• Santé - Séquence, Génome, Organisme

[Biologie Moléculaire] Démonstration de la colocalisation génomique de deux paralogues

Je souhaite démontrer que deux gènes paralogues sont colocalisés dans la même région génomique chez un organisme (dont le génome n'est pas séquencé, une plante supérieure).  [...] Comment puis-je procéder, sachant que je dispose uniquement des séquences nucléotidiques de ces gènes (ADNc obtenus par rétrotranscription d'ARN), d'une banque de ADNc et d'ADN génomique.  [...]

[Biotechnologie] contamination echantillon adn

Je pense que c'est possible de détecter un mélange d'ADN mais que la méthode pour y parvenir dépend de la proximité entre les organismes suspectés et aussi du fait que leur génome a été séquencé ou pas. Là tu parles d'un organisme inconnu (qui n'existe pas) donc il n'y a pas de génome de référence.  [...] Il faudrait voir quelle est la fiabilité d'une identification (ou non identification ici) d'un poil à partir de sa morphologie. Existe-t-il une base de donnée de photos de poils des 5000 espèces de mammifères sans parler des nombreuses races artificielles puisqu'on parle de cheval. Ca n'est pas certain.   [...]

[Biochimie] pseudogènes

Comment le reconnait-on Alors admettons que tu connaisses la séquence d'un gène codant pour une protéine connue. admettons, l'albumine. Si tu recherches cette même séquence ailleurs dans le génome de l'organisme considéré (c'est-à-dire que tu procèdes à un alignement) et que tu la retrouves mais avec des mutations, il est possible que ce soit un pseudogène.  [...] Attention aussi concernant le terme intron. D'après ta réponse, je ne suis pas sûre que tu aies bien compris ce que c'est (d'après cette phrase. si on retrouve des introns dans ce gène alors il n'aura pas été trancrit ). Une séquence intronique d'un gène est transcrite.  [...]

[Biologie Moléculaire] Passer par le double hybride ?

Je vais à la pêche d'une sous-unité (gamma) d'un complexe hétérotrimérique. Le hic, c'est qu'il n'y a rien dans les banques d'EST, et que chez d'autres espèces il n'y a pas de zones suffisamment concernés (3/4 a.a par ci par là). Cette sous-unité a déjà été trouvé chez d'autres modèles par double-hybride (en se servant de la sous-unité Beta comme hameçon) ou ils avaient déjà les séquences (génome séquencé).  [...] Enfin si, dès qu'on tombera à quelques milliers de dollars pour séquencer n'importe quelle organisme, alors là il y aura une petite chance.  [...]

Définition | Vaccinologie inverse | Futura Santé

Grâce à la génomique, les scientifiques sont parvenus à pénétrer la séquence génétique complète de plus de 300 espèces bactériennes. Aujourd'hui, pour la fabrication d'un vaccin, les chercheurs s'appuient donc sur la connaissance du génome du micro-organisme pour repérer les gènes susceptibles d'être utilisés.  [...] A contrario, la méthode classique d'élaboration de vaccin consiste à partir du micro-organisme pathogène lui-même, cultivé en laboratoire pour obtenir un nombre restreint d'antigènes. Le processus est alors beaucoup plus long, car les antigènes obtenus doivent ensuite être soumis à des tests pour déterminer leur pouvoir immunigène.  [...]

Une bactérie créée de main d'Homme... et minimaliste

En 1995, l'équipe de Venter a séquencé le génome de Mycoplasma genitalium, une bactérie sexuellement transmissible qui possède le plus petit génome connu pour un organisme capable de vivre seul. 580 kilobases (kb), avec 470 gènes codant pour des protéines.  [...] Malgré la taille réduite du génome de M. genitalium, des expériences ont montré qu'elle contient des gènes qui ne sont pas essentiels à sa croissance au laboratoire. il serait donc possible de produire un organisme encore plus simple.  [...]

[Divers] Identification d'organismes par biais d'usage du code

En fait l'idée était de trouver une base de donnée recensant le %GC et le biais d'usage de codons de nombreux organismes. Je voulais juste comparer les résultats de ces deux caractéristiques obtenus pour ma sequence avec ceux de la base de donnée pour essayer d'avoir une idée de l'organisme original (car on sait que ce transposon est apparu avant qu'il envahisse le génome des primates).  [...] Oui et la séquence n'est retrouvée que chez quelques autres mammifères (souris, bovins, ovins...). J'aurais peut être ma réponse quand plus de génomes auront été séquencés.  [...]

L'existence du Yéti prouvée de manière "irréfutable" ! - Page 2

A des détails près, toutes les cellules de l'organisme partagent le même génome et on ne peut donc déterminer le type d'une cellule à partir de sa séquence génomique.  [...] Il est possible d'aller plus loin avec un peu de chance. les virus à intégrase peuvent avoir laissé des traces de leur passage dans le génome et comme ceux-ci sont spécifiques de certains types cellulaires, la présence d'ADN viral permet de réduire les possibilités.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquences répétées inversées

Si on veux invalider un gène ATTCC par exemple contenu dans un gènome, on transforme le microorganisme par un vecteur contenant la séquence ATTCCCCTTA (soit la séquence du gène à invalider et la séquence du gène mais inverser).  [...] Je suis d'accord avec le fait que la séquence finale n'a plus rien a voir avec celle d'origine. Mais pourquoi utilisé la même séquence de manière inversée On peut supposer qu'une mutation ponctuelle suffisent à invalider le gène contenu dans le génome. C'est le fait d'utiliser la même séquence mais de manière inversée qui me pose problème.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage d'un gène

Oui mais comment il sait que cette sequence va bien s'hybrider au bon endroit si le génome où se trouve le gène n'a jamais été séquencé.  [...] Je peux aussi poser ma question autrement. comment on fait les personnes qui ont séquencé le premier génome, et donc qui ne connaissaient aucune séquence sur ce dernier.  [...]