de données la PDB (Protein Data Bank). Ils ont observés (analyse statistique) que certaines séquences en acides aminés allaient données préferentiellement des Helices alpha, des brins/feuillets béta ou des coudes.  [...]

ATPsynthétase source d'energie et de surchauffe cerébrale =)

J'aimerais bien trouver la séquence en acides aminées (ou en nucléotides) de la sous unité C de la partie F0 de l'ATPsynthétase (d'E.coli par exemple), mais je ne sais pas comment m'y prendre.  [...] Je me suis dejà dirigé vers la base de données PBD mais je ne connais pas encore tout ses travers, penser vous que si je trouve la séquence nucléotidique ou en acides aminés de la sous unité C, je pourrais la comparer à la base de données afin de trouver des homologies avec d'autres molécule susceptibles de pouvoir protoniser elles-aussi.  [...]

[Biochimie] Format pdb

Voilà lors de ma dernière requète, je me suis peut être un peu mal exprimée. Je possède une séquene en acides aminés (non répertoriée dans les banques de données) et je souhait générer le format PDB. Quequ'un peut m'aider.  [...] Les méthodes de prédiction de structure portent bien leur nom. Ce sont des prédictions, généralement aussi fiables que l'oracle de delphes en plein délire hallucinatoire (j'exagère volontairement). Si une protéine dont la structure a été résolue expérimentalement se trouve aussi avoir une forte identité de séquence (.  [...]

Telomere et telomerase

Ils permettent de protéger notre adn car a chaque division cellulaire quelques acides aminés aux extrémités de nos chromosomes sont perdu.  [...] Il y a une grosse erreur pour commencer. Les télomères sont bien des séquences répétitives non codantes mais elles ne sont pas composées d'acides aminés. Ce sont des séquences d'ADN puisque localisées aux extrémités des chromosomes, ce sont des séquences de désoxyribonucléotides (une base azotée, un sucre le désoxyribose ici et un phosphate pour donner le nucléotide complet).  [...]

gène et synthèse des enzymes

Le code génétique donne la correspondance. à chacun des acides aminés correspondent plusieurs séquences de trois nucléotides bien connus.  [...] - En plus de une succession de nucléotides et une succession d'acides aminés, tu peux dire à la suite de chacun pour préciser que tu as compris. formant une séquence génétique et formant une séquence peptidique.  [...]

Epitope/paratope

Voilà j'ai une question lié à un exercice de biochimie sur les acides aminés, & on me parle de la chromatographie d'affinité par anticorps. On me donne la séquence de l'épitope, & je dois en déduire, avec certaines données, quelle est la séquence des AA du paratope.  [...] J'ai tout trouvé, sauf celui étant en C-Term. J'aimerai savoir, y a-t-il une relation de séquence entre l'épitope et le paratope.  [...]

[évolution] Théorie de l'évolution?? vrai ou faux... - Page 6

Les séquences d'acides aminés possibles sont d'un nombre infiniment vaste (comme celui des séquences de lettres pour former des mots, des phrases, etc). Les séquences obéissant à des restrictions particulières qui peuvent être définies, à l'instar des règles de grammaire, sont donc nécessairement d'une très grande rareté.  [...] Une séquence donnée de 10 acides aminés seulement n'intervient par hasard que dans une protéine de taille moyenne sur 10puissance(13) environ. une séquence donnée de 20 acides aminés, dans une protéine sur 10puissance(26). et une séquence donnée de 30 acides aminés, dans une protéine sur 10puissance(39).  [...]

Scepticisme et théorie de l'Evolution - Page 4

il est aisé de trouver des différences morphologiques entre les coelacanthes d'aujourd'hui et les deux espèces actuelles, par exemple dans la structure des nageoires, sans compter toutes les modifications internes, anatomiques et physiologiques. Idem avec les requins, qui ont en fait beaucoup changé depuis leur apparition, contrairement à l'idée répandue.   [...] Un autre exemple au hasard (mais on pourrait donner comme exemple tout l'arbre phylogénétique du vivant, parce que c'est toujours la même histoire qui se répéte). le clade des cténosquamates se diversifient, et toutes les lignées sont des variations plus ou moins poussées sur le même thème (microécolution), elle varie sans sortir du clade, seulement deux lignées arrivent à évoluer au point de développer des véritables innovations (caractères dérivés propres) pour fonder (macroévolution) d'un côté les myctophiformes dans une lignées et les acanthomorphes dans une l'autres lignée.  [...]

[Biologie Cellulaire] Devoir Maison SVT

Grâce au document 3, tu peux aussi expliquer pourquoi la protéine chez l'individu malade ne comporte que 80 acides aminés au lieu de 215. étudie bien le morceau de séquence qui t'est proposé, tu devrais y remarquer quelquechose en comparant les deux séquences chez l'individu sain et chez l'individu malade.  [...] Tu connais le code génétique, je crois Pense au code génétique, traduits les séquences chez le sain et chez le malade en acides aminés et tu auras la réponse.  [...]