• Santé - Séquence, Génome, Souche

[Biologie Moléculaire] Technique pour obtenir des amorces souche spécifique sans séquence du génome

Or pour cela je dois tout d'abord déterminer des amorces spécifiques de mes souches, le problème est que les génomes de mes bactéries n'ont jamais été séquencés à ce jour et il n'est pas prévu car trop cher.  [...] Si tu cibles un gène très bien conservé chez d'autres souches bactériennes, tu peux designer tes amorces sur un consensus (à partir des leur séquences).  [...]

Petit projet boinformatique

J'ai un exercice à résoudre et à rendre la semaine prochaine, et je ne sais pas par où commencer.   [...] La séquence nucléotidique du génome d'une souche a été publiée. Vous êtes invités à replacer le fragment de la séquence nucléotidique dont GI= 18478298 déposée dans GenBank dans le génome séquencé, et lui faire une sortie graphique.  [...]

[Microbiologie] séquençage de génome bacterien

j'ai lu dans des articles scientifiques,que la localisation chromosomique d'un gène de résistance chez une bactérie doit être confirmé par un sequençage complet de génome de cette souche. Pourrai-je savoir pourquoi \comment je pourrais savoir sa localisation à l'aide de la séquence complété de gènome de cette souche.  [...] Ben a partir du moment ou tu as une liste de tous les gènes, il devient possible d'identifier celui qui est à l'origine de la résistance.   [...]

Les cas très graves de grippe s'expliqueraient par la génétique

Pourquoi la grippe, bénigne chez la plupart des humains, peut-elle devenir gravissime chez d'autres Pour le savoir, des chercheurs ont intégralement séquencé le génome d'une fillette atteinte d'une forme sévère de grippe à l'âge de deux ans et demi. Résultat.  [...] Pour tester cette hypothèse, ils ont séquencé le génome entier d'une enfant de sept ans ayant contracté une forme très sévère de grippe (souche A(H1N1)) nécessitant son hospitalisation en service de réanimation pédiatrique en janvier 2011 à l'âge de deux ans et demi.  [...]

[Biochimie] Quelques questions sur les OGM

-Si tu veux faire exprimer une protéine exogène, par exemple une enzyme qui permet a une bestiole de résister a une toxine, tu insères le gène codant pour ton enzyme dans le génome de la bestiole, permettant ainsi à la protéine d'étre produite par l'individu.  [...] Les techniques sont assez complexes mais on a recours a des techniques de recombinaison homologue dans des cellules souche. La recombinaison homologue permet d'insérer dans le génome un morceau d'ADN qui contiendra la séquence qu'on veut intégrer. Si on ne veut pas forcément contrôler le lieu d'insertion du gène, on peut utiliser un vecteur qui integrera la séquence n'importe ou dans l'ADN (un virus par exemple).  [...]

Définition | Listériose | Futura Santé

Les symptômes sont variés, de l' infestation digestive à la septicémie, jusqu'à des méningoencéphalites. Les conséquences peuvent être mortelles, en particulier pour les personnes âgées, les femmes enceintes, les personnes immunodéprimées.  [...] Des analyses bactériologiques permettent de déterminer si les infections sont dues à des microorganismes provenant d'une même souche, c'est-à-dire issues des divisions d'une même bactérie. Le génome de la Listeria a été séquencé début 2000, ce qui devrait permettre d'effectuer des diagnostics plus rapides de la maladie et d'identifier plus rapidement les aliments responsables d'épidémies.  [...]

Séquençage haut débit d'E. coli : vers une médecine personnalisée

Le séquençage haut-débit du génome de la souche O157 d' Escherichia coli, en cause dans le syndrome hémolytique et urémique des enfants hospitalisés au CHRU de Lille, a été réalisé en trois jours à l'institut Pasteur de Lille.  [...] Moins de trois jours ont suffi aux équipes de la plateforme de Transcriptomique et Génomique Appliquée de l' institut Pasteur de Lille et de l'équipe R&D génomique de Gènes Diffusion pour séquencer le génome complet de la souche O157 d' E. coli. C'est dix fois plus rapide qu'avec une méthode classique.  [...]

[Microbiologie] génome-gène de résistance

j'ai travaillé sur la souche de Plesiomonas dans mon stage de mastère,j'ai cherché la localisation de gène de résistance aux betalactamines dans le gènome. Dans la partie discussion (dans la rédaction) je dois discuté un travaille qui a été fait par une équipe,qui ont réalisé un séquençage de génome entier d'une souche de Plesiomonas (serotype O1) et pourtant ils n'ont pas pu déterminer la localisation de gene.  [...] Quand, je lis le lien que tu m'as donné je ne vois écris nulle part qu'il n'ont pas réussi à localiser le gène de résistance aux béta-lactamines. Ils disent juste qu'ils ont séquencé entièrement le génome. J'ai trouvé ceci sur UniProt ( http.//www.uniprot.  [...]

Haïti : l'épidémie de choléra proviendrait bien d'Asie

L'épidémie de choléra qui sévit en Haïti serait bien originaire d'Asie, d'après les données issues du séquençage du génome de la souche bactérienne impliquée. Ces résultats redonnent du crédit aux rumeurs qui supposaient l'import du vibrion cholérique par des soldats népalais.  [...] Le choléra, toxi-infection intestinale due au vibrion cholérique, se transmet par la consommation d'eau ou d'aliments contaminés. Et plus rarement, par contact direct avec un malade. La maladie se manifeste par des diarrhées intenses. En l'absence de prise en charge adéquate, celles-ci peuvent provoquer la déshydratation du patient.   [...]

Grippe Mexicaine (grippe A-H1N1), vos questions. - Page 5

En effet, comme cela a été mentionné dans ce fil, le génome a été séquencé et les origines des différents fragments ont été retrouvées (et elles existent depuis... longtemps), l'historique (ainsi que les zones géographiques concernées) des mutations ayant abouti a cette dernière souche également été mis en évidence.  [...] Donc par le passé (disons 10 ans), si j'en déduit bien, quand les labo développaient (et développent) un vaccin avec une suspicion de présence de telle ou telle souche pour la période froide qui arrivait, ils avaient des chances de renforcer des souches mal ciblées que l'on pouvait (ou peut) attraper par la suite.  [...]