• Santé - Séquence, Séquençage, Méthode

séquençage de l'ADN

J'aimerais savoir comment faire pour connaitre la séquence de l'amorce pour le séquençage d'un gène en utilisant la méthode de sanger.  [...] 2°) Si on sait quel gène on veut séquencer, on va par exemple rechercher dans des bases de données (NCBI notamment) les séquences en amont et en aval de ce gène.  [...]

Séquençage de l'ADN

J'étudie actuellement les méthodes de séquençage et de détections de mutations dans l'ADN. Dans la méthode de séquençage par incorporation de didésoxyribonucléotides fluorescents (méthode avec la Taq polymérase), le signal qui signifie une hétérozygotie est lorsque deux nucléotides différents sont incorporés au même endroit (donc que la séquence s'arrête au même endroit mais avec deux didésoxyribonucléotides différents pour chacun des deux brins d'ADN dénaturés du départ) et ceci est synonyme de mutation.  [...] Je comprends bien qu'un mésappariemment est synonyme d'une mutation car il est anormal mais alors que signifie être hétérozygote pour un gène On peut très bien avoir dans notre génome, deux exemplaires différents d'un même gêne sans pour autant qu'il s'agisse de mésappariemments non Je ne comprends plus bien.   [...]

Le chromosome X renferme des clés de la masculinité

Image d'un caryotype réalisée avec la technique FISH ( Fluorescent In-Situ Hybridization ) qui permet de colorer les chromosomes en fonction de leur séquence grâce à des sondes fluorescentes. Les humains possèdent 22 paires d'autosomes et une paire de chromosomes sexuels, XX chez les femmes et XY chez les hommes. Steven M. Carr.  [...] Pour tester cette théorie, les auteurs ont utilisé une technologie performante de séquençage appelée Single Haplotype Iterative Mapping and Sequencing (SHIMS) mise au point précédemment pour étudier la séquence du chromosome Y. Grâce à cette méthode, ils ont pu préciser la séquence du chromosome X humain et identifier de nouveaux motifs génétiques.  [...]

[Biologie Moléculaire] Sequençage amorce

Ma question porte sur le sequençage j'aimerai savoir quel était la methode pour bien choisir l'amorce dans une sequence je m'explique.  [...] Pour une PCR il faut 2 amorces l'une sens l'une antisens, mais qu'en est-t'il pour le sequençage Faut-il une sequence complémentaire, sens.  [...]

Code génétique

Pour le séquençage par la méthode de Sanger je ne comprends quand on prend par exemple le ddGTP pour trouver combien on obtient de fragment, on doit couper à chaque fois qu'on rencontre un G dans la séquence.  [...] Juste pour apporter une précision. C'est que le codon initiateur (AUG) n'est pas n'importe quelle codon AUG. L'initiateur est toujours a l'interieur d'une séquence consensus qu'on appelle séquence de Kozac.  [...]

Stockages par L'ADN

Les chercheurs sont ainsi parvenus à mettre au point une méthode pour inscrire un code binaire sur un polymère synthétique. Plutôt que de se servir des quatre bases azotées de l'ADN, les chercheurs ont utilisé trois monomères. Deux de ces monomères représentent les chiffres 0 et 1 du langage binaire et peuvent être utilisés de manière interchangeable au cours de la synthèse.  [...] Un troisième monomère de type nitroxide est intercalé entre les bits afin de faciliter l'écriture et la lecture de la séquence codée, détaille un document diffusé par le CNRS. Ils ont également développé une méthode de lecture qui s'inspire des méthodes de séquençage du génome.  [...]

[Biologie Moléculaire] Pcr-sbt

Le séquençage des gènes est amplifie par PCR. Le SBT, de la PCR-SBT (Sequence-Based Typing), permet l'identification précise de tous les nucléotides de la région d'ADN amplifiée.  [...] Concernant la PCR-SBT, j'en ai rarement entendu parler. Le peu que je sais a été dit par Heloradana. c'est une méthode d'amplification classique qui permet en plus un séquençage de la séquence nucléotidique.  [...]

[Biochimie] Séquençage par méthode de Sanger à partir d'une PCR

J'ai un cours sur le séquençage de l'ADN, et on nous y décrit notamment la méthode de Sanger. Seulement un élément du cours, non expliqué, me fait bloquer.  [...] Un ADNc comme on dit, s'obtient à partir d'un ARNm qui est retrotranscrit. On a donc un ADN qui correspond à une séquence codante dépourvue d'introns.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage et métabarcoding

Ce que je ne comprends pas, c'est que ces techniques ne me semblent pas adapté pour ce que je veux faire, puisque j'ai vu (sauf erreur) que la longueur maximale pouvant être séquencée est 700pb (avec le pyroséquençage). Hors, avec de tels marqueurs, j'ai besoin de séquencer de plus longs fragments, existe-t-il d'autres méthodes de séquençage ou celles que j'ai cité peuvent le faire.  [...] Ce qui est certain, c'est qu'à l'heure actuelle, le pyro séquençage est la méthode de séquençage qui produit les reads les plus longs (même si on ne peut pas parler de reads à proprement parler, puisqu'on ne séquence qu'un seul produit de PCR par cette méthode).  [...]

[Génétique] Sequençage d'ADN

Chaque paquet est séquencé en parallèle (la moitié des fragments de chaque paquet plus précisément). Les fragments d'un paquet insérent tous le même dNTP (du moins dans une certaine limite, dépendemment de la longeur des fragments). Pour chaque dNTP, une couleur est associée.  [...] Ensuite, le fluorophore est clivé et une nouvelle base est ajoutée, etc... jusqu'à avoir synthétisé tout le brin complémentaire de chaque fragment. Pour chaque paquet, tu auras une séquence de couleur. bleu-vert-jaune-jaune-rouge..., qui sera transformée en séquence nucléotidique GCTTA.  [...]