• Santé - Séquence, Chromosome, Génome

Question sur le génome

Todd Taylor at the Riken Genomic Sciences Center in Yokohama, Japan, and his colleagues have read the DNA sequence of chimpanzee chromosome 22, and compared it to its human counterpart, chromosome 21. Although a draft sequence of the chimp genome has been available since August 2003, this is the first sequence of a whole chimp chromosome that is accurate enough for researchers to be sure that any differences between the two species are real, and not just data errors.  [...] The sequence of chromosome 22 has also whetted researchers' appetites for the full chimp genome sequence, due to be published in Nature later this year. The small section of the genome is very valuable, says Ajit Varki, a molecular biologist at the University of California, San Diego. But the whole genome will be a wonderful tool.  [...]

[Journal club] Immortalisation et Transformation d'une cellule humaine à partir d'éléments génétiques définis.

Si l'on s'amusait à faire un caryotype d'HeLa je suis sûr qu'on trouverait peut-être 100 ou 200 chromosomes avec des réarrangements dans tous les sens. C'est ce que l'on observe pour les sarcomes à génétique complexe. Le génome de certaines cellules tumorales n'a plus grand chose à voir avec un génome humain standard.  [...] A leur époque ce n'était pas possible car des banques de séquences du génome humain complètes n'existaient pas, mais actuellement le mieux serait de séquencer un côté de l'insertion en faisant une marche sur le chromosome et cribler les banques de séquences avec la séquence d'un des deux côtés flanquant l'insert.  [...]

[Biologie Moléculaire] Homoduplex / Hétéroduplex et Electrophorèse

Le patient 4 doit juste avoir la même séquence que le patient 1 sur un chromosome et une autre séquence (différente de celle du patient 2) sur le chromosome homologue, due par exemple à une mutation ponctuelle.  [...] Oui, mais alors comment savoir précisément que t'as 2 homoduplex et 2 hétéroduplex Enfin, on joue pas aux devinettes.. Donc dire, le patient 4 doit sûrement avoir la même séquence que le patient 1 sur un chromosome et une autre séquence... Enfin, tu comprends ce que je veux dire ou pas ou soit c'est moi qui n'ai pas compris.  [...]

Question idiote sur le génôme humain

Le consortium public (dirigé par Francis Collins à l'époque et relayé par Jean Wissenbach au génoscope pour la France, qui a séquencé le bras court du chromosome 14) n'a donc pas utilisé le shot gun.  [...] En fait, deux stratégies ont été développées pour le séquençage de génomes entiers. 1°) Stratégie du chromosome walking (à petits pas).  [...]

Question génome

C'est faux. Le génome, c'est l'ensemble des molécules d'ADN présentes dans une cellule. Pour l'Homme, le génome se compose donc 46 chromosomes (un chromosome est une molécule d'ADN) et de l'ADN mitochondrial.  [...] Chaque paire est numérotée (de 1 à 22, donc) et est composée d'un chromosome dont la séquence provient de la mère et d'un chromosome dont la séquence est héritée du père. La 23ème paire est celle des chromosomes sexuels. il y a un chromosome X hérité de la mère et un chromosome X ou Y hérité du père.  [...]

Pathogénicité bactérienne

Alors moi je verrai un truc dans ce genre, une bactérie vivant dans l'intestin et habituellement pas nocive deviendrait brusquement pathogène...je crois comprendre que c'est du au mutation fréquente dont sont sujettes les bactéries mais après je patauge, entre toxines et tout le reste.   [...] - il existe des ilôts de pathogénicité qui correspondent à un ensemble de gène de virulence présent au niveau du chromosome en un locus. Ces séquences ont un GC% différents du reste du génome.  [...]

mon grand-père est trop fort pour moi

1) le sequencage d'une éspèce consiste à déterminer sur chaque chromosome tous les lieux (loci) ou se trouvent des sequences codantes.  [...] Chez les procaryotes (mon domane de prédilection), le séquencage d'une espèce, ou plutot d'un organisme consiste à séquencer le génome entier (chromosome et plasmide(s) ).  [...]

Duplication du génome

Je viens d'apprendre qu'une hypothèse existe selon laquelle le génome se serait dupliqué entièrement plusieurs fois au cours de l'évolution... 4 fois chez les tétrapodes.  [...] cette notion de duplication a grande echelle a été l'un des grands enseignements du sequençage du génome de la levure (cerevisiae). On s'appercoit que des gènes sont dupliqués par régions entières d'un chromosome a l'autre, mais aussi que leur agencement est conservé quand on compare les génomes des différentes levures (synthénie).  [...]

Le génome humain, clé de la médecine du futur, est intégralement séquencé

Au cours de l' automne 2002, le Genoscope a achevé sa part du travail - le séquençage complet du bras long du chromosome 14 humain, long de 87 millions de bases, et l'inventaire des gènes qu'il contient -. notre analyse de cette séquence a été publiée le 1er janvier 2003 dans la revue Nature.  [...] L'essentiel reste l'engagement renouvelé des chercheurs et des organismes de financement, tout au long du projet, à ce que la séquence de notre génome, conservée à plus de 99,9 % entre deux individus quelconques sur la planète, reste un bien commun.  [...]

[Biotechnologie] séquençage à haut débit

Du fait de l'addition séquentielle de bases, lorsque les SNP ne sont pas trop éloignés les uns des autres, cette technique permet l'étude directe d'haplotypes (association de plusieurs SNP sur un même chromosome). Il s'agit de la seule technique actuelle capable de déduire un haplotype de l'analyse directe du génome.  [...] Au contraire, l'Illumina sera privilégié dans le cadre d'un gros séquençage, par exemple pour le séquençage d'un génome entier. En effet, les séquences déterminées étant bien plus longue que celles obtenues par pyroséquençage, il sera plus facile de reconstituer la séquence génomique.  [...]