• Santé - Séquence, Enzyme, Niveau, Sites, Restrictions

[Biochimie] Rechercher sites de restriction

Déjà connais-tu des programmes online permettant de trouver les sites des enzymes de restriction connues sur une séquence donnée Quelle peut être l'utilité du programme que tu décris, s'il existe (ce qui m'étonnerait beaucoup).  [...] J'ai trouvé le programme dans lequel j'entre une sequence et je choisis une enzyme puis je récupère ma sequence avec des espaces aux niveau des sites de restrictions correspondant a l'enzyme choisie.  [...]

Clivage par TaqI et HhaI

Si 2 sites de restrictions sont successifs, alors l'enzyme de restriction ne va pouvoir cliver qu'un site (au hasard..) entre les 2.  [...] Je souhaiterai savoir quel est l'intervalle min entre 2 sites de restrictions pour que l'enzyme coupe au niveau des 2 sites.  [...]

TP biochimie: introduction aux méthodes utilisées en génie génétique

Après pour la carte plasmidique si tu sais par quelle enzyme tu fragmentes tes séquences je penses que tu peux retrouver la taille des fragments. Car si la carte plasmidique est comme une carte de génome généralement tu as des sites de restrictions dessus.  [...] ok alors sur tes 3 plasmides tu as un ou plusieurs sites de restriction à EcoRI c'est un site que va reconnaître ton enzyme EcoRI et va donc couper ton ADN plasmidique à cette endroit précisément. Tu connais la taille de tes plasmides en pb et tu sais sur quel pb se situe le site de restriction.  [...]

[Biologie Moléculaire] TP digestion ADN par enzymes de restriction par électrophorèse sur gel d'agarose

J'ai fais une extraction d'ADN puis je l'ai mis en présence d'enzyme de restriction ( c'est le TP basique avec les enzymes BamHI, EcoRI, HindIII) c'est de l'ADN de phage lambda cependant comment savoir si l'ADN a été digéré par élélectrophorèse sur gel d'agarose car j'observe plusieurs fragments mais je comprends pas trop si quelqu'un peut m'éclairer merci infiniment.  [...] Et ensuite en comparant les profils de restrictions de chaque enzyme et des combinaisons de plusieurs enzyme tu peux déduire comment les sites de restrictions se trouvent les uns par rapport aux autres sur ton ADN de phage du départ.  [...]

[Biologie Moléculaire] Clonage avec plasmide

Les sites de restrictions sont en fait des séquences consensus dites palindromiques qui sont donc identiques dans le sens 3'-5' et 5'-3'. Ces séquences soont reconnues par des enzymes particulières très souvent d'origine bactériennes (EcoR1, EcoR5, BamH1...).  [...] 1. identifier votre fragment (si l'organisme a déjà été séquencé, voir la carte de restriction et repérer les sites de restrictions absents du fragment).  [...]

HOMME ARAIGNÉE POSSIBLE??!! Débats

Il faut déjà identifié le gène qui permet à l'araignée de produire de la soie puis l'isolé grâce a des enzymes de restrictions ( qu'il faut trouvé ) mais encore pire il faut déjà trouvé des séquences de reconnaissance ou spécifique qu'on appel palindrome pour que l'enzyme de restriction identifie le gène a clivé, au niveau de l'Homme on connait pas mal d'enzyme de restriction de type endonucléase de type 2 donc ça pourrait aller mais pour l'arraigner je pense pas.  [...] Azaar. tout est mélangé, c'est un peu le bazar dans cette réponse qui ne fait pas avancer le débat. Les enzymes de restriction c'est loin d'être un problème ici.  [...]

[Biologie Moléculaire] Problèmes: Recombinaison d'un plasmide

Si il n'y a pas de site de restriction utilisable encadrant ton gène, il va falloir en ajouter. On va donc ajouter 2 sites de restrictions différents de chaque côté de ton gène. Note que pour l'énoncé 1 tu peux utiliser 2 fois la même séquence de restriction car comme tu as déjà ton promoteur le sens d'insertion du gène n'a pas d'importance.  [...] Oui c'est ça. Par convention on utilise N pour signifier que cela peut-être n'importe quelle base. Ici j'ai mis 4N à côté des sites de restrictions mais cela peut varier suivant l'enzyme que tu utilises. Dans ton cas, ce n'est pas important je pense.  [...]

Déchiffrage d'une carte de plasmide

Les 2 lignes au dessus du plasmide correspondent aux différents sites de restrictions (éventuellement pour cloner une séquence dans ces poly-linker).  [...] La séquence de polyadénylation BGH est située juste derrière les sites de restriction ce qui permettra à ta séquence insérée de recevoir une queue polyA et tu obtiendra un ARNm fonctionnel (=traductible en protéine).  [...]

[Biologie Moléculaire] Clonage - Page 2

donc l'objectif etait de faire une amorce sens a gauche en inserant un site de restriction une amorce qui est vers le MCS mais là elle permet d'apporter 2 sites de restrictions et de l'autre coté faire une amorce sens a droite en inserant un site unique (les deux inserts ont donc a leurs extremités un site unie et au milieu au refait un MCS) et de meme son amorce complémentaire est vers le MCS et permet d'inserer 2 nouveaux sites de restrictions.  [...] je suis bien d'accord, mais ces sites vont etre au niveau des morceaux de genes aux extremités que je ne veux pas donc certes apres restrictions ils seront amputés et donc pas fonctionnel mais il y aura toujours des morceaux donc c'est pas très propre, les deux sites uniques que j'ai mis juste pour cadrer la sequences que je veux ont ce role, d'eviter d'avoir les parties aux exterieurs.  [...]

[Biologie Moléculaire] Programme de clonage

Par exemple, tu veux faire un cloner une séquence que tu vas amplifier par PCR avec des sites de restrictions dans les primers pour l'insérer dans le vecteur cible.  [...] En principe (si je n'ai rien oublié) toutes les fonctions sont accessibles dans le menu général (sous les chapitres Serial Cloner, File, Edit, Sequence, Features, Restriction, Function, Window). Les plus fréquentes sont en plus disponibles en menu contextuel, en raccourci clavier et dans la barre d'outils.  [...]