• Santé - Séquence, ADN, Site

Enzyme de restriction: petite difficulté avec sa définition

une enzyme de restriction reconnait un site (=une séquence) spécifique sur l'ADN et coupe de chaque coté de ce site. Si le site est à l'extrémité d'un brin d'ADN linéaire, alors elle peut couper.  [...] Les exonucléases, ne savent que retirer des bases de manière séquentielles aux extrémités de séquences de nucléotides-phosphates.  [...]

[Biologie Moléculaire] Comment visualiser un nouveau site d'épissage?

Mais le problème, c'est que je n'ai que l'ADN du patient. J'ai la séquence de son gène GNAS et je voudrais juste, sans autre analyse biologique si l'on pouvait trouver l'apparition d'un site d'épissage.  [...] Si tu m'envoyes la sequence d'ADN je pourrais regarder si cela cree un site d'epissage altenatif. Maintenant ca ne sera qu'une prediction, et il restera a la demontrer.  [...]

Nouvelle stratégie pour la thérapie génique

Le risque entraîné par ces insertions aléatoires à été récemment mis en évidence à l'hôpital Necker (Paris), où un protocole de thérapie génique pour traiter des enfants atteints d'une maladie génétique incurable (X-SCID, aussi appelée les enfants bulles ) a été interrompue suite au développement d'une leucémie par un des enfants.   [...] La méthode est basée sur un mécanisme communément utilisé par les bactériophages ( virus infectant des bactéries ). Une enzyme, l'intégrase permet de couper et d'insérer l' ADN phagique en un point spécifique à l'intérieur de l'ADN bactérien. Pour ce faire l'enzyme reconnaît une séquence sur l'ADN phagique appelée le site donneur attB et le lie à un site spécifique sur l'ADN bactérien le site receveur attB.  [...]

cherche site séquences acides aminés

je ne trouve plus l'adresse du site qui me permettrait de trouver la séquence en acides aminés de façon automatique a partir de ma séquence ADN.  [...] Je ne connais pas de site dédié à ça, mais néanmoins je connais Anagène, un logiciel qui fait ce que tu demandes et bien plus.  [...]

Enzymes de restriction

Les enzymes de restriction sont produites à partir de bactéries, elles mettent en place un processus de dégradation d'un génome extracellulaire (ex infection par un virus, les ER de la bactérie va dégrader l'ADN viral en coupant celui-ci).  [...] Les ER sont capables de reconnaître spécifiquement une courte séquence de l'ADN, et de cliver les deux brins d'ADN au site reconnu, elles permettent de fragmenter l'ADN en segments de taille réduite en coupant à des sites définis.  [...]

exercice de génomique assez complexe..

Soit une séquence d'ADN (bicaténaire) constituée de TCTAGA, site de restriction reconnu par l' endonucléase de restriction XbaI.  [...] Quels seraient les sites de clonage susceptible d'insérer cette séquence d'ADN, parmi les site de clonages suivants, qu'on supposera présents chez un vecteur quelconque.  [...]

[Génétique] nucleaire ou mitochondrial?

si j'ai une sequence d'adn comment puis je faire la difference entre une sequence provenant d'un gene nucleaire ou d'un gene mitichondrial si je ne veut pas utiliser le site de NCBI (blast).  [...]

[Biologie Moléculaire] Sites de restrictions proches sur vecteur

Je dois cloner un cDNA dans un vecteur pET-15b (cf pièce jointe). J'ai choisi de faire un clonage orienté, ne pouvant pas utiliser NdeI qui clive mon cDNA, j'ai choisi XhoI et BamHI. Mais comme vous le voyez sur la carte du plasmide, ces deux sites sont accolés de telle façon que lorsque XhoI clive sa séquence (C/TCGAG), celle de BamHI (G/GATCC) se trouve à l'extrémité de l'ADN, avec même pas une base avant son site.  [...] Je voulais donc savoir si BamHI peut cliver son site de restriction lorsque celui ci se trouve trop à l'extrémité d'un fragment d'ADN Je précise aussi que les 6 bases de la séquence palindromique de BamHI sont bien présentes après clivage par XhoI.  [...]

[Biologie Moléculaire] Recherche site pour alignement et traduction

jusqu'à présent pour réaliser des alignements de séquences d'ADN et faire de la traduction j'utilisais le site d'infobiogen hébergé par un autre groupe depuis leur arrêt en France, ce qui était bien pour les traductions c'est que l'on pouvait avoir les 3 cadres de lectures simultanément avec en prime la séquence d'ADN.  [...] pour la traduction de tes séquences ADN il existe également ORFfinder sur le site NCBI qui va te permettre d'avoir des traductions dans les 6 cadres de lectures. Je l'ai beaucoup utilisé et il est très pratique. Sinon pour tes alignements de séquences en effet tu peux te servir de Bioedit qui est libre accès mais tu as également des outils comme Clustalw libre accès également sur internet ou ClustalX que tu peux installer en local.  [...]

[Biologie Moléculaire] Polymorphisme génétique

Vous amplifiez une séquence de 300 bases d'ADN humain qui peut contenir un polymorphisme génétique responsable de l'apparition d'un site de restriction en position 50 pour une enzyme E.  [...] Donc, si tu es homozygote pour ces allèles, cela signifiera que les deux seront identiques. Etant donné que tu ne considères qu'un site de restriction par allèle, tu auras 2 sites pour deux allèles identiques.  [...]