• Santé - Séquence, Protéine, Promoteur

[Biologie Cellulaire] Fusion transcriptionnelle et traductionnelle

La fusion traductionnelle consiste en la fabrication d'une protéine hybride, c'est-à-dire que tu as la construction génétique suivante [promoteur du gène d'intérêt]-[5'UTR]-ATG-séquence codante 1-séquence codante 2-STOP-[3'UTR et terminateur de transcription].  [...] Maintenant si tu veux non plus localiser une protéine d'intérêt mais quantifier l'activité d'un promoteur donné entre plusieurs conditions, tu peux construire quelque chose comme [promoteur d'un gène d'intérêt]-[5'UTR]-ATG-séquence codante d'un gène rapporteur-STOP-[3'UTR et terminateur de transcription].  [...]

[Biologie Moléculaire] Régulation de la transcription

En clair, tu as un gène qui code pour une protéine. Dans ce gène tu a la séquence codante (qui donnera par la suite la séquence d'acide aminé (protéine)) et juste avant le promoteur.  [...] Le HRE est une séquence dans le promoteur qui va fixer l'hormone (surement par l'intermédiaire d'une protéine pas directement) et va activer la transcription du gène.  [...]

Projet de recherche

Savez vous comment s'y prendre pour faire une perte de fonction spatio-temporelle. Spatio-temporelle car la fonction de la proteine etudier est indispensable a la viabilité du poisson zebre lors du developement.  [...] J'ai pensé a un système UAS-GAL4 en se servant d'une CRE recombinase sous un promoteur Heat chock. La séquence sous le promoteur de UAS etant un RNAi contre la proteine dont je veux son Ko.  [...]

[Biologie Moléculaire] Disponibilité ARNt procaryotes

J'ai muté la séquence codante d'un gène bactérien mais de façon silencieuse afin d'en conserver la séquence en acides aminés. Je teste maintenant l'activité de la protéine codée par le gène sauvage ou le gène muté en la surexprimant par le promoteur inductible PBAD.  [...] En gros, Yoyo voulait te mettre en garde contre le fait que les mutations silencieuses peuvent te faire introduire plein de codons rares, c'est ça Donc, quelle conséquence directe Moins de protéine, plus difficilement produite,  [...]

[Biologie Moléculaire] Introns et régulation

Les introns sont des séquences non codantes à l'interieur d'un gène, il existe cependant des séquences non codantes extragéniques. Donc est-ce que toutes les séquences non codandes entre intergéniques interviennent dans la régulation et pour ceux qui le sont régulent-ils tous en tans que séquence (cis) est-ce que toutes les séquences régulateurs qui agissent par l'intermédiaire d'une protéine régulatrices sont des gènes (avec un promoteur terminateurs introns exons.  [...] Tout d'abord, non, toutes les séquences non codantes extragéniques n'interviennent pas dans la régulation (ex. les minisatellites). Il en existe cependant qui interviennent dans la régulation de façon cis. pour faire très simple, imagine qu'elles ont une séquence particulière à laquelle une protéine A pourrait se lier, et celle ci se lierait à une protéine B elle même liée au niveau du promoteur.  [...]

[Biotechnologie] Induction vs. expression

Par exemple, tu va avoir une séquence avec un promoteur inductible, qui une fois activé induira l'expression de la protéine en amont de la séquence.  [...] Donc, si je comprends, tu as un plasmide recombiné provenant de pET. Le mieux ce serait que tu regardes les différentes cartes de plasmides et que tu dessines une carte de ton plasmide recombiné avec les promoteurs et que tu schématises les différentes interactions dans ta bactos d'expression.  [...]

[Biochimie] Expression protéique

Le fait que l'ARNm soit présent n'indique pas grand chose, sauf qu'effectivement ton promoteur fonctionne correctement. Il se peut que ta séquence soit mutée conduisant a un mauvais repliement et à l'élimination de la protéine avant même sa mise en fonction. As tu séquencé ta séquence d'adn.  [...] sinon, avoir un messager de donne pas toujours de protéine. Il faut des régions régulatrices et pas uniquement la séquence codante.  [...]

[Biologie Moléculaire] Vecteurs de clonage

Vous désirez produire cette protéine dans les bactéries afin de pouvoir étudier ses propriétés en laboratoire. Lequel des types de vecteurs suivants choisirez-vous.  [...] Vous devez pouvoir produire la protéine, ce qui signifie que la séquence codante va être transcrite et traduite. Le traduction va s'opérer grâce à la machinerie bactérienne, pas de souci. En revanche, la transcription va nécessiter la présence d'un promoteur sur le vecteur, c'est la première chose que vous devez chercher.  [...]

[Biologie Moléculaire] terminateur rrnb vecteur pMAL

Je viens de cloner mon gène dans un vecteur pMAL pour produire la protéine en système bactérien. Le gène est sous promoteur tac qui permet l'induction par l'iptg, mais du côté C-terminal après la séquence il y a deux régions terminatrices rrnB, que je n'avait jamais vu sur les vecteurs de type pET par exemple.  [...] Quel est l'interêt de ces séquences, pourquoi avoir choisi rrnB et pourquoi 2 régions terminatrices et non une seule.  [...]

Organisation de l'information (génétique)

Un cistron donne une protéine. Plusieurs cistrons donnent plusieurs protéines. Mais plusieurs cistrons peuvent être sous le contrôle d'une même séquence promotrice (la séquence promotrice est obligatoire) et d'une éventuelle séquence régulatrice.  [...] Mais je pense que l'efficacité du processus (faire un grand nombre de protéines à partir d'un petit nombre d'événement de fixation au promoteur) est une idée qui se cache derriere l'économie de séquence... Plus de cistron = amplification.  [...]